More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2188 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_2188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 442 aa  903    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  26.39 
 
 		 377 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 291 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  32.85 
 
 		 3145 aa  78.6  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  38.66 
 
 		 718 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  40.38 
 
 		 626 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  40.38 
 
 		 614 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  39.42 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  39.42 
 
 		 626 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  39.42 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  39.42 
 
 		 614 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  38.83 
 
 		 626 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1394  DNA polymerase III subunit epsilon  39.08 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00500752  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4301  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 		 361 aa  67.4  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.406426  normal  0.198903 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1655  DNA polymerase III subunit epsilon  37.93 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.312969  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 		 878 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  29.6 
 
 		 909 aa  66.6  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0937  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376157  normal  0.159475 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0825  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 739 aa  66.6  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.423694  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4422  TPR repeat-containing protein  26.22 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  30.91 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  36.94 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 681 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1683  TPR repeat-containing protein  25.55 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 576 aa  63.2  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  32.77 
 
 		 4079 aa  63.5  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  38 
 
 		 612 aa  63.2  0.000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 637 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.52 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.17 
 
 		 810 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 833 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  32.46 
 
 		 733 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 637 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 828 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 828 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 833 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  36.63 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  37 
 
 		 636 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.27 
 
 		 632 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  30.08 
 
 		 622 aa  61.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  26.76 
 
 		 816 aa  60.5  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18211  hypothetical protein  30.56 
 
 		 603 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.905605 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1170  TPR repeat-containing protein  34.19 
 
 		 472 aa  60.1  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  30.63 
 
 		 685 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 2651 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 1979 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 643 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 708 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 3172 aa  59.7  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14411  Flp pilus assembly protein TadD  29.37 
 
 		 594 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00033533 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1746  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 615 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  26.77 
 
 		 936 aa  58.9  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1759  TPR repeat-containing protein  29.92 
 
 		 207 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 639 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  29.46 
 
 		 340 aa  58.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 762 aa  58.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  26.15 
 
 		 430 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  33.63 
 
 		 789 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.65 
 
 		 217 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  28.65 
 
 		 643 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  31.36 
 
 		 688 aa  57.8  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5820  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.87 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  32.35 
 
 		 545 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2482  sulfotransferase TPR domain-containing protein  29.01 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.99645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  29.46 
 
 		 764 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  28.12 
 
 		 865 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 697 aa  56.6  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0699  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 563 aa  56.6  0.0000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000888687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 697 aa  56.6  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  33.07 
 
 		 686 aa  55.8  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 673 aa  55.8  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  32.41 
 
 		 595 aa  55.8  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.17 
 
 		 1034 aa  55.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 611 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.56 
 
 		 707 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  29.52 
 
 		 1007 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 635 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 635 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4626  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 		 452 aa  55.8  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0047  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0614925  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.07 
 
 		 366 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 697 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0662  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.83 
 
 		 330 aa  55.1  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0114263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  31.43 
 
 		 1764 aa  55.5  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 766 aa  54.7  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.57 
 
 		 818 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.53 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  37.5 
 
 		 668 aa  55.1  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  32.46 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  32.46 
 
 		 561 aa  54.3  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 689 aa  54.3  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  25 
 
 		 462 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 589 aa  54.3  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  28.92 
 
 		 979 aa  54.3  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0934  TPR repeat protein  27.66 
 
 		 274 aa  53.9  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>