More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4997 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  73.66 
 
 		 1385 aa  845    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  73.3 
 
 		 866 aa  840    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3881  YD repeat-containing protein  74.95 
 
 		 1386 aa  860    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4081  Rhs family protein  89.2 
 
 		 1140 aa  867    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.451767  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  84.71 
 
 		 1229 aa  969    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4986  YD repeat-containing protein  97.61 
 
 		 1409 aa  1103    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4990  YD repeat-containing protein  92.78 
 
 		 867 aa  1044    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4997  YD repeat-containing protein  100 
 
 		 555 aa  1146    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  74.03 
 
 		 1411 aa  848    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  73.3 
 
 		 1400 aa  841    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  97.01 
 
 		 480 aa  548  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  69.48 
 
 		 561 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  97.12 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0373  Rhs family protein  79.45 
 
 		 855 aa  362  1e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6085  YD repeat-containing protein  39.04 
 
 		 1410 aa  346  7e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  38.11 
 
 		 1418 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  38.11 
 
 		 1390 aa  334  3e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  38.11 
 
 		 1402 aa  333  4e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  37.24 
 
 		 1531 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  35.41 
 
 		 1419 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  37.25 
 
 		 1421 aa  295  2e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  35.71 
 
 		 1362 aa  295  2e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  35.91 
 
 		 1446 aa  293  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  35.46 
 
 		 1530 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4994  rhs-related protein  97.08 
 
 		 137 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1583 aa  279  8e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  33.97 
 
 		 1604 aa  276  5e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  33.56 
 
 		 1554 aa  276  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  33.01 
 
 		 1586 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  36.23 
 
 		 1568 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  33.89 
 
 		 1379 aa  271  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  36.05 
 
 		 924 aa  270  5e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  35.09 
 
 		 1348 aa  267  4e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  33.44 
 
 		 1602 aa  264  3e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  34.29 
 
 		 1359 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  31.21 
 
 		 1654 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  31.75 
 
 		 1527 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  32.97 
 
 		 1520 aa  232  2e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  32.37 
 
 		 1547 aa  228  2e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  31.42 
 
 		 1551 aa  227  4e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  31.1 
 
 		 1550 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6684  YD repeat-containing protein  30.71 
 
 		 1149 aa  218  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.198743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  32.54 
 
 		 1609 aa  218  2.9999999999999998e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3017  YD repeat-containing protein  29.77 
 
 		 1149 aa  210  4e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0168  Rhs1 protein  28.42 
 
 		 1150 aa  210  5e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1615  Rhs1 protein  28.42 
 
 		 1150 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0145  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  28.42 
 
 		 1150 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  30.78 
 
 		 1560 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  30.92 
 
 		 1620 aa  205  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2612  YD repeat-containing protein  75 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.346414 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0131  Rhs1 protein  28.15 
 
 		 1150 aa  200  6e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.462528  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.24 
 
 		 1573 aa  186  7e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  31.82 
 
 		 1611 aa  186  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  27.7 
 
 		 1626 aa  182  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  30.09 
 
 		 1576 aa  181  4e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  34.11 
 
 		 553 aa  178  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  30.12 
 
 		 1614 aa  177  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  27.7 
 
 		 1319 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5438  Rhs family protein  29.63 
 
 		 1572 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.196818  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.67 
 
 		 1981 aa  161  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  27.56 
 
 		 1317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  27.16 
 
 		 1429 aa  154  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2570  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1565 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.332337  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2577  YD repeat-containing protein  30.26 
 
 		 1565 aa  149  9e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.328115  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  29.23 
 
 		 1268 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  28.8 
 
 		 1415 aa  146  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  27.95 
 
 		 1586 aa  145  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  29 
 
 		 1405 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  27.95 
 
 		 1595 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  28.75 
 
 		 1398 aa  144  6e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  28.92 
 
 		 1400 aa  143  7e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  29.14 
 
 		 1426 aa  141  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  27.51 
 
 		 1417 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  29.05 
 
 		 1429 aa  140  7e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  27.09 
 
 		 1410 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3519  YD repeat protein  25.22 
 
 		 1508 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0534715  normal  0.146276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  27.6 
 
 		 1251 aa  139  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  28.85 
 
 		 1426 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  28.85 
 
 		 1200 aa  138  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1216 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1426 aa  139  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  27.43 
 
 		 1199 aa  136  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0572  YD repeat protein  26.21 
 
 		 1509 aa  135  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.442069  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  26.13 
 
 		 1490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3344  PAAR  30.02 
 
 		 1494 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0030504  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  26.26 
 
 		 1525 aa  134  3e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5023  YD repeat-containing protein  30.02 
 
 		 1494 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00366927  normal  0.185239 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1528 aa  134  6e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4951  YD repeat-containing protein  28.71 
 
 		 1495 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.746977 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  27.05 
 
 		 1411 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  27.04 
 
 		 1509 aa  133  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5261  YD repeat-containing protein  29.64 
 
 		 1487 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792751 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  27.26 
 
 		 1397 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  27.43 
 
 		 1388 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  27.43 
 
 		 1308 aa  130  7.000000000000001e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8635  YD repeat protein  25.83 
 
 		 1489 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  26.52 
 
 		 1405 aa  130  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  29.71 
 
 		 598 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1411 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  27.26 
 
 		 1397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>