88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_3043 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3043  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  100 
 
 		 399 aa  810    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.198967 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2842  LysM repeat-containing protein  26.9 
 
 		 389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5051  Peptidoglycan-binding LysM  39.05 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.517247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  25.99 
 
 		 393 aa  89.4  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6487  Peptidoglycan-binding LysM  25.33 
 
 		 341 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.577671  normal  0.707539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0489  cell wall hydrolase/autolysin  37.16 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000671829  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0976  lytic transglycosylase, catalytic  26.29 
 
 		 610 aa  63.5  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.773866  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  25.93 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3724  cell wall hydrolase/autolysin  32.19 
 
 		 557 aa  60.8  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0816524  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3922  cell wall hydrolase/autolysin  31.51 
 
 		 542 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00766484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002256  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase AmiB precursor  28.48 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000111797  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4463  Lytic transglycosylase catalytic  27.22 
 
 		 498 aa  57.8  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.689594  normal  0.530069 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3656  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.61 
 
 		 593 aa  55.8  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106561  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0644  putative N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.41 
 
 		 679 aa  55.8  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.165193  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0702  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.61 
 
 		 631 aa  55.8  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00039621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  25.77 
 
 		 733 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3802  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.93 
 
 		 637 aa  55.1  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0514476  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  29.45 
 
 		 563 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.41 
 
 		 499 aa  52.8  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00097  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.74 
 
 		 576 aa  52.8  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  24.86 
 
 		 556 aa  52.4  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  22.99 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3030  peptidoglycan lytic transglycosylase-related protein  29.56 
 
 		 583 aa  51.6  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  28.41 
 
 		 487 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2898  Lytic transglycosylase catalytic  25.66 
 
 		 849 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.52326 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  27.01 
 
 		 595 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  22.64 
 
 		 543 aa  49.3  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  29.85 
 
 		 405 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21721  LysM domain-containing protein  30.4 
 
 		 499 aa  49.7  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0486774 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1087  lytic transglycosylase, catalytic  27.78 
 
 		 650 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.106498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  23.08 
 
 		 534 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1379  peptidoglycan-binding LysM  24.88 
 
 		 556 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0411  Lytic transglycosylase catalytic  41.3 
 
 		 447 aa  47.8  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674118  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  23.56 
 
 		 539 aa  47.8  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2378  peptidoglycan-binding LysM  26.35 
 
 		 634 aa  47.4  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.903959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  39.44 
 
 		 292 aa  47.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0750  peptidoglycan-binding LysM  47.27 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000075939  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  26.03 
 
 		 485 aa  46.6  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  27.88 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  23.43 
 
 		 527 aa  46.6  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2379  peptidoglycan-binding LysM  29.14 
 
 		 698 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.829657  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0428  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30 
 
 		 597 aa  45.8  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000317907  hitchhiker  0.000000852685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0026  peptidoglycan-binding lytic transglycosylase  24.48 
 
 		 495 aa  45.8  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.250795  normal  0.876942 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 455 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2218  Lytic transglycosylase catalytic  23.33 
 
 		 618 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.70593 
 
 
-
 
NC_002950  PG2150  LysM domain-containing protein  24.26 
 
 		 501 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.33 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  37.66 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1525  Rhs family-like protein  37.5 
 
 		 3794 aa  45.1  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14033 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3241  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  25.17 
 
 		 840 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  22.89 
 
 		 498 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  26.32 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0336  peptidoglycan-binding LysM  37.35 
 
 		 256 aa  44.7  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.230507  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 406 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  38.03 
 
 		 294 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  30.3 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2780  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  23.21 
 
 		 579 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.395604  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  26.32 
 
 		 301 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6909  Mannosyl-glycoproteinendo-beta-N- acetylglucosami dase  42.86 
 
 		 619 aa  44.3  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.490682  normal  0.152044 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3802  putative cell wall hydrolase  25.93 
 
 		 265 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000430896  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03310  Peptidoglycan-binding LysM  39.06 
 
 		 523 aa  43.9  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  27.1 
 
 		 479 aa  43.9  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  25.18 
 
 		 544 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1800  peptidase M23B  32.93 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0541473  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  26.88 
 
 		 474 aa  43.5  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1687  Peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 		 516 aa  43.5  0.006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0930816  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0965  Lytic transglycosylase catalytic  27.18 
 
 		 570 aa  43.5  0.006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  28.75 
 
 		 474 aa  43.5  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  26.71 
 
 		 754 aa  43.5  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  41.86 
 
 		 562 aa  43.5  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1413  peptidoglycan-binding LysM  25.68 
 
 		 323 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00299984  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1037  peptidase M23B  33.7 
 
 		 240 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.283686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  42.37 
 
 		 447 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  27.45 
 
 		 479 aa  43.1  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  45.65 
 
 		 253 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  25.57 
 
 		 788 aa  43.1  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  41.67 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0894  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.96 
 
 		 472 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0493  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  50 
 
 		 455 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0342023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>