164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1058 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1058  MscS Mechanosensitive ion channel  100 
 
 		 315 aa  631  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2779  hypothetical protein  32.13 
 
 		 313 aa  159  6e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188203  normal  0.0353015 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0474  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 		 320 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0786  MscS mechanosensitive ion channel  33.98 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0154774  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08930  MscS Mechanosensitive ion channel  41.62 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2824  MscS mechanosensitive ion channel  31.72 
 
 		 330 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0697  mechanosensitive ion channel family protein  28.73 
 
 		 509 aa  119  7e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1264  MscS Mechanosensitive ion channel  27.62 
 
 		 536 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.908729  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1073  mechanosensitive ion channel family protein  28.38 
 
 		 535 aa  114  3e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0434  MscS mechanosensitive ion channel  31.13 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.302543  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0086  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  24.08 
 
 		 529 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00266935  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1021  MscS mechanosensitive ion channel  25 
 
 		 548 aa  108  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.69997  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2154  MscS Mechanosensitive ion channel  31.76 
 
 		 316 aa  106  4e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.568534  normal  0.399111 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0855  mechanosensitive ion channel family protein  22.74 
 
 		 526 aa  103  3e-21  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2854  MscS Mechanosensitive ion channel  32.35 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.247394  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1508  MscS Mechanosensitive ion channel  28.93 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0603757 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3884  LigA  27.87 
 
 		 667 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.47617  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4008  MscS mechanosensitive ion channel  27.4 
 
 		 583 aa  100  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.370784 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3992  MscS Mechanosensitive ion channel  27.95 
 
 		 657 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.27926  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0782  mechanosensitive ion channel family protein  26.42 
 
 		 523 aa  99.8  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.916079  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1025  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 523 aa  99  8e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1066  mechanosensitive ion channel family protein  25.1 
 
 		 528 aa  99  9e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000663249  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1087  mechanosensitive ion channel family protein  26.04 
 
 		 523 aa  98.2  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0312609  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5647  MscS mechanosensitive ion channel  29.93 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.560781 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1030  MscS mechanosensitive ion channel  30.53 
 
 		 408 aa  93.2  5e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1690  MscS mechanosensitive ion channel  28.98 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0949  MscS Mechanosensitive ion channel  23.91 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05165  hypothetical protein  25.75 
 
 		 282 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001280  small-conductance mechanosensitive channel  24.14 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  22.38 
 
 		 258 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1674  MscS mechanosensitive ion channel  25.71 
 
 		 270 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.702305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00921  small conductance mechanosensitive ion channel  22.65 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.230623  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0966  mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.247343  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0592  small conductance mechanosensitive ion channel  26.75 
 
 		 305 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.311151  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  25 
 
 		 281 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  57  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01814  MscS Mechanosensitive ion channel  21.78 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000781562  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.93 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.881892  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2760  MscS Mechanosensitive ion channel  26.17 
 
 		 344 aa  55.5  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.394899  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  22.86 
 
 		 274 aa  55.1  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2475  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 334 aa  55.8  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.288536  normal  0.672517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1959  MscS mechanosensitive ion channel  25.17 
 
 		 278 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00109223  normal  0.0228344 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4382  MscS mechanosensitive ion channel  25.89 
 
 		 262 aa  55.5  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.496887  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1966  hypothetical protein  21.8 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1496  MscS Mechanosensitive ion channel  29.1 
 
 		 295 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  27.94 
 
 		 280 aa  53.9  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1094  hypothetical protein  24.69 
 
 		 291 aa  54.3  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.658963  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  31.34 
 
 		 238 aa  53.9  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  24.2 
 
 		 1144 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  22.05 
 
 		 287 aa  53.5  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  22.73 
 
 		 273 aa  53.5  0.000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2316  mechanosensitive ion channel family protein  26.83 
 
 		 773 aa  53.1  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0155  MscS mechanosensitive ion channel  23.98 
 
 		 300 aa  53.1  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3337  mechanosensitive channel MscS  23.36 
 
 		 284 aa  52.8  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.306942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  21.67 
 
 		 286 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13183  putative mechanosensitive channel protein (MscS family)  24.75 
 
 		 316 aa  52.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  24.26 
 
 		 286 aa  52.4  0.000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  20.64 
 
 		 291 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2755  MscS mechanosensitive ion channel:conserved TM helix  30.89 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  21.67 
 
 		 286 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  20.28 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3240  mechanosensitive channel MscS  20.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  24.63 
 
 		 264 aa  51.2  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5589  putative MscS mechanosensitive ion channel protein  28.1 
 
 		 275 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.204924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  20.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3409  mechanosensitive channel MscS  20.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.427229  normal  0.109816 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3229  mechanosensitive channel MscS  20.74 
 
 		 286 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  25.76 
 
 		 288 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2731  MscS mechanosensitive ion channel  23.53 
 
 		 282 aa  51.2  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0729456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  28.37 
 
 		 275 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  25.76 
 
 		 288 aa  50.8  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1220  MscS mechanosensitive ion channel  26.77 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0859387 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0508  MscS Mechanosensitive ion channel  24.03 
 
 		 566 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3690  MscS mechanosensitive ion channel  26.97 
 
 		 290 aa  50.4  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0663  MscS Mechanosensitive ion channel  27.27 
 
 		 336 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  26.32 
 
 		 266 aa  50.1  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  24.74 
 
 		 351 aa  49.7  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  23.59 
 
 		 269 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3100  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 820 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.416731  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5267  MscS mechanosensitive ion channel  26.34 
 
 		 820 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.269062  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01983  MscS Mechanosensitive ion channel ei VT8  28.64 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  24.78 
 
 		 297 aa  48.9  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0556  MscS Mechanosensitive ion channel  19.79 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1530  MscS Mechanosensitive ion channel  24.76 
 
 		 372 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.421553 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08271  hypothetical protein  29.27 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  27.21 
 
 		 291 aa  47.4  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  26 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3271  putative small conductance mechanosensitive ion channel  27.07 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.451043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0259  MscS mechanosensitive ion channel  22.95 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2128  MscS mechanosensitive ion channel  24.35 
 
 		 270 aa  47.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0986  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 		 808 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722323  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2070  mechanosensitive ion channel family protein  26.44 
 
 		 809 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.563687  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2125  small conductance mechanosensitive ion channel (MscS) family protein  26.44 
 
 		 809 aa  47  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0467602  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3896  MscS Mechanosensitive ion channel  21.84 
 
 		 283 aa  47  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>