More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29911 on replicon NC_009356
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009356  OSTLU_29911  predicted protein  100 
 
 
445 aa  918    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0349398  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0325  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.87 
 
 
442 aa  84.3  0.000000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1459  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.64 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2365  acetylornithine deacetylase  23.81 
 
 
387 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.491069  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3448  peptidase M20  27.47 
 
 
419 aa  80.9  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1852  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
378 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.751172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0234  diaminopimelate aminotransferase  28.29 
 
 
411 aa  80.1  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00102405  normal  0.710692 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1420  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.45 
 
 
383 aa  79.3  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000737808  normal  0.0270135 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0991  acetylornithine deacetylase  26.62 
 
 
402 aa  79.3  0.0000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.032504  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2527  acetylornithine deacetylase  24.78 
 
 
403 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.528744  hitchhiker  0.00344998 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2386  acetylornithine deacetylase (ArgE)  26.83 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3458  acetylornithine deacetylase  29.81 
 
 
385 aa  77.8  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0709  diaminopimelate aminotransferase  23.84 
 
 
415 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.123026  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0081  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.26 
 
 
377 aa  77  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4949  peptidase M20  30.3 
 
 
365 aa  77  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0995  acetylornithine deacetylase  30.54 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.717305  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0113  diaminopimelate aminotransferase  29.2 
 
 
413 aa  76.3  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.239854  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2203  acetylornithine deacetylase  29.86 
 
 
386 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.558006  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0553  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.13 
 
 
413 aa  75.1  0.000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0770776 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1810  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.95 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.834903 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4562  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.72 
 
 
388 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3411  acetylornithine deacetylase  30.3 
 
 
406 aa  75.5  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2976  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.68 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0234315  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2246  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.57 
 
 
383 aa  74.7  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6175  acetylornithine deacetylase  29.8 
 
 
384 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0550  diaminopimelate aminotransferase  28.24 
 
 
409 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000714346 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6045  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 
389 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000725367  hitchhiker  0.0000370273 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1163  diaminopimelate aminotransferase  24.68 
 
 
396 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00430339  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1278  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.02 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.645839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1810  diaminopimelate aminotransferase  26.91 
 
 
410 aa  74.3  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71180  acetylornithine deacetylase  29.29 
 
 
384 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3571  acetylornithine deacetylase  29.41 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1351  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.59 
 
 
379 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.42322 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4976  acetylornithine deacetylase  25.66 
 
 
376 aa  73.6  0.000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0778383 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1854  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.34 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000102296  normal  0.0130262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2425  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.9 
 
 
433 aa  73.2  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1493  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0891925  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2514  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.378081  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2405  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2363  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
405 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3317  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0116246  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1262  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
389 aa  73.2  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0937611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2494  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.6 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1467  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.37 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0499  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.46 
 
 
383 aa  73.2  0.00000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1172  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1895  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.31 
 
 
383 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.387687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0591  peptidase M20  24.93 
 
 
390 aa  72.8  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3463  acetylornithine deacetylase  26.87 
 
 
388 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.945504 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2049  diaminopimelate aminotransferase  25.1 
 
 
409 aa  72.8  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1350  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25 
 
 
395 aa  72.8  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.80626  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1990  acetylornithine deacetylase  30.56 
 
 
586 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0817562  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1166  acetylornithine deacetylase  27.23 
 
 
384 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2086  acetylornithine deacetylase  26.76 
 
 
405 aa  72  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.742076  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0404  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.51 
 
 
423 aa  71.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5407  acetylornithine deacetylase  27.83 
 
 
387 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.532883  normal  0.0112485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01145  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.13 
 
 
376 aa  71.2  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0346694  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1758  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  22.51 
 
 
439 aa  71.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0097  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.52 
 
 
437 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0395035  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0239  acetylornithine deacetylase  28.44 
 
 
428 aa  71.6  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1873  acetylornithine deacetylase  29.56 
 
 
404 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0968397  normal  0.014477 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0095  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.17 
 
 
429 aa  70.9  0.00000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276055  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2374  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.13 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.428442  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1326  acetylornithine deacetylase  26.48 
 
 
406 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000000659455  hitchhiker  0.00151978 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2958  acetylornithine deacetylase  28.31 
 
 
386 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0155668  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1169  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.05 
 
 
375 aa  70.9  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.0085644  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1860  acetylornithine deacetylase  26.41 
 
 
406 aa  70.9  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000219748  hitchhiker  0.0000660568 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3162  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  29.05 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000827739  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0364  acetylornithine deacetylase  23.82 
 
 
388 aa  70.1  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216461  normal  0.359815 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7082  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
387 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0793838 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2314  acetylornithine deacetylase  29.06 
 
 
416 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306432  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1768  acetylornithine deacetylase  26.56 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.401756  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3141  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0193  diaminopimelate aminotransferase  23.72 
 
 
421 aa  69.3  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000572443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1255  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6994  acetylornithine deacetylase  28.02 
 
 
387 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.277721  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1372  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.75 
 
 
375 aa  69.3  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1312  acetylornithine deacetylase  28.5 
 
 
398 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00749769  normal  0.95577 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0030  acetylornithine deacetylase  25.85 
 
 
446 aa  69.3  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3865  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.79 
 
 
433 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.838236  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1622  peptidase M20  30.49 
 
 
368 aa  69.3  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0389  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.14 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.45697  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1933  acetylornithine deacetylase  26.06 
 
 
406 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0058469  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2196  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  27.98 
 
 
385 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1922  hypothetical protein  33.33 
 
 
446 aa  68.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2717  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  26.13 
 
 
391 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.11396  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1388  acetylornithine deacetylase or succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.94 
 
 
393 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0811726  normal  0.459687 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1271  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  25.49 
 
 
392 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2350  acetylornithine deacetylase  27.19 
 
 
386 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3501  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.1 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1125  diaminopimelate aminotransferase  26.74 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000017221  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1865  diaminopimelate aminotransferase  24.13 
 
 
406 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.363137  normal  0.0244826 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0643  diaminopimelate aminotransferase  24.73 
 
 
415 aa  67.8  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.166626  hitchhiker  0.00154424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0474  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  24.23 
 
 
404 aa  68.2  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.987794  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1956  acetylornithine deacetylase  28.57 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000205463  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5672  acetylornithine deacetylase  26.22 
 
 
387 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16138  normal  0.344042 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1390  succinyl-diaminopimelate desuccinylase  28.22 
 
 
386 aa  67.8  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3045  acetylornithine deacetylase  26.39 
 
 
422 aa  67.8  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1945  acetylornithine deacetylase  26.33 
 
 
406 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1933  diaminopimelate aminotransferase  28.26 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>