264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2890 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  60.41 
 
 		 609 aa  693    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  100 
 
 		 621 aa  1267    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  60.41 
 
 		 609 aa  693    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  89.92 
 
 		 623 aa  1127    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  89.03 
 
 		 623 aa  1140    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  71.59 
 
 		 612 aa  878    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  60.44 
 
 		 612 aa  696    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  61.11 
 
 		 600 aa  702    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  60.39 
 
 		 599 aa  695    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  60.73 
 
 		 609 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  60.57 
 
 		 609 aa  693    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  60.76 
 
 		 590 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  61.21 
 
 		 599 aa  697    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  61.81 
 
 		 597 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  61.26 
 
 		 596 aa  705    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  69.9 
 
 		 604 aa  853    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  61.43 
 
 		 596 aa  706    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  61.21 
 
 		 599 aa  697    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  60.41 
 
 		 609 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  60.41 
 
 		 609 aa  693    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  60.07 
 
 		 622 aa  691    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  61.21 
 
 		 599 aa  697    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  61.28 
 
 		 599 aa  688    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  52.41 
 
 		 604 aa  609  1e-173  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  55.23 
 
 		 615 aa  608  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  46.99 
 
 		 588 aa  544  1e-153  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  47.15 
 
 		 588 aa  543  1e-153  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  47.56 
 
 		 592 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  46.99 
 
 		 588 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  48.7 
 
 		 587 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  46.83 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  46.67 
 
 		 588 aa  536  1e-151  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  46.99 
 
 		 588 aa  534  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  46.67 
 
 		 588 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2326  peptidase M61  45.71 
 
 		 591 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  46.5 
 
 		 588 aa  525  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1521  peptidase M61 domain-containing protein  45.77 
 
 		 585 aa  521  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  44.41 
 
 		 601 aa  496  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  45.41 
 
 		 584 aa  481  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  46.03 
 
 		 593 aa  474  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  45.86 
 
 		 593 aa  472  1.0000000000000001e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  46.07 
 
 		 592 aa  469  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  47.62 
 
 		 571 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4645  peptidase M61 domain protein  49.26 
 
 		 618 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1123  peptidase M61  45.48 
 
 		 613 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  48.43 
 
 		 597 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1574  peptidase M61  44.34 
 
 		 608 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  47.7 
 
 		 600 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  46.33 
 
 		 641 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  48.81 
 
 		 578 aa  440  9.999999999999999e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0139  peptidase M61 domain-containing protein  41.69 
 
 		 594 aa  429  1e-119  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.554746  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0152  peptidase M61 domain protein  41.81 
 
 		 593 aa  423  1e-117  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.125794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  43.8 
 
 		 602 aa  425  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  38.25 
 
 		 616 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01914  protease, putative  38.1 
 
 		 602 aa  388  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0353072  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  41.92 
 
 		 607 aa  387  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  41.92 
 
 		 617 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  38.7 
 
 		 601 aa  369  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  35.36 
 
 		 594 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  38.33 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  34.04 
 
 		 594 aa  353  5e-96  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  39.26 
 
 		 585 aa  353  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  35.56 
 
 		 585 aa  344  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  36.32 
 
 		 631 aa  341  2e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  40.65 
 
 		 584 aa  341  2.9999999999999998e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  33.01 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  33.01 
 
 		 601 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  34.65 
 
 		 590 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3363  peptidase M61 domain protein  39.08 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  35.88 
 
 		 661 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  31.87 
 
 		 600 aa  329  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  40.1 
 
 		 585 aa  323  7e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0311  peptidase M61  36.97 
 
 		 648 aa  319  7.999999999999999e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.609176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  34.38 
 
 		 587 aa  317  3e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  33.61 
 
 		 596 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  32.99 
 
 		 618 aa  306  8.000000000000001e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  33.77 
 
 		 591 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  37.68 
 
 		 585 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  36.4 
 
 		 689 aa  279  9e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  30.82 
 
 		 616 aa  241  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  26.95 
 
 		 610 aa  236  8e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  28.27 
 
 		 605 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  28.85 
 
 		 603 aa  225  2e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  28.43 
 
 		 605 aa  224  3e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  27.97 
 
 		 605 aa  224  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  28.18 
 
 		 608 aa  224  4e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  28.1 
 
 		 605 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  29.04 
 
 		 603 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  28.36 
 
 		 603 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  28.27 
 
 		 603 aa  212  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  28.55 
 
 		 624 aa  207  3e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  28.2 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  28.67 
 
 		 598 aa  203  7e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1386  PDZ/DHR/GLGF  29.4 
 
 		 545 aa  202  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  27.53 
 
 		 601 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1102  PDZ/DHR/GLGF  28.6 
 
 		 565 aa  197  3e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0587047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  27.66 
 
 		 598 aa  197  6e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  30.06 
 
 		 497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15101  PDZ domain-containing protein  26.96 
 
 		 565 aa  182  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.185527 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3920  peptidase M61 domain protein  31.18 
 
 		 528 aa  181  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144473  normal  0.231177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>