More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0428 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0428  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  558  1e-158  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.249302  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2684  polysaccharide deacetylase  78.89 
 
 		 294 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.569149 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0316  polysaccharide deacetylase  73.14 
 
 		 287 aa  391  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0777924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2151  polysaccharide deacetylase  79.29 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342073  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  74.73 
 
 		 287 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2765  polysaccharide deacetylase  79.29 
 
 		 294 aa  391  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.468013  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6095  polysaccharide deacetylase  78.99 
 
 		 297 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.233371  normal  0.603331 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2817  polysaccharide deacetylase  80.59 
 
 		 300 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3302  polysaccharide deacetylase  63.47 
 
 		 272 aa  314  9.999999999999999e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.229858  normal  0.446106 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2751  transmembrane protein  59.49 
 
 		 283 aa  305  6e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1373  polysaccharide deacetylase  61.45 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00379023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5979  polysaccharide deacetylase  56.52 
 
 		 285 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.185285  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4706  polysaccharide deacetylase  58.59 
 
 		 286 aa  281  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0236101 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3928  polysaccharide deacetylase  58.95 
 
 		 289 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.284883  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2215  putative transmembrane protein  59.61 
 
 		 288 aa  275  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.814206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4179  polysaccharide deacetylase  54.34 
 
 		 266 aa  269  5e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3983  polysaccharide deacetylase  51.97 
 
 		 284 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1323  polysaccharide deacetylase family protein  60.23 
 
 		 300 aa  251  1e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.202061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2675  polysaccharide deacetylase  54.12 
 
 		 280 aa  248  8e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0615547  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0920  polysaccharide deacetylase family protein  55.77 
 
 		 270 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0930  polysaccharide deacetylase  44.49 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0787  polysaccharide deacetylase family protein  44.92 
 
 		 349 aa  186  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29381  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3369  polysaccharide deacetylase  40.32 
 
 		 259 aa  144  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.792887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1557  acetylxylan esterase  40.47 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.956674  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1497  polysaccharide deacetylase  39.58 
 
 		 275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.507826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  35.71 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1086  polysaccharide deacetylase  35.38 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03855  polysaccharide deacetylase, putative  28.51 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2113  GlcNAc deacetylase-related protein carbohydrate esterase family 4 protein  35.98 
 
 		 259 aa  116  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.228742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5206  polysaccharide deacetylase  42.31 
 
 		 259 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2417  polysaccharide deacetylase  45.57 
 
 		 280 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.108367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02423  acetylxylan esterase  40.78 
 
 		 260 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1541  polysaccharide deacetylase  43.02 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0577624  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4717  polysaccharide deacetylase  37.43 
 
 		 285 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1446  polysaccharide deacetylase  40.72 
 
 		 280 aa  109  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.781341  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1868  polysaccharide deacetylase  33.7 
 
 		 258 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.42 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0991  polysaccharide deacetylase family protein  27.69 
 
 		 244 aa  106  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0970  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 479 aa  105  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.064586  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  36.41 
 
 		 404 aa  103  2e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1141  glycosyl transferase/polysaccharide deacetylase family protein  31.6 
 
 		 481 aa  103  4e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.226715  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_959  glycosyl transferase  32.16 
 
 		 479 aa  102  6e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4749  polysaccharide deacetylase  29.57 
 
 		 240 aa  102  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0771  polysaccharide deacetylase  29.21 
 
 		 299 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  38.42 
 
 		 235 aa  102  8e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1912  polysaccharide deacetylase  39.18 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  31.37 
 
 		 387 aa  102  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0797  polysaccharide deacetylase  28.57 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0108437  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0633  polysaccharide deacetylase  31.22 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.256712 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3452  chitin deacetylase  31.85 
 
 		 373 aa  100  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.203782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0739  polysaccharide deacetylase  31.12 
 
 		 324 aa  99.8  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000774609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1295  polysaccharide deacetylase  30.34 
 
 		 305 aa  99.4  6e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0475838  normal  0.758896 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1762  polysaccharide deacetylase  28.46 
 
 		 243 aa  97.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4627  polysaccharide deacetylase  35.75 
 
 		 283 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474117  hitchhiker  0.00736578 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4797  polysaccharide deacetylase  30.72 
 
 		 277 aa  95.5  9e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0647  polysaccharide deacetylase  38.19 
 
 		 204 aa  95.1  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2798  polysaccharide deacetylase  28.5 
 
 		 321 aa  94.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  28.36 
 
 		 247 aa  95.1  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  35.23 
 
 		 413 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 275 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2978  polysaccharide deacetylase  40.49 
 
 		 205 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000961865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0643  polysaccharide deacetylase  33.02 
 
 		 425 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1500  polysaccharide deacetylase  29.25 
 
 		 320 aa  93.6  3e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.101957  normal  0.04925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2789  xylanase/chitin deacetylase  36.52 
 
 		 244 aa  93.6  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  36.82 
 
 		 352 aa  93.2  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  38.46 
 
 		 430 aa  93.2  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 275 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3304  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  33.52 
 
 		 241 aa  93.2  4e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0113  polysaccharide deacetylase  32.66 
 
 		 503 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0646  polysaccharide deacetylase  36.19 
 
 		 275 aa  92.8  6e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3726  putative polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 220 aa  92.4  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.577927  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  30.27 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 275 aa  92.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  31.55 
 
 		 275 aa  92  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  30.22 
 
 		 275 aa  92  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3410  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.76502  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3371  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1224  polysaccharide deacetylase  36.21 
 
 		 392 aa  91.7  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.533397  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3321  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 213 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3679  polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 213 aa  91.7  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0628  polysaccharide deacetylase  35.42 
 
 		 268 aa  91.7  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0237416 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.32 
 
 		 221 aa  91.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2712  polysaccharide deacetylase  31.25 
 
 		 204 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  32.05 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2266  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  34.81 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.33444  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1998  putative polysaccharide deacetylase  29.73 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.26029e-43 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2237  polysaccharide deacetylase  33.16 
 
 		 215 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2145  polysaccharide deacetylase  33.65 
 
 		 201 aa  90.5  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0200  polysaccharide deacetylase  33.12 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0824  polysaccharide deacetylase family protein  29.24 
 
 		 417 aa  90.5  3e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00745261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1591  putative polysaccharide deacetylase  34.07 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0184011 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6185  polysaccharide deacetylase  37.74 
 
 		 217 aa  90.1  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.307071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3629  putative polysaccharide deacetylase  33.52 
 
 		 241 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.197208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01375  polysaccharide deacetylase  31.98 
 
 		 218 aa  90.1  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1829  polysaccharide deacetylase  27.23 
 
 		 300 aa  89.7  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000043926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  30 
 
 		 405 aa  89.4  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7875  polysaccharide deacetylase  31.6 
 
 		 752 aa  89.4  6e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2298  polysaccharide deacetylase  29.71 
 
 		 372 aa  89.4  7e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00169633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3012  polysaccharide deacetylase  32.43 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000529365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>