121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2998 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_0664  hypothetical protein  56.47 
 
 		 755 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.101783 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4846  cell wall anchor domain-containing protein  53.47 
 
 		 750 aa  661    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.818339  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2295  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  55.78 
 
 		 755 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2738  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  88.79 
 
 		 794 aa  1348    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2998  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  100 
 
 		 791 aa  1598    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337723  normal  0.523415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5132  cell wall anchor domain-containing protein  53.54 
 
 		 761 aa  617  1e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.137427 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1400  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  53.86 
 
 		 732 aa  610  1e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1395  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  52.75 
 
 		 723 aa  611  1e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.670427  normal  0.959342 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1675  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  53.86 
 
 		 738 aa  609  1e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.461102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5519  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  50.88 
 
 		 725 aa  593  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2150  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  48.2 
 
 		 740 aa  583  1.0000000000000001e-165  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.270447 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5161  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  50.82 
 
 		 729 aa  547  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.997936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2516  cell wall anchor domain-containing protein  36.48 
 
 		 789 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.27375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3922  vault protein inter-alpha-trypsin  41.51 
 
 		 701 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1739  cell wall anchor domain-containing protein  38.8 
 
 		 757 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.491148  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1843  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.15 
 
 		 771 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.327396  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2448  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  37.01 
 
 		 772 aa  435  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0017334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2410  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  40.25 
 
 		 751 aa  429  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.177672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1829  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.15 
 
 		 772 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0709098  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1877  cell wall anchor domain-containing protein  37.43 
 
 		 771 aa  431  1e-119  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.581761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0122  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  37.42 
 
 		 763 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2200  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.88 
 
 		 759 aa  429  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2277  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  39.85 
 
 		 755 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3684  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.96 
 
 		 712 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2492  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.73 
 
 		 770 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0368823  normal  0.695275 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1625  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  35.08 
 
 		 722 aa  412  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.466384  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2195  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  37.65 
 
 		 760 aa  405  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2124  cell wall anchor domain-containing protein  38.19 
 
 		 739 aa  394  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0949935  normal  0.0697413 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1793  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  37.46 
 
 		 776 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.216106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4136  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  36.3 
 
 		 1362 aa  338  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332177 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3379  von Willebrand factor type A domain-containing protein  34.44 
 
 		 786 aa  333  7.000000000000001e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1352  von Willebrand factor, type A  33.12 
 
 		 819 aa  313  6.999999999999999e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0364534  normal  0.0483698 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2003  inter-alpha-trypsin inhibitor domain-containing protein  33.63 
 
 		 753 aa  313  6.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0804312  normal  0.260211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2383  Vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  33.17 
 
 		 831 aa  283  7.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151834  hitchhiker  0.00156967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2742  hypothetical protein  35.26 
 
 		 774 aa  278  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.603837  normal  0.495762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1325  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  31.66 
 
 		 812 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000380778  hitchhiker  0.00814208 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0028  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  30.39 
 
 		 701 aa  272  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.880979  normal  0.680993 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0140  hypothetical protein  32.08 
 
 		 711 aa  270  1e-70  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0386904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0022  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  30.94 
 
 		 691 aa  270  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1318  vault protein inter-alpha-trypsin domain-containing protein  32.84 
 
 		 796 aa  253  8.000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.287979 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4515  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.9 
 
 		 795 aa  250  9e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1994  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.57 
 
 		 671 aa  244  5e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.204714  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4460  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  31.98 
 
 		 1033 aa  236  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.743014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2070  hypothetical protein  28.4 
 
 		 776 aa  235  2.0000000000000002e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3108  von Willebrand factor type A (vWA) domain-containing protein  27.59 
 
 		 713 aa  165  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0355813 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2129  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 		 833 aa  165  4.0000000000000004e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2332  von Willebrand factor type A  23.97 
 
 		 775 aa  160  1e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161725 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1710  von Willebrand factor type A  26.68 
 
 		 840 aa  151  6e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3690  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  24.2 
 
 		 680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05364  von Willebrand domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G01160)  25.62 
 
