More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_04290 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_04290  transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0356089  normal  0.115644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24780  transcriptional regulator, tetR family  35.65 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 250 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 223 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 285 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 238 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 248 aa  57.8  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.78 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 224 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 231 aa  55.5  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 220 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3109  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0137482  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4012  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00441742  normal  0.139253 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 225 aa  54.3  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 246 aa  53.5  0.000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 304 aa  53.1  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 204 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 252 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 233 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0631  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 215 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0181  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 230 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0664  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.783759  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 226 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 259 aa  52.4  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 239 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 266 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 248 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 267 aa  52.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 255 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 235 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  25.93 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0466  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7540  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.739082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0559  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 173 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0585  TetR family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.808799  normal  0.581317 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 234 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3750  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  32.26 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2719  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  28.87 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1121  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.2139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 268 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7073  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 248 aa  49.3  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.672487  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  37.1 
 
 		 260 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 216 aa  49.3  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>