More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3724 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3724  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 358 aa  710    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  99.72 
 
 		 358 aa  707    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3243  hypothetical protein  75.49 
 
 		 356 aa  489  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.87962  normal  0.136088 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4695  signal transduction histidine kinase  40.85 
 
 		 364 aa  219  7e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.910371  normal  0.12529 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4553  signal transduction histidine kinase  40.64 
 
 		 351 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.486913 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4182  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  40.84 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3812  signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.255567  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4851  signal transduction histidine kinase  39.01 
 
 		 382 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.141965  normal  0.0517417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1678  signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 		 348 aa  199  6e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.293126  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1806  putative two-component sensor histidine kinase  35.9 
 
 		 341 aa  196  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2753  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 325 aa  152  8e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 603 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  31.92 
 
 		 744 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 		 532 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 878 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 		 347 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 932 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 674 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1109  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 501 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.366346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 815 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 		 681 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5895  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 356 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.677371  normal  0.686603 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8307  putative signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 		 497 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.140335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 		 1093 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 964 aa  103  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2909  signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 487 aa  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0896  signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 839 aa  103  5e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.335338  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 1093 aa  103  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3735  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 1183 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.709518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 		 832 aa  102  9e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3695  signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 503 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.316743  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 		 698 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 		 3706 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 764 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 991 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3696  signal transduction histidine kinase  35.21 
 
 		 514 aa  102  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.87063 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 941 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1894  PAS sensor protein  34.18 
 
 		 387 aa  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.383857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1535  sensory transduction histidine kinase  25.74 
 
 		 682 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  28.25 
 
 		 1390 aa  101  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 526 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2397  signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 		 493 aa  100  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.62445  hitchhiker  0.00117344 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3760  signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 		 511 aa  100  4e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0075  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 358 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232772  normal  0.0544453 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 790 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  29.8 
 
 		 1253 aa  100  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 732 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 1560 aa  99.8  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 613 aa  99.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 1654 aa  99.4  9e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3728  signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.979777  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 382 aa  99  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1712  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  35.15 
 
 		 491 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0090  signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4326  signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 782 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.173856 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0970  signal transduction histidine kinase  36.24 
 
 		 520 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.183244  normal  0.273355 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 		 488 aa  97.4  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 		 771 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 547 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  30.94 
 
 		 657 aa  96.3  7e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1534  signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.076798 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  28.65 
 
 		 1239 aa  95.5  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 		 662 aa  95.9  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 872 aa  95.9  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2118  signal transduction histidine kinase  28.91 
 
 		 572 aa  95.9  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 570 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 439 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 1227 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0327  histidine kinase, dimerisation/phosphoacceptor  31.28 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0659976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30710  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 		 512 aa  94  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.523604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 215 aa  94  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  31.09 
 
 		 1668 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  30.1 
 
 		 752 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4185  signal transduction histidine kinase  37.31 
 
 		 494 aa  93.6  5e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11268  histidine kinase sensor protein  28.43 
 
 		 624 aa  93.2  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5039  signal transduction histidine kinase  31.3 
 
 		 381 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2255  signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 648 aa  93.2  6e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.56353  normal  0.716596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1382  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 496 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1400  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 496 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1781  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 496 aa  93.2  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.525963 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1051 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1416  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 496 aa  92.8  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 382 aa  92.8  8e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  25.7 
 
 		 757 aa  92.8  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3478  putative signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 354 aa  92  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  28.93 
 
 		 746 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4408  signal transduction histidine kinase  30.57 
 
 		 408 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.488817 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 		 771 aa  92.4  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  29.11 
 
 		 783 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4686  signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 496 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0201363  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6290  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0664  Signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 344 aa  92  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 945 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4986  signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 864 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1193  sensory transduction regulatory protein  31.71 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1292  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 492 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 		 912 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>