 		 1109 aa  94  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.520514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1806  vault protein inter-alpha-trypsin subunit  27.56 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.825295  normal  0.327255 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0755  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 		 418 aa  75.5  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3616  von Willebrand factor, type A  31.03 
 
 		 479 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.304653  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1843  von Willebrand factor, type A  27.57 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122736  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2951  von Willebrand factor type A  23.94 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3119  von Willebrand factor type A  29.15 
 
 		 393 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3275  von Willebrand factor type A  26.55 
 
 		 419 aa  69.7  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1307  von Willebrand factor, type A  26.8 
 
 		 418 aa  67.4  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0723  von Willebrand factor type A  26.17 
 
 		 419 aa  67  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0959383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4043  von Willebrand factor type A  25.94 
 
 		 423 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3164  hypothetical protein  28.48 
 
 		 1120 aa  63.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.875829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5207  von Willebrand factor type A  26.78 
 
 		 412 aa  62.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000146018 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1308  von Willebrand factor, type A  25.39 
 
 		 427 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2244  von Willebrand factor, type A  25.3 
 
 		 416 aa  62  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0785649  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0166  von Willebrand factor type A  29.53 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.345771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1463  von Willebrand factor, type A  27.87 
 
 		 425 aa  59.7  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197313  normal  0.691375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1359  von Willebrand factor, type A  29.31 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00054034  normal  0.0176573 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4211  von Willebrand factor type A  25.73 
 
 		 415 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.290242  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3203  von Willebrand factor type A  26.13 
 
 		 421 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.231871  normal  0.719364 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0262  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0264  von Willebrand factor type A  25 
 
 		 418 aa  57.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7173  von Willebrand factor type A  25.76 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1234  von Willebrand factor type A  25.52 
 
 		 412 aa  57.4  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.723207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3380  von Willebrand factor, type A  29.95 
 
 		 459 aa  57  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178617  hitchhiker  0.00546751 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5121  von Willebrand factor type A  28.49 
 
 		 419 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.104188  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4210  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 421 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.466753  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3644  von Willebrand factor type A  35.17 
 
 		 589 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3260  von Willebrand factor type A  34.06 
 
 		 903 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0740764 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3001  von Willebrand factor type A  30.18 
 
 		 365 aa  55.1  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1819  Vault protein inter-alpha-trypsin domain protein  23.28 
 
 		 963 aa  54.7  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.541917  normal  0.345133 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1383  von Willebrand factor, type A  22.88 
 
 		 363 aa  54.3  0.000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.130674  hitchhiker  0.0000484488 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4385  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.32 
 
 		 451 aa  54.3  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2162  von Willebrand factor type A  27.5 
 
 		 425 aa  54.3  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.314741  hitchhiker  0.000328198 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4186  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 		 828 aa  53.9  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2631  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.69 
 
 		 442 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.813188  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1244  von Willebrand factor, type A  24.47 
 
 		 412 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.427731  normal  0.129489 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2799  von Willebrand factor, type A  30.97 
 
 		 561 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0384  von Willebrand factor type A  30.05 
 
 		 423 aa  53.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0045  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 902 aa  53.1  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2768  von Willebrand factor, type A  26.51 
 
 		 412 aa  52  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.271285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2191  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 546 aa  52  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2950  von Willebrand factor type A  22.38 
 
 		 426 aa  51.6  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2394  von Willebrand factor type A  26.56 
 
 		 412 aa  51.6  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_54892  predicted protein  30.09 
 
 		 523 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3732  von Willebrand factor type A  26.5 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.285175  normal  0.068193 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0295  vault protein inter-alpha-trypsin  27.48 
 
 		 995 aa  50.8  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00370516  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17360  uncharacterized protein containing a von Willebrand factor type A (vWA) domain  26.37 
 
 		 629 aa  50.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.390594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3093  von Willebrand factor type A  29.66 
 
 		 340 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.397727 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0400  von Willebrand factor type A  31.37 
 
 		 476 aa  48.9  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2577  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 562 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>