261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4190 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0203  hypothetical protein  71.58 
 
 		 576 aa  873    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0229  hypothetical protein  72.52 
 
 		 576 aa  878    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1343  dipeptidase, putative  81 
 
 		 579 aa  983    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.539449  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0273  hypothetical protein  71.83 
 
 		 576 aa  869    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.956314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1156  hypothetical protein  80.31 
 
 		 579 aa  966    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.606865 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4190  hypothetical protein  100 
 
 		 579 aa  1182    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0226  hypothetical protein  71.58 
 
 		 585 aa  873    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.767872 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4890  hypothetical protein  41.87 
 
 		 579 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00623806  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4453  hypothetical protein  42.02 
 
 		 592 aa  420  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.850017  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1176  hypothetical protein  38.14 
 
 		 576 aa  417  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1237  hypothetical protein  37.97 
 
 		 576 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.752635  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1302  hypothetical protein  39.31 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1208  hypothetical protein  39.69 
 
 		 591 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1363  hypothetical protein  31.2 
 
 		 504 aa  220  7e-56  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1928  hypothetical protein  32.17 
 
 		 508 aa  212  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000792391  normal  0.162614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2691  hypothetical protein  30.93 
 
 		 534 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0089028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2160  hypothetical protein  30.71 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000828835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1725  hypothetical protein  31.33 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0132926  hitchhiker  0.00697252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2660  hypothetical protein  30.3 
 
 		 547 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00947468  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2738  hypothetical protein  30.72 
 
 		 547 aa  194  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00426784  normal  0.452389 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2301  hypothetical protein  30.85 
 
 		 533 aa  189  8e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00186231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2491  hypothetical protein  29.72 
 
 		 533 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.803199  normal  0.104159 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2371  hypothetical protein  30.77 
 
 		 533 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00101788  normal  0.189183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1565  hypothetical protein  29.92 
 
 		 525 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1231  dipeptidase PepV  27.64 
 
 		 465 aa  168  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00676632  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1421  dipeptidase PepV  28 
 
 		 465 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.220018  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2070  dipeptidase PepV  28.54 
 
 		 464 aa  161  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000110945  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0439  dipeptidase PepV  28.9 
 
 		 465 aa  159  2e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1291  dipeptidase PepV  27.56 
 
 		 467 aa  156  9e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.901763  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1525  peptidase V  26.61 
 
 		 471 aa  156  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1219  dipeptidase PepV  28.03 
 
 		 468 aa  151  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.274288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3367  dipeptidase PepV  26.93 
 
 		 467 aa  151  3e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0677  dipeptidase  27.1 
 
 		 469 aa  148  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1723  dipeptidase, putative  26.5 
 
 		 465 aa  148  3e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2756  dipeptidase  26.56 
 
 		 470 aa  146  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0908  dipeptidase PepV  30.07 
 
 		 472 aa  144  4e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000716409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4821  dipeptidase PepV  28.34 
 
 		 468 aa  140  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4535  dipeptidase PepV  26.71 
 
 		 468 aa  140  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4436  dipeptidase PepV  28.17 
 
 		 468 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08190  Xaa-His dipeptidase  25.43 
 
 		 464 aa  139  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4454  dipeptidase PepV  27.46 
 
 		 468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4816  dipeptidase PepV  26.89 
 
 		 468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.630994  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4839  dipeptidase PepV  27 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1083  dipeptidase PepV  28.69 
 
 		 468 aa  137  4e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.30546  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1046  dipeptidase, putative  23.11 
 
 		 464 aa  137  6.0000000000000005e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0420  dipeptidase PepV  27 
 
 		 468 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.93198  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4846  dipeptidase PepV  27.7 
 
 		 468 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2770  dipeptidase  26.47 
 
 		 467 aa  128  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101755  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0847  peptidase V  24.57 
 
 		 473 aa  121  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.150177  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1310  dipeptidase PepV  24.42 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000129958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0431  dipeptidase  25.88 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1063  dipeptidase  26.17 
 
 		 470 aa  119  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0135  dipeptidase  25.3 
 
 		 473 aa  118  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.502281 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4600  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29 
 
 		 345 aa  117  6e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1806  dipeptidase PepV  24.16 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1841  dipeptidase PepV  24.16 
 
 		 469 aa  116  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1434  dipeptidase  23.71 
 
 		 438 aa  116  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0146976  normal  0.693592 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03630  dipeptidase, putative  24.32 
 
 		 481 aa  113  9e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00297419  normal  0.0181586 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02210  dipeptidase, putative  26.82 
 
 		 484 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1544  hypothetical protein  25.05 
 
 		 444 aa  106  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0234535  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0420  dipeptidase, putative  26.42 
 
 		 449 aa  103  8e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.808057  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0375  dipeptidase  24.44 
 
 		 481 aa  103  9e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1971  dipeptidase  23.66 
 
 		 476 aa  102  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2626  dipeptidase, putative  33.67 
 
 		 280 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.357242  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2623  dipeptidase, putative  31.7 
 
 		 237 aa  94  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf023  acetylornithine deacetylase/succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.09 
 
 		 457 aa  93.2  1e-17  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl437  arginine catabolism aminotransferase  23.76 
 
 		 450 aa  85.1  0.000000000000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000221366  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0609  dipeptidase  24.81 
 
 		 456 aa  71.6  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.120564  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0316  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.61 
 
 		 402 aa  68.2  0.0000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0820  peptidase M20  29.59 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.193713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0631  peptidase M20  38.78 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0455  peptidase M20  27.22 
 
 		 459 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4378  hypothetical protein  37 
 
 		 473 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03691  glutamate carboxypeptidase  35.43 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.262776  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.22 
 
 		 410 aa  57  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5675  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1868  peptidase M20  27.08 
 
 		 508 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00940892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1737  peptidase M20  26.29 
 
 		 474 aa  56.2  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.353972 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2652  M20/DapE family protein YgeY  27.49 
 
 		 443 aa  55.1  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12240  acetylornithine deacetylase/succinyldiaminopimelate desuccinylase-like deacylase  28.24 
 
 		 488 aa  54.7  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3532  peptidase M20  26.25 
 
 		 455 aa  54.7  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.918424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1877  acetylornithine deacetylase  25.97 
 
 		 404 aa  54.3  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2332  hypothetical protein  26.76 
 
 		 471 aa  53.9  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0625849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0094  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  35.87 
 
 		 433 aa  53.9  0.000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.713156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3295  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  31.9 
 
 		 409 aa  53.5  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3656  hypothetical protein  29.24 
 
 		 490 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.989996  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5005  peptidase M20  31.3 
 
 		 480 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.579178 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29911  predicted protein  34.57 
 
 		 445 aa  53.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0349398  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  37.5 
 
 		 402 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0117  peptidase  32.59 
 
 		 401 aa  52.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5704  hypothetical protein  32.99 
 
 		 459 aa  52.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0680852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4600  peptidase M20  29.57 
 
 		 473 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2364  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.91 
 
 		 405 aa  51.6  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.7 
 
 		 412 aa  51.6  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5605  acetylornithine deacetylase  35.16 
 
 		 374 aa  51.6  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227908  normal  0.344951 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  28.77 
 
 		 368 aa  51.6  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1762  acetylornithine deacetylase  21.95 
 
 		 411 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2021  peptidase M20  30.93 
 
 		 469 aa  51.2  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.89722  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  37.5 
 
 		 442 aa  51.2  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3233  peptidase, M20/M25/M40 family  31.72 
 
 		 413 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>