71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A2272 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A2272  lytic enzyme  100 
 
 		 204 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.880896  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0686  lytic enzyme  67.16 
 
 		 204 aa  283  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000553014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4457  lytic enzyme  65.69 
 
 		 204 aa  279  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.867562  hitchhiker  0.0000000252296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1096  lytic enzyme  66.18 
 
 		 204 aa  278  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0104377 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0199  putative endolysin  55.33 
 
 		 212 aa  216  2e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0276  glycoside hydrolase family 19  45.13 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0358  glycoside hydrolase family 19  42.71 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2255  glycoside hydrolase family 19  39.13 
 
 		 197 aa  131  7.999999999999999e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1295  glycoside hydrolase family 19  38.25 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.398122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1414  glycoside hydrolase family 19  36.41 
 
 		 204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1679  glycoside hydrolase family 19  38.25 
 
 		 197 aa  127  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2437  chitinase-like protein  40.57 
 
 		 335 aa  121  6e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3679  lytic enzyme  38.92 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2093  lysozyme, putative  39.5 
 
 		 177 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372072  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4037  lysozyme, putative  39.5 
 
 		 177 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0773  hypothetical protein  42.93 
 
 		 209 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2767  glycoside hydrolase family protein  40.98 
 
 		 177 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.32693  normal  0.0234553 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08160  putative lytic enzyme  43.17 
 
 		 209 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000097217  hitchhiker  0.000261863 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5850  chitinase  37.07 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2430  lytic enzyme  41.71 
 
 		 209 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2021  lytic enzyme  60.98 
 
 		 95 aa  107  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.697599 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1434  lytic enzyme  60.98 
 
 		 95 aa  107  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197668  normal  0.284456 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2238  glycoside hydrolase family 19  39.53 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3933  lysozyme, putative  37.23 
 
 		 177 aa  102  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.481436  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4033  glycoside hydrolase family protein  37.02 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.148282  unclonable  0.0000000000000260373 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1219  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.324918  hitchhiker  0.000139257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3066  pyocin R2_PP, lytic enzyme  36.27 
 
 		 183 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4583  glycoside hydrolase family protein  38.3 
 
 		 181 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0192783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2124  chitinase-like protein  36.46 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.166993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1429  putative glycohydrolase  32.79 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1172  Pyocin R2_PP, lytic enzyme  39.04 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3452  putative lysozyme  36.04 
 
 		 183 aa  95.1  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.172669  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3389  lysozyme, putative  34.55 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.101115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1995  putative glycohydrolase  35.59 
 
 		 245 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.853738 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01355  phage-related lytic enzyme  34.13 
 
 		 213 aa  91.3  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.225253  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1828  putative glycohydrolase  35.5 
 
 		 269 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0427119  normal  0.338649 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3456  putative glycohydrolase  33.33 
 
 		 266 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.562067  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1863  glycoside hydrolase family protein  31.92 
 
 		 190 aa  86.3  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000377059  hitchhiker  0.0000000000000241474 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3040  hypothetical protein  29.25 
 
 		 187 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00105479  unclonable  0.0000015212 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2608  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 789 aa  78.6  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.657392  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3658  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3606  peptidoglycan binding domain-containing protein  39.82 
 
 		 264 aa  69.7  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2746  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3780  peptidoglycan binding domain-containing protein  41.74 
 
 		 264 aa  68.2  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.173597  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2990  chitinase-like protein  39.05 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0509931  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0108  glycoside hydrolase family protein  28.1 
 
 		 1054 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3652  chitinase-like protein  26.17 
 
 		 875 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5204  EF hand domain protein  31.52 
 
 		 674 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0015  hypothetical protein  28.64 
 
 		 776 aa  62.4  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2261  peptidase M23B  33.33 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130083  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1484  chitinase-like protein  28.72 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5898  chitinase-like protein  30.86 
 
 		 1297 aa  51.2  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2226  EF hand domain-containing protein  34.38 
 
 		 989 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.48504  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0125  hypothetical protein  25.67 
 
 		 238 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.293985 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4051  hypothetical protein  31.31 
 
 		 290 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1867  chitinase-like protein  27.89 
 
 		 322 aa  48.9  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4884  Chitinase  33.33 
 
 		 245 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6478  hypothetical protein  30.07 
 
 		 311 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000427  hypothetical protein  36.63 
 
 		 743 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.111385  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3366  chitinase  35.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.25303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3355  chitinase  35.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3417  chitinase  35.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02039  EF hand domain protein  22.68 
 
 		 964 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.115818  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4405  chitinase  33.02 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4775  chitinase-like protein  32.5 
 
 		 259 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.340237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0515  hypothetical protein  52.38 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.356354  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1329  Chitinase  33.33 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2175  chitinase  32.18 
 
 		 431 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000288646  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6125  peptidase M23B  71.43 
 
 		 746 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0146574  normal  0.37839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5452  Chitinase  30.43 
 
 		 296 aa  42.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0310454  normal  0.198573 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5336  Chitinase  30.3 
 
 		 368 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0262432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>