More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1060 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  69.3 
 
 		 595 aa  851    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  54.53 
 
 		 605 aa  655    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  68.96 
 
 		 595 aa  850    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  68.29 
 
 		 595 aa  839    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  100 
 
 		 596 aa  1207    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  49.92 
 
 		 611 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  49.92 
 
 		 611 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  49.92 
 
 		 611 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  48.91 
 
 		 611 aa  569  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  49.64 
 
 		 594 aa  513  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  48.79 
 
 		 594 aa  509  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  48.79 
 
 		 594 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  49.72 
 
 		 594 aa  505  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  47.37 
 
 		 611 aa  499  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  48.28 
 
 		 599 aa  501  1e-140  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  48.26 
 
 		 594 aa  499  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  48.53 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  48.26 
 
 		 594 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 594 aa  500  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 613 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  48.64 
 
 		 592 aa  498  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  46.89 
 
 		 604 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  46.14 
 
 		 596 aa  491  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  46.68 
 
 		 595 aa  488  1e-136  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  46.98 
 
 		 601 aa  482  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  44.84 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  44.84 
 
 		 598 aa  484  1e-135  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  48.43 
 
 		 622 aa  479  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  44.71 
 
 		 594 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  46.51 
 
 		 597 aa  477  1e-133  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  47.67 
 
 		 600 aa  476  1e-133  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  45.78 
 
 		 613 aa  472  1e-132  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 600 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  47.18 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  45.47 
 
 		 557 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  47.05 
 
 		 595 aa  468  9.999999999999999e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  45.07 
 
 		 557 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  45.25 
 
 		 603 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  44.63 
 
 		 557 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  45.22 
 
 		 561 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  42.29 
 
 		 595 aa  443  1e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  42.29 
 
 		 595 aa  442  9.999999999999999e-123  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.15 
 
 		 558 aa  415  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.78 
 
 		 564 aa  409  1.0000000000000001e-112  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.89 
 
 		 554 aa  405  1e-111  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.14 
 
 		 555 aa  405  1e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 553 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.8 
 
 		 553 aa  396  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41 
 
 		 871 aa  395  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.45 
 
 		 558 aa  393  1e-108  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.66 
 
 		 787 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.85 
 
 		 573 aa  389  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.52 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.89 
 
 		 562 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 571 aa  382  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.75 
 
 		 571 aa  385  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.55 
 
 		 563 aa  381  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 577 aa  380  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 559 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.84 
 
 		 570 aa  375  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.77 
 
 		 563 aa  374  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.17 
 
 		 570 aa  375  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 564 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  39.15 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.96 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.05 
 
 		 566 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.27 
 
 		 553 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.16 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.08 
 
 		 599 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.48 
 
 		 599 aa  368  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.72 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  38.56 
 
 		 546 aa  368  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.26 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.46 
 
 		 571 aa  365  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 527 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 557 aa  368  1e-100  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 553 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.62 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.81 
 
 		 568 aa  365  2e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.62 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  38.54 
 
 		 823 aa  364  3e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  34.5 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 557 aa  363  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  37.41 
 
 		 806 aa  363  6e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.68 
 
 		 520 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.81 
 
 		 568 aa  362  8e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  39.81 
 
 		 520 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  46.74 
 
 		 522 aa  362  1e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  46.48 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  46.48 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  46.48 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.05 
 
 		 561 aa  361  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 565 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  39.23 
 
 		 563 aa  360  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.4 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  46.21 
 
 		 499 aa  359  6e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  36.74 
 
 		 561 aa  359  6e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.83 
 
 		 568 aa  359  8e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>