More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2384 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 530 aa  1045    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  41.87 
 
 		 526 aa  384  1e-105  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.495731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03377  sodium:solute symporter family protein  41.81 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  42.38 
 
 		 542 aa  332  7.000000000000001e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  30.76 
 
 		 581 aa  233  5e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  29.57 
 
 		 520 aa  192  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  28.8 
 
 		 513 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  28.6 
 
 		 513 aa  189  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3352  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.71 
 
 		 479 aa  184  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.27 
 
 		 564 aa  179  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09590  Na+/proline symporter  29.72 
 
 		 501 aa  171  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974546  normal  0.236374 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  32.28 
 
 		 533 aa  169  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  30.04 
 
 		 522 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  28.33 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 883 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1380  SSS sodium solute transporter superfamily  30 
 
 		 562 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.366294 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  30.69 
 
 		 550 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0206  Na+/solute symporter  29.47 
 
 		 470 aa  160  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2866  sodium-solute symporter  32.31 
 
 		 581 aa  159  2e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1518  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.39 
 
 		 892 aa  157  4e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2763  Na+/solute symporter  30.83 
 
 		 472 aa  157  6e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2358  Na+/solute symporter  29.44 
 
 		 472 aa  157  7e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.552943  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  25.52 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  34.18 
 
 		 574 aa  154  5e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5478  Na+/solute symporter  26.27 
 
 		 568 aa  153  7e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0650513 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.7 
 
 		 562 aa  152  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.6 
 
 		 548 aa  151  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  27.19 
 
 		 569 aa  147  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0232  Na+/solute symporter  29.17 
 
 		 467 aa  146  1e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  26.97 
 
 		 523 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1227  Na+/solute symporter  32.8 
 
 		 517 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212817  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.46 
 
 		 533 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2070  Na+/solute symporter  27.54 
 
 		 489 aa  144  3e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  32.04 
 
 		 547 aa  143  6e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  26.59 
 
 		 527 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0195  sodium:solute symporter family protein  29.77 
 
 		 468 aa  143  7e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.97 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  25.61 
 
 		 529 aa  142  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  26.78 
 
 		 526 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  28.44 
 
 		 509 aa  140  3.9999999999999997e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2009  sodium:solute symporter family protein  31.65 
 
 		 473 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.61 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0043  Na+/solute symporter  30.46 
 
 		 565 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.290751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  28.88 
 
 		 509 aa  137  4e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0261  Na+/solute symporter  30.08 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.728087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.05 
 
 		 613 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  29.09 
 
 		 560 aa  133  6e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  24.15 
 
 		 565 aa  134  6e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.8 
 
 		 523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  28.6 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  26.59 
 
 		 566 aa  131  3e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.03 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.86 
 
 		 565 aa  121  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  25.46 
 
 		 474 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  27.02 
 
 		 598 aa  120  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.14 
 
 		 522 aa  120  7e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.37 
 
 		 526 aa  119  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  25.93 
 
 		 592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  34.01 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.61 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  26.02 
 
 		 520 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  27.22 
 
 		 557 aa  115  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.81 
 
 		 483 aa  114  3e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1238  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.34 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.425742 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1203  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.34 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.410205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1223  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.34 
 
 		 498 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.532882 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1193  sodium-glucose/galactose cotransporter  25.34 
 
 		 498 aa  114  5e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0641857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  27.86 
 
 		 557 aa  114  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  26.43 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1101  sodium:solute symporter family protein  24.48 
 
 		 486 aa  112  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.465096 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  24.78 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0304  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.08 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0297  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.08 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.977217  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.21 
 
 		 520 aa  111  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2072  Na+/solute symporter  28.43 
 
 		 609 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0164847 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0129  Na+/solute symporter  27.16 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0303  Na+/solute symporter  25.88 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1869  Na+/solute symporter  29.68 
 
 		 502 aa  108  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.319535 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  25.69 
 
 		 597 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.46 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  27.79 
 
 		 549 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5947  Na+/solute symporter  27.55 
 
 		 509 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  26.61 
 
 		 545 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1047  sodium/solute symporter  27.56 
 
 		 488 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322443  normal  0.451489 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2288  Na+/solute symporter  27.21 
 
 		 593 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.175475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.96 
 
 		 520 aa  105  3e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.39 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  26.74 
 
 		 520 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  24.14 
 
 		 505 aa  103  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3029  Na+/solute symporter  25.62 
 
 		 492 aa  103  7e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.95 
 
 		 522 aa  103  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.18 
 
 		 526 aa  103  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16021  Na+/proline symporter  27.17 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.22 
 
 		 561 aa  100  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0416  sodium/solute symporter family protein  22.14 
 
 		 570 aa  100  6e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.951118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  25.57 
 
 		 562 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.24 
 
 		 472 aa  100  7e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1817  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.5 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4818  Na+/solute symporter  22.8 
 
 		 501 aa  100  9e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  26.39 
 
 		 570 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>