More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0471 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0471  secretion protein HlyD  100 
 
 		 404 aa  793    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4745  RND family efflux transporter MFP subunit  62.96 
 
 		 393 aa  371  1e-101  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.19985 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0040  secretion protein HlyD  56.6 
 
 		 389 aa  356  2.9999999999999997e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0807  RND family efflux transporter MFP subunit  33.43 
 
 		 358 aa  140  4.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3463  HlyD family secretion protein  31.96 
 
 		 378 aa  132  1.0000000000000001e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1504  RND family efflux transporter MFP subunit  33.52 
 
 		 397 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0583737 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2854  cation efflux transporter  33.24 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.405755  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1439  RND family efflux transporter MFP subunit  31.76 
 
 		 390 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1149  RND family efflux transporter MFP subunit  32.02 
 
 		 426 aa  126  9e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4105  secretion protein HlyD  32.56 
 
 		 383 aa  124  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0739298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 386 aa  121  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2400  secretion protein HlyD  30.29 
 
 		 440 aa  120  3e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.705753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2374  RND family efflux transporter MFP subunit  30.2 
 
 		 395 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.347836 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4022  RND family efflux transporter MFP subunit  31.96 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.780048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0396  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 413 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  30.86 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5104  RND family efflux transporter MFP subunit  32.48 
 
 		 427 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3024  secretion protein HlyD  32.68 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.756641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4833  RND family efflux transporter MFP subunit  29.11 
 
 		 392 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3372  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.96 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0461986  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4663  RND family efflux transporter MFP subunit  34.35 
 
 		 394 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0429  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.75 
 
 		 413 aa  110  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3888  Fis family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 389 aa  110  4.0000000000000004e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0700006  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.92 
 
 		 413 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.254107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4108  putative secretion protein (HlyD)  30.12 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.331978  normal  0.146318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3044  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.28 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01940  putative RND efflux membrane fusion protein precursor  30.1 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.34804 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2411  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.76 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733291  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3901  RND family efflux transporter MFP subunit  30.81 
 
 		 396 aa  103  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.843954  normal  0.11743 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  28.17 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  32.18 
 
 		 366 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 		 609 aa  102  9e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3299  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.6 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.167372 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3461  efflux transporter, RND family, MFP subunit  36.42 
 
 		 370 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0234  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.9 
 
 		 367 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1373  RND family efflux transporter MFP subunit  33.03 
 
 		 409 aa  99.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000149577 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5198  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.13 
 
 		 366 aa  99.8  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2084  RND efflux membrane fusion protein  29.24 
 
 		 427 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.91 
 
 		 361 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0916  HlyD family secretion protein  29.65 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0859  HlyD family secretion protein  29.65 
 
 		 372 aa  97.4  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.585057  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.19 
 
 		 380 aa  97.4  4e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7484  HlyD family secretion protein  28.11 
 
 		 351 aa  97.1  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.832684  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  31.83 
 
 		 366 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4651  RND family efflux transporter MFP subunit  29 
 
 		 402 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.611035  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.83 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  33.44 
 
 		 418 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3414  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.79 
 
 		 1462 aa  95.1  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4394  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.28 
 
 		 414 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.440743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4289  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.01 
 
 		 402 aa  94.4  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0321009 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4184  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 462 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.267577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3610  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.01 
 
 		 388 aa  93.6  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.479598  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4296  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.42 
 
 		 462 aa  93.6  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.31 
 
 		 369 aa  93.6  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4102  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 		 366 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3921  RND family efflux transporter MFP subunit  28.73 
 
 		 402 aa  92.8  9e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316668 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1640  CmeA  24.79 
 
 		 386 aa  92.4  1e-17  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3826  RND family efflux transporter MFP subunit  30.32 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  30.95 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31 
 
 		 363 aa  92  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3965  RND family efflux transporter MFP subunit  30.3 
 
 		 362 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000185194 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  28.9 
 
 		 367 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3300  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.32 
 
 		 395 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2621  secretion protein HlyD  30.6 
 
 		 367 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2584  CzcB subfamily membrane fusion protein  28.21 
 
 		 409 aa  90.9  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0458  secretion protein HlyD  29.75 
 
 		 378 aa  90.9  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1266  secretion protein HlyD  29.27 
 
 		 411 aa  90.9  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.279661  normal  0.224738 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3472  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.000321827  normal  0.111591 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.2 
 
 		 410 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.745567  normal  0.0817001 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4544  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.3 
 
 		 379 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.80936 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7282  HlyD family secretion protein  27.86 
 
 		 377 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548499  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0091  efflux transporter, RND family, MFP subunit  35.68 
 
 		 306 aa  90.5  5e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.718467 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.96 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.96 
 
 		 369 aa  90.5  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0123  RND family efflux transporter MFP subunit  29.22 
 
 		 417 aa  90.5  5e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.713324 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  26.02 
 
 		 364 aa  90.5  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2928  secretion protein HlyD  27.73 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.7039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1451  RND family efflux transporter MFP subunit  28.75 
 
 		 369 aa  89.7  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.513769  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4616  secretion protein HlyD  26.17 
 
 		 414 aa  90.1  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  26.29 
 
 		 411 aa  89.7  8e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2214  putative component of multidrug efflux system  29.69 
 
 		 368 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.082194  normal  0.474627 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6991  RND family efflux transporter MFP subunit  27.92 
 
 		 472 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.231557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3689  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.27 
 
 		 414 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1502  secretion protein HlyD  29.03 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.184777  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6327  RND family efflux transporter MFP subunit  29.03 
 
 		 478 aa  89.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0452278  normal  0.980568 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.25 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.59 
 
 		 356 aa  88.2  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_003296  RS03087  putative cation-efflux system signal peptide protein  31.08 
 
 		 375 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.297372 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0767  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 372 aa  87.8  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00075698  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2071  RND efflux system membrane fusion protein  25.66 
 
 		 407 aa  88.2  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.226746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  26.99 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  28.57 
 
 		 367 aa  87.8  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2732  RND family efflux transporter MFP subunit  25.7 
 
 		 361 aa  87.4  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844309  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  25.6 
 
 		 352 aa  87.4  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2178  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.02 
 
 		 371 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700364  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0383  RND family efflux transporter MFP subunit  29.97 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3495  RND family efflux transporter MFP subunit  30.67 
 
 		 365 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>