More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1934 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  413  1e-114  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2747  TetR family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.02505  normal  0.237475 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 246 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 240 aa  122  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  38.51 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 260 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 209 aa  106  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 244 aa  106  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  36.93 
 
 		 252 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 770 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 210 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 		 214 aa  94.4  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 208 aa  91.7  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 209 aa  86.3  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 205 aa  85.1  6e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  77.4  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 219 aa  77  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 204 aa  76.6  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 194 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 204 aa  72  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 190 aa  72  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 228 aa  70.9  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3594  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 210 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2869  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 285 aa  67  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3862  regulatory protein, TetR  30.06 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.07928  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  23.53 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0452  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 224 aa  64.7  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 208 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 200 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1851  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.144681  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 213 aa  62.4  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 		 287 aa  60.8  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  26.6 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 214 aa  57.8  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3207  putative transcription regulator protein  31.47 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00713158  normal  0.0476395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 424 aa  57  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3444  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.349562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 234 aa  54.7  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0810  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 437 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4414  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 419 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.617294  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3407  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 422 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.282297 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 186 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>