More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0154 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0154  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 445 aa  900    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.436369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6431  OmpA/MotB domain protein  44.3 
 
 		 449 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  42.76 
 
 		 440 aa  329  6e-89  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1944  OmpA/MotB domain protein  36.93 
 
 		 445 aa  249  7e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000859012 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  46.99 
 
 		 294 aa  133  5e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2583  OmpA/MotB domain protein  25.71 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000863952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  43.95 
 
 		 240 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  43.05 
 
 		 335 aa  119  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  42.21 
 
 		 237 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1599  outer membrane fibronectin-binding protein  44 
 
 		 333 aa  119  1.9999999999999998e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  unclonable  0.00000000197596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  43.75 
 
 		 244 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1004  OmpA/MotB domain protein  54.37 
 
 		 175 aa  117  5e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  43.95 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  43.95 
 
 		 350 aa  117  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  44.37 
 
 		 478 aa  116  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2097  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  43.03 
 
 		 344 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.000000182424  decreased coverage  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0547  hypothetical protein  39.52 
 
 		 420 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  7.56103e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1777  OmpF  43.23 
 
 		 344 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000465517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  42.5 
 
 		 239 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2299  outer membrane porin OprF  42.42 
 
 		 344 aa  114  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000300566  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  42.76 
 
 		 417 aa  113  8.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2089  OmpF family protein  44.08 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437855  normal  0.0407434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3651  OmpF family protein  44.08 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000349757  normal  0.525566 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1600  OmpF family protein  44.08 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000517848  decreased coverage  0.00289016 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1607  OmpF family protein  40.36 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00000281488  decreased coverage  0.0000000000176342 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.11 
 
 		 427 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0379  OmpA/MotB domain-containing protein  29.67 
 
 		 403 aa  111  3e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000108544  hitchhiker  0.000354369 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1091  OmpA/MotB domain protein  39.24 
 
 		 375 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2436  outer membrane protein  44.67 
 
 		 320 aa  109  9.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  38.92 
 
 		 447 aa  109  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23330  major outer membrane porin OprF  39.75 
 
 		 351 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0169824  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  40.79 
 
 		 319 aa  108  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  38.59 
 
 		 510 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0338  outer membrane protein  32.41 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000725554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0586  OmpA domain-containing protein  33.82 
 
 		 381 aa  107  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000977039  normal  0.0156715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0914  OmpA/MotB  39.74 
 
 		 368 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.412467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0181  OmpA/MotB domain protein  38.32 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000218101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  39.52 
 
 		 429 aa  107  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0372  OmpA/MotB  31.62 
 
 		 392 aa  107  6e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.0000120544  normal  0.0292595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1814  OmpA/MotB domain protein  40.13 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000102046  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  36.61 
 
 		 402 aa  106  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  33.67 
 
 		 266 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  38.26 
 
 		 388 aa  105  2e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1880  outer membrane protein  40 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000687097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1802  OmpA/MotB domain-containing protein  40 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252189  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  40 
 
 		 264 aa  104  4e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  47.27 
 
 		 263 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5477  OmpA/MotB domain protein  38.56 
 
 		 637 aa  101  2e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.650705  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  39.38 
 
 		 239 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  47.27 
 
 		 263 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.07 
 
 		 506 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.729214 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  39.74 
 
 		 365 aa  101  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 543 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5226  OmpA/MotB domain protein  43.27 
 
 		 193 aa  100  6e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.4 
 
 		 542 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  34.43 
 
 		 374 aa  99.8  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  39.74 
 
 		 230 aa  99.8  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3360  OmpA/MotB domain protein  25.85 
 
 		 484 aa  100  8e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1107  OmpA/MotB domain-containing protein  46.36 
 
 		 263 aa  99  1e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1281  OmpA/MotB domain-containing protein  37.75 
 
 		 367 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000128179  normal  0.0324976 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  36 
 
 		 544 aa  99.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  37.75 
 
 		 337 aa  99.8  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0913  outer membrane fibronectin-binding protein  37.91 
 
 		 337 aa  99  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  38.65 
 
 		 362 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0389  outer membrane fibronectin-binding protein  37.33 
 
 		 345 aa  98.2  3e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3048  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 		 372 aa  98.2  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00212901  normal  0.16507 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0763  OmpA/MotB domain-containing protein  55 
 
 		 189 aa  98.2  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000067511  unclonable  1.30394e-19 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3591  HAD family hydrolase  30.28 
 
 		 380 aa  97.1  7e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000168113  normal  0.23721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2966  OmpA/MotB domain-containing protein  37.75 
 
 		 372 aa  97.1  7e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00146812  normal  0.498764 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3244  OmpA/MotB domain protein  37.09 
 
 		 369 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0107614  hitchhiker  0.00411399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1112  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 369 aa  96.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00190106  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3146  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000812337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3415  OmpA/MotB domain-containing protein  27.95 
 
 		 420 aa  96.3  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1075  OmpA/MotB domain-containing protein  29.3 
 
 		 365 aa  95.9  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3103  outer membrane protein MopB  39.07 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.00000300647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004183  outer membrane protein A precursor  52.04 
 
 		 320 aa  95.1  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  38.67 
 
 		 456 aa  95.5  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2546  OmpA/MotB domain-containing protein  40.4 
 
 		 209 aa  95.5  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.031779 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3656  OmpA/MotB domain-containing protein  38.15 
 
 		 401 aa  95.5  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0655983  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2080  OmpA/MotB  35.2 
 
 		 366 aa  95.1  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  32.12 
 
 		 262 aa  95.1  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3545  OmpA family protein  37.09 
 
 		 370 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  36.42 
 
 		 623 aa  94.4  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0210  OmpA/MotB  37.91 
 
 		 314 aa  94.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1050  OmpA/MotB domain-containing protein  37.09 
 
 		 366 aa  94  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0116313  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6987  OmpA/MotB domain protein  27.19 
 
 		 514 aa  94  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.146113  hitchhiker  0.000256581 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  40.54 
 
 		 231 aa  94  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  39.46 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  39.46 
 
 		 230 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0958  ompA family protein  29.39 
 
 		 352 aa  92.4  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.42 
 
 		 369 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00262556  normal  0.603197 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  44.76 
 
 		 217 aa  92  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1090  OmpA/MotB domain-containing protein  36.84 
 
 		 367 aa  92.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000322286  normal  0.0373781 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  44.76 
 
 		 217 aa  92  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01404  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  34.32 
 
 		 218 aa  92  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  47.47 
 
 		 669 aa  92  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3703  OmpA/MotB domain protein  39.6 
 
 		 386 aa  92  2e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.150466  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  41.82 
 
 		 261 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3309  OmpA/MotB  46.53 
 
 		 226 aa  91.3  3e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0221  OmpA/MotB domain protein  46.15 
 
 		 345 aa  90.9  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0210773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>