211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2213 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_2213  peptidase M28  100 
 
 		 506 aa  1004    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.201523  normal  0.0575803 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1751  peptidase M28  40.59 
 
 		 514 aa  300  4e-80  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.691853  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  34.23 
 
 		 563 aa  241  2e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  30.6 
 
 		 555 aa  232  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0245  peptidase M28  31.75 
 
 		 550 aa  231  2e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  32.58 
 
 		 548 aa  226  9e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  32.87 
 
 		 548 aa  224  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02856  peptidase  31.85 
 
 		 575 aa  223  4e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  29.89 
 
 		 547 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  30.33 
 
 		 552 aa  221  3e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  31.38 
 
 		 550 aa  213  4.9999999999999996e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  30.04 
 
 		 557 aa  213  9e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  32.28 
 
 		 571 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  29.05 
 
 		 557 aa  208  1e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  28.92 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  33.15 
 
 		 552 aa  208  2e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  33.15 
 
 		 552 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  31.11 
 
 		 603 aa  207  5e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2747  peptidase M28  29.13 
 
 		 556 aa  204  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000225473  hitchhiker  0.00200364 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  31.11 
 
 		 549 aa  203  6e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  30.45 
 
 		 549 aa  202  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  30.17 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  29.98 
 
 		 540 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.07 
 
 		 529 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  29.39 
 
 		 532 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  27.91 
 
 		 550 aa  200  5e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  30.16 
 
 		 541 aa  200  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.59 
 
 		 522 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  30.16 
 
 		 541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  29.98 
 
 		 540 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  29.96 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  30.67 
 
 		 551 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  28.54 
 
 		 557 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1817  peptidase M28  31.78 
 
 		 559 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.157463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  29.96 
 
 		 553 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  27.73 
 
 		 558 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2578  peptidase M28  31.76 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0256321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  27.73 
 
 		 558 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  28.6 
 
 		 558 aa  193  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  29.92 
 
 		 506 aa  192  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  29.33 
 
 		 529 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2556  peptidase M28  28.4 
 
 		 558 aa  190  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00050336  unclonable  0.0000000000133142 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  29.38 
 
 		 532 aa  190  5e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2582  peptidase M28  29.13 
 
 		 552 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1839  peptidase M28  29.46 
 
 		 569 aa  189  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  27.72 
 
 		 546 aa  185  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1839  peptidase M28  27.42 
 
 		 597 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000637345  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  29.11 
 
 		 567 aa  185  2.0000000000000003e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  29.12 
 
 		 542 aa  184  3e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  27.64 
 
 		 552 aa  179  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  29.01 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  29.68 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1997  peptidase M28  27.27 
 
 		 537 aa  170  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.801062  hitchhiker  0.00000223343 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2254  peptidase  26.23 
 
 		 573 aa  165  2.0000000000000002e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106202  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2162  peptidase M28  26.34 
 
 		 573 aa  160  4e-38  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000358792  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  28.12 
 
 		 563 aa  160  6e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  27.22 
 
 		 552 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4338  peptidase M28  29.66 
 
 		 529 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387318  normal  0.135899 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  28.71 
 
 		 552 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  28.46 
 
 		 545 aa  148  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3003  peptidase M28  29.88 
 
 		 558 aa  144  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  28.52 
 
 		 560 aa  143  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  26.67 
 
 		 539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  29.39 
 
 		 539 aa  128  3e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6549  peptidase M28  28.49 
 
 		 551 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.657933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.38 
 
 		 533 aa  122  9.999999999999999e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  25.6 
 
 		 506 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1824  peptidase M28  29.31 
 
 		 534 aa  117  5e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  25.38 
 
 		 546 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  24.04 
 
 		 491 aa  111  3e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  25.55 
 
 		 528 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  26.02 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  28.51 
 
 		 598 aa  103  9e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  28.66 
 
 		 944 aa  100  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  27.96 
 
 		 503 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  25.86 
 
 		 674 aa  91.7  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  24.28 
 
 		 555 aa  88.6  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  23.69 
 
 		 394 aa  87.4  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  29.85 
 
 		 319 aa  80.9  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  30.04 
 
 		 579 aa  80.9  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  27.11 
 
 		 334 aa  78.6  0.0000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  28.97 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  26.42 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  35.51 
 
 		 422 aa  73.2  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  38.89 
 
 		 1103 aa  72  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  42.11 
 
 		 330 aa  71.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  31.07 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  26.49 
 
 		 341 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2986  peptidase M28  32.31 
 
 		 775 aa  68.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  44.32 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4339  peptidase M28  41.05 
 
 		 815 aa  66.6  0.0000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  26.15 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  34.91 
 
 		 319 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2427  peptidase family protein  34.15 
 
 		 447 aa  65.9  0.000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2137  peptidase family protein  29.01 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  29.95 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  36.04 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  28.37 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  38.04 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  33.6 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>