More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2899 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2899  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 		 376 aa  776    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2733  OmpA/MotB  75.86 
 
 		 377 aa  590  1e-167  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0140281  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2732  OmpA/MotB  72.07 
 
 		 373 aa  561  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.262387  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  67.02 
 
 		 365 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  71.77 
 
 		 367 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  67.47 
 
 		 367 aa  527  1e-148  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  65.15 
 
 		 368 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  59.63 
 
 		 370 aa  429  1e-119  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  59.04 
 
 		 366 aa  430  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  59.27 
 
 		 373 aa  421  1e-117  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  57.96 
 
 		 372 aa  423  1e-117  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  57.7 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  58.67 
 
 		 369 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  57.33 
 
 		 369 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  57.33 
 
 		 369 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1045  OmpA/MotB domain-containing protein  58.18 
 
 		 363 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000183072  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  32.36 
 
 		 341 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0456  OmpA domain-containing protein  32.17 
 
 		 346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  39.47 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3868  OmpA/MotB domain-containing protein  31.25 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599352  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  39.47 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.99 
 
 		 344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  40.27 
 
 		 351 aa  146  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.09 
 
 		 345 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  38.39 
 
 		 344 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  37.34 
 
 		 394 aa  140  3e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  35.5 
 
 		 403 aa  139  7.999999999999999e-32  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  36.91 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  46.71 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  46.71 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  46.05 
 
 		 344 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  37.5 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  35.87 
 
 		 333 aa  130  5.0000000000000004e-29  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  28.43 
 
 		 352 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.78 
 
 		 337 aa  129  9.000000000000001e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  36.84 
 
 		 345 aa  125  2e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0250  OmpA/MotB  29.91 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000280448  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0690  OmpA/MotB domain-containing protein  28.2 
 
 		 331 aa  123  6e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0701  OmpA/MotB domain-containing protein  26.98 
 
 		 369 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  41.57 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.33 
 
 		 337 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1229  putative outer membrane protein  37.95 
 
 		 212 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000815007  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0018  outer membrane protein OmpA family  41.51 
 
 		 201 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  31.73 
 
 		 388 aa  117  5e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  42.17 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  28.52 
 
 		 381 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  30.2 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.3 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.38 
 
 		 417 aa  114  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02380  hypothetical protein  41.03 
 
 		 204 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003402  outer membrane protein  40.62 
 
 		 204 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00000500846  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3262  OmpA/MotB  36.6 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.576272  normal  0.468838 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  30.28 
 
 		 366 aa  108  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  27.76 
 
 		 367 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000755  outer membrane protein A precursor  27.03 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000475354  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4333  OmpA/MotB domain-containing protein  28.73 
 
 		 454 aa  106  7e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000720866  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003405  outer membrane protein  39.87 
 
 		 204 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  36.91 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3595  OmpA/MotB domain-containing protein  37.33 
 
 		 202 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  37.67 
 
 		 401 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001578  outer membrane protein  37.17 
 
 		 205 aa  103  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.672698  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02373  hypothetical protein  37.82 
 
 		 208 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  32.47 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0309  OmpA/MotB domain-containing protein  35.4 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.350463  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4774  ompA family protein  31.09 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.220216  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0432  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 200 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.161803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40.52 
 
 		 376 aa  101  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3909  OmpA/MotB domain protein  38 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0924  OmpA/MotB domain-containing protein  29.03 
 
 		 356 aa  100  3e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3986  OmpA/MotB domain-containing protein  38 
 
 		 202 aa  101  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0380  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 201 aa  100  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4321  OmpA family protein  31.52 
 
 		 201 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  27.25 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.22 
 
 		 375 aa  100  5e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0473  OmpA/MotB domain-containing protein  34.67 
 
 		 201 aa  100  6e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 237 aa  99.4  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4008  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 202 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4102  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 202 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  24.3 
 
 		 330 aa  99  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  35.9 
 
 		 209 aa  99  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4143  OmpA/MotB domain-containing protein  36 
 
 		 201 aa  98.6  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00334816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0380  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 202 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.700154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0364  OmpA/MotB domain-containing protein  34.87 
 
 		 201 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0378  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 202 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3646  OmpA/MotB domain-containing protein  35.33 
 
 		 185 aa  97.8  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  36.3 
 
 		 319 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009439  Pmen_1422  OmpA/MotB domain-containing protein  41.35 
 
 		 210 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0642505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  27.59 
 
 		 468 aa  92.8  8e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2092  OmpF family protein  40 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0207533  normal  0.0999951 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  25.75 
 
 		 320 aa  91.3  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1338  OmpA family protein  42.74 
 
 		 229 aa  91.3  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  34.81 
 
 		 264 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  27.48 
 
 		 362 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  35.4 
 
 		 445 aa  90.5  5e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2905  OmpA/MotB domain protein  26.16 
 
 		 466 aa  90.1  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000108671 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1319  OmpA/MotB domain-containing protein  28.15 
 
 		 376 aa  90.1  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000538127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  36.71 
 
 		 218 aa  89.7  7e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01273  hypothetical protein  26.7 
 
 		 318 aa  89.7  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  33.54 
 
 		 240 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  35.44 
 
 		 239 aa  89.4  9e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>