More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1786 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1786  formylmethionine deformylase  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6178  formylmethionine deformylase  40.65 
 
 		 171 aa  116  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0426959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4955  aminotransferase class IV  40.38 
 
 		 496 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111871 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3053  aminotransferase, class IV  40.38 
 
 		 496 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3474  peptide deformylase  34.23 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.796462  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1273  peptide deformylase  31.36 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0780  peptide deformylase  31.25 
 
 		 177 aa  84.3  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.667825  normal  0.561124 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1813  peptide deformylase  29.52 
 
 		 177 aa  84  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.442339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1130  peptide deformylase  31.51 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000143546  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1399  peptide deformylase  30.72 
 
 		 177 aa  82  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2056  peptide deformylase  31.93 
 
 		 177 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.302964  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1337  peptide deformylase  30.18 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5333  peptide deformylase  31.55 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.816635  normal  0.462892 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1168  peptide deformylase  30.82 
 
 		 164 aa  80.9  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00145163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1466  peptide deformylase  30.3 
 
 		 177 aa  80.9  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1429  peptide deformylase  32.14 
 
 		 177 aa  80.5  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00135089 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2579  peptide deformylase  37.32 
 
 		 169 aa  80.5  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.231026  hitchhiker  0.00000660539 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01321  peptide deformylase  35.04 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1431  peptide deformylase  35.04 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03091  peptide deformylase  36.09 
 
 		 201 aa  77.8  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0020  polypeptide deformylase  31.08 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3250  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2441  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.126413  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1559  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.523571  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2587  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.368495  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0409  peptide deformylase  35.04 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2274  peptide deformylase  36.52 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.425621 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0651  peptide deformylase  28.48 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.321715  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1333  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0465999  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2061  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.203959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2498  peptide deformylase  27.71 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0055  peptide deformylase  32.21 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0323144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3965  peptide deformylase  35.92 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4010  peptide deformylase  35.92 
 
 		 187 aa  76.3  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.132582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3633  peptide deformylase  29.09 
 
 		 174 aa  76.3  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0191  peptide deformylase  31.29 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0691522  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0072  peptide deformylase  32.89 
 
 		 171 aa  75.9  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2023  peptide deformylase  27.11 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.802716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0049  peptide deformylase  31.82 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.451864 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0283  peptide deformylase  36.3 
 
 		 170 aa  75.5  0.0000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.01475 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1885  peptide deformylase  30.18 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0792012  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0830  peptide deformylase  37.86 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.139175  normal  0.098116 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1861  peptide deformylase  36.21 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1664  peptide deformylase  33.33 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000323293 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0607  peptide deformylase  32.24 
 
 		 189 aa  74.7  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152788  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1788  peptide deformylase  35.77 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0023  peptide deformylase  34.93 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0409  peptide deformylase  31.97 
 
 		 188 aa  73.9  0.0000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1679  peptide deformylase  36.7 
 
 		 185 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1473  peptide deformylase  36.97 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0374  peptide deformylase  30.9 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1477  peptide deformylase  29.65 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00761  peptide deformylase  36.04 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.264235  normal  0.886891 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0662  peptide deformylase  31.79 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3305  peptide deformylase  30.61 
 
 		 172 aa  72.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0514769  normal  0.598206 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0975  peptide deformylase  29.49 
 
 		 182 aa  72.4  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000624614  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0350  peptide deformylase  33.33 
 
 		 171 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.100367 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1340  peptide deformylase  32.52 
 
 		 192 aa  72  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.457747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1677  peptide deformylase  29.17 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0206244  normal  0.0509785 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49870  peptide deformylase  29.14 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1704  peptide deformylase  29.8 
 
 		 152 aa  72  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0915  peptide deformylase  29.65 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2066  peptide deformylase  31.58 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.166948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1342  peptide deformylase  30.12 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.256728 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1232  peptide deformylase  36.11 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000166478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1333  peptide deformylase  35.58 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00759572  normal  0.402167 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1528  peptide deformylase  37.86 
 
 		 159 aa  70.9  0.000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2590  peptide deformylase  27.54 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.232767 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2460  peptide deformylase  29.17 
 
 		 177 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00644557  hitchhiker  0.000321995 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1344  peptide deformylase  31.29 
 
 		 175 aa  70.9  0.000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1174  peptide deformylase  30.77 
 
 		 162 aa  70.9  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.234676  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4247  peptide deformylase  27.06 
 
 		 179 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0165  peptide deformylase  32.12 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0054  peptide deformylase  32.21 
 
 		 174 aa  70.1  0.00000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.847323  hitchhiker  0.000416121 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2722  peptide deformylase  37.86 
 
 		 187 aa  70.5  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1925  peptide deformylase  31.33 
 
 		 177 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.591473  normal  0.128447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0673  peptide deformylase  32.89 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1591  peptide deformylase  29.5 
 
 		 172 aa  70.1  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2580  peptide deformylase  34.21 
 
 		 174 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  hitchhiker  0.00000672564 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2078  peptide deformylase  30.06 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.128531  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1083  hypothetical protein  30.38 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3284  peptide deformylase  31.85 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.373391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0837  peptide deformylase  32.12 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0466  peptide deformylase  32.24 
 
 		 174 aa  69.3  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0868  peptide deformylase  30.07 
 
 		 180 aa  69.7  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.226218  normal  0.184037 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1061  hypothetical protein  31.29 
 
 		 172 aa  69.3  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19041  peptide deformylase  27.49 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4432  peptide deformylase  30.99 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1440  peptide deformylase  30.61 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00791  peptide deformylase  34.58 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.503942  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0204  peptide deformylase  26.71 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0372  peptide deformylase  28.68 
 
 		 169 aa  68.9  0.00000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00801  peptide deformylase  34.58 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.876685  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0029  peptide deformylase  38.83 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0954  peptide deformylase  33.1 
 
 		 170 aa  68.6  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.265871  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0148  peptide deformylase  29.56 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.317383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5067  formylmethionine deformylase  27.71 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.456433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0070  peptide deformylase  34.58 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.805375  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07980  peptide deformylase  35.64 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0583135 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2597  peptide deformylase  31.76 
 
 		 163 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.442514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>