159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0783 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0783  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 708 aa  1436    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.285032  normal  0.0256294 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02552  TonB-dependent outer membrane Receptor  71.79 
 
 		 707 aa  1053    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.235872  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0509  TonB-dependent receptor  48.1 
 
 		 743 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.368087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0522  TonB-dependent receptor  48.1 
 
 		 727 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.569695 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0595  putative outer membrane receptor signal peptide protein  48.18 
 
 		 729 aa  610  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.426057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4373  TonB-dependent receptor  47.69 
 
 		 730 aa  603  1.0000000000000001e-171  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116704 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0900  TonB-dependent siderophore receptor  47.03 
 
 		 781 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0456364  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4595  TonB-dependent receptor  46.44 
 
 		 781 aa  587  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4871  TonB-dependent receptor  44.98 
 
 		 757 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.782925  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1456  TonB-dependent receptor  42.59 
 
 		 766 aa  533  1e-150  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.271102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3305  outer membrane insertion C-terminal signal  41.16 
 
 		 730 aa  491  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.256474  normal  0.926334 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1991  TonB-dependent receptor  23.87 
 
 		 749 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1415  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 871 aa  85.1  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810305  normal  0.0488884 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3082  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  23.66 
 
 		 730 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.25355  normal  0.407735 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4401  TonB-dependent receptor  22.57 
 
 		 923 aa  67.4  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5669  TonB-dependent receptor plug  21.24 
 
 		 789 aa  67  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0978  TonB-dependent receptor plug  23.62 
 
 		 753 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103139  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.22 
 
 		 972 aa  64.3  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  27.72 
 
 		 702 aa  62.4  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  22.47 
 
 		 993 aa  62  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3438  TonB-dependent receptor plug  20.12 
 
 		 772 aa  60.8  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2686  TonB-dependent receptor plug  30.72 
 
 		 650 aa  60.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.262602  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  23.28 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  24.43 
 
 		 656 aa  59.3  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  24.07 
 
 		 666 aa  59.3  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  23.28 
 
 		 666 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 828 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4749  TonB-dependent receptor plug  20.81 
 
 		 806 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.782569  normal  0.236895 
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  24.14 
 
 		 695 aa  57.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  22.99 
 
 		 666 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1590  TonB-dependent receptor  23.06 
 
 		 790 aa  57.4  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2398  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 966 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2062  TonB-dependent receptor  32.21 
 
 		 791 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  38.36 
 
 		 743 aa  57  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2159  TonB-dependent receptor  25.87 
 
 		 684 aa  56.2  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 757 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 699 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 709 aa  56.6  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  22.83 
 
 		 663 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  21.56 
 
 		 888 aa  55.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  23.51 
 
 		 698 aa  55.8  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  38.27 
 
 		 726 aa  55.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  22.83 
 
 		 663 aa  55.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  32.67 
 
 		 671 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  23.73 
 
 		 705 aa  55.8  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  22.83 
 
 		 663 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  22.83 
 
 		 663 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  22.83 
 
 		 663 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  22.83 
 
 		 659 aa  55.5  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0684  putative TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 701 aa  55.1  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.507206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  32.23 
 
 		 680 aa  54.7  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  24.24 
 
 		 666 aa  54.3  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  33.67 
 
 		 719 aa  54.3  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  23.92 
 
 		 650 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  23.3 
 
 		 641 aa  54.3  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 706 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0652  TonB-dependent receptor plug  21.21 
 
 		 897 aa  54.3  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.29 
 
 		 706 aa  53.9  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  24.07 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6408  TonB-dependent receptor  21.23 
 
 		 772 aa  53.9  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1227  TonB-dependent receptor plug  22.93 
 
 		 923 aa  53.5  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.333141 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  22.62 
 
 		 663 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  24.07 
 
 		 650 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  27.86 
 
 		 695 aa  53.9  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 671 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  24.07 
 
 		 650 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01896  tonb-dependent receptor signal peptide protein  32.81 
 
 		 652 aa  52.4  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.156126  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 714 aa  52.4  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  24.01 
 
 		 807 aa  52.8  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  24.07 
 
 		 650 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 653 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  24.74 
 
 		 739 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 713 aa  52.4  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4699  TonB-dependent receptor plug  30 
 
 		 799 aa  52.4  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0785205 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1266  TonB-dependent iron complex outermembrane receptor protein  29.94 
 
 		 673 aa  52  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02821  OmpA-related protein  32.91 
 
 		 485 aa  51.6  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00282883  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  21.18 
 
 		 917 aa  51.2  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  23.58 
 
 		 663 aa  50.8  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1539  receptor, putative  23.03 
 
 		 639 aa  50.8  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  26.51 
 
 		 700 aa  50.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1175  TonB-dependent siderophore receptor  28.99 
 
 		 749 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0391  TonB-dependent siderophore receptor  24.74 
 
 		 712 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.196206  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1655  TonB-dependent siderophore receptor  27.54 
 
 		 656 aa  50.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  25.73 
 
 		 663 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  27.18 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3412  ferrichrome iron receptor  38.89 
 
 		 691 aa  50.1  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000883951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2180  TonB-dependent receptor  24 
 
 		 793 aa  50.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.111173  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1524  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 847 aa  50.4  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  23.27 
 
 		 897 aa  50.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0988  TonB-dependent receptor plug  42.65 
 
 		 806 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.124203 
 
 
-
 
NC_002950  PG1006  hypothetical protein  23.24 
 
 		 894 aa  49.7  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0617  outer membrane protein  22.69 
 
 		 800 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.223458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0959  TonB-dependent receptor  34.48 
 
 		 110 aa  49.7  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000367302  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2751  TonB-dependent receptor plug  23.83 
 
 		 722 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.930878  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1629  TonB-dependent siderophore receptor  28.24 
 
 		 712 aa  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385709 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  27.75 
 
 		 750 aa  49.7  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2310  TonB-dependent receptor  22.9 
 
 		 815 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>