120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1102 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_1102  ATPase  100 
 
 		 2848 aa  5623    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.456945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2152  thrombospondin type 3 repeat-/CalX-beta domain-containing protein  41.18 
 
 		 1362 aa  527  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4025  OmpA-like transmembrane domain-containing protein  40.89 
 
 		 1480 aa  429  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  35.6 
 
 		 3544 aa  288  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  34.54 
 
 		 2839 aa  285  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  35.29 
 
 		 2503 aa  282  5e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  35.13 
 
 		 3699 aa  282  5e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  35.14 
 
 		 2522 aa  282  6e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  34.98 
 
 		 3699 aa  277  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  34.48 
 
 		 2476 aa  274  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  32.77 
 
 		 2153 aa  274  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  33.74 
 
 		 1911 aa  258  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.04 
 
 		 3089 aa  255  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3174  dystroglycan-type cadherin domain-containing protein  29.4 
 
 		 2715 aa  222  6e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.58 
 
 		 3816 aa  221  2e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  36.11 
 
 		 3477 aa  199  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00819  hypothetical protein  44.3 
 
 		 823 aa  163  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  33.64 
 
 		 2074 aa  162  8e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  27.13 
 
 		 2670 aa  140  3.0000000000000003e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2049  hypothetical protein  39.1 
 
 		 14609 aa  84  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1325  hypothetical protein  50 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000125315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1528  ATPase  33.58 
 
 		 792 aa  82.8  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000000453148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0248  PKD domain-containing protein  41.04 
 
 		 3278 aa  78.2  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.748556 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13428  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1634 aa  78.6  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  45.63 
 
 		 2816 aa  71.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2754  collagenase  50 
 
 		 972 aa  71.2  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  38.78 
 
 		 1215 aa  69.7  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  38.78 
 
 		 1215 aa  69.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.74 
 
 		 1066 aa  69.3  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02378  hypothetical protein  40.87 
 
 		 814 aa  68.6  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  46.53 
 
 		 4848 aa  65.9  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  40.54 
 
 		 994 aa  64.7  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1527  thrombospondin type 3 repeat-containing protein  29.65 
 
 		 722 aa  65.1  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000497915 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4901  hypothetical protein  36.92 
 
 		 1987 aa  65.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.958107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0237  hypothetical protein  36.45 
 
 		 1006 aa  64.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0211048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1491  type 3a cellulose-binding domain protein  32.2 
 
 		 2344 aa  63.2  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  40.86 
 
 		 1597 aa  63.2  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4812  OmpA/MotB domain protein  31.66 
 
 		 1755 aa  62.8  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2357  putative outer membrane adhesin like proteiin  39.86 
 
 		 850 aa  62.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6410  hypothetical protein  39.8 
 
 		 1781 aa  60.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.885103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  32.38 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  37.63 
 
 		 8321 aa  58.5  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3858  hypothetical protein  38.04 
 
 		 539 aa  58.2  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.997252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1367  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.16 
 
 		 3396 aa  57.8  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.410312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  40.23 
 
 		 1269 aa  57.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  40.23 
 
 		 1268 aa  58.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.51 
 
 		 761 aa  57.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2032  hypothetical protein  45.35 
 
 		 1908 aa  57.4  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1586  hypothetical protein  36.49 
 
 		 852 aa  57.4  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  40.37 
 
 		 563 aa  57  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5254  OmpA/MotB domain protein  31.79 
 
 		 1264 aa  57  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  40.22 
 
 		 1744 aa  56.6  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1645  hypothetical protein  31.87 
 
 		 2487 aa  56.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.78 
 
 		 2346 aa  56.2  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3600  hypothetical protein  41 
 
 		 556 aa  56.2  0.000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  36.27 
 
 		 5745 aa  55.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  47.37 
 
 		 1236 aa  55.5  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  45.92 
 
 		 5769 aa  55.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  38.55 
 
 		 16322 aa  56.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  39.13 
 
 		 721 aa  55.5  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  43.01 
 
 		 1502 aa  55.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  37.37 
 
 		 1752 aa  55.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1018  hypothetical protein  39.29 
 
 		 2767 aa  55.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.556407 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004053  hypothetical protein  35.77 
 
 		 994 aa  55.5  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000445976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  39.08 
 
 		 1269 aa  54.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  42.31 
 
 		 3363 aa  54.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1811  OmpA/MotB domain-containing protein  34.23 
 
 		 322 aa  54.3  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.000000000728339  normal  0.835393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  41.3 
 
 		 2377 aa  54.3  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  33.33 
 
 		 1394 aa  54.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1642  peptidase M11, gametolysin  41.56 
 
 		 1022 aa  54.3  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  36 
 
 		 4978 aa  53.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1416  hypothetical protein  38.78 
 
 		 582 aa  53.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0637882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  36.63 
 
 		 3474 aa  52.8  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0505  PPE repeat-containing protein  39.77 
 
 		 891 aa  52.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  37.5 
 
 		 1367 aa  52.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1034  PPE repeat-containing protein  35.14 
 
 		 886 aa  52.8  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.313591  normal  0.411811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3224  putative outer membrane adhesin like proteiin  29.58 
 
 		 369 aa  52  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2599  hypothetical protein  34.09 
 
 		 1061 aa  52.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0018117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  35.71 
 
 		 892 aa  51.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0054  hypothetical protein  45.21 
 
 		 2353 aa  52  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0110  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 1408 aa  51.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0112  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 1410 aa  50.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0115  putative lipoprotein  33.11 
 
 		 1410 aa  50.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  31.91 
 
 		 1126 aa  51.2  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0876  peptidase domain protein  36.43 
 
 		 843 aa  51.2  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  38.94 
 
 		 2067 aa  51.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.82 
 
 		 6885 aa  50.4  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  38.24 
 
 		 1884 aa  50.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0529  peptidase M11, gametolysin  50 
 
 		 653 aa  50.1  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0528  peptidase M11, gametolysin  50 
 
 		 653 aa  50.1  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0806  hypothetical protein  50.88 
 
 		 1107 aa  50.1  0.0007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  36.67 
 
 		 1215 aa  50.1  0.0007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1685  collagenase  68.57 
 
 		 968 aa  49.7  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000629981  unclonable  0.00000468189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3660  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 1215 aa  49.7  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3503  hypothetical protein  48.28 
 
 		 653 aa  48.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  42.5 
 
 		 2114 aa  49.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  37.41 
 
 		 456 aa  49.3  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  30.91 
 
 		 1363 aa  49.3  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3783  outer membrane adhesin like proteiin  34.78 
 
 		 1215 aa  49.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  33.12 
 
 		 487 aa  48.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>