More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1341 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  98.68 
 
 		 380 aa  759    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  100 
 
 		 380 aa  765    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  69.19 
 
 		 370 aa  556  1e-157  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  68.75 
 
 		 369 aa  521  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  69.02 
 
 		 369 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  69.02 
 
 		 369 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  68.39 
 
 		 371 aa  514  1.0000000000000001e-145  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  68.21 
 
 		 369 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  67.12 
 
 		 369 aa  508  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  68.01 
 
 		 373 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  65.57 
 
 		 369 aa  471  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  65.57 
 
 		 367 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  63.01 
 
 		 369 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1968  histone deacetylase family protein  65.57 
 
 		 369 aa  464  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520667  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2334  histone deacetylase family protein putative  65.3 
 
 		 369 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679895  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  63.06 
 
 		 373 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2111  histone deacetylase family protein  67.55 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  65.49 
 
 		 340 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1475  histone deacetylase family protein  65.49 
 
 		 340 aa  423  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.157085  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0378  histone deacetylase superfamily protein  59.07 
 
 		 365 aa  414  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0801  deacetylase / acetylpolyamine aminohydrolase  59.34 
 
 		 379 aa  413  1e-114  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2459  histone deacetylase superfamily protein  58.79 
 
 		 379 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.08307 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1010  histone deacetylase superfamily protein  53.55 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.942652  normal  0.837706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  47.37 
 
 		 379 aa  301  2e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  45.48 
 
 		 370 aa  295  7e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2258  histone deacetylase family protein  44.08 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2827  histone deacetylase family protein  44.08 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2309  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  44.08 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2332  histone deacetylase family protein  44.08 
 
 		 370 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  38.89 
 
 		 344 aa  218  1e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0125  histone deacetylase family protein putative  43.79 
 
 		 370 aa  217  4e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0124  histone deacetylase family protein  46.38 
 
 		 350 aa  216  7e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0332  histone deacetylase family protein  46.05 
 
 		 350 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.195031  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0141  histone deacetylase family protein  43.49 
 
 		 370 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  41.04 
 
 		 343 aa  211  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  39.87 
 
 		 334 aa  207  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  40.73 
 
 		 331 aa  199  6e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  37.42 
 
 		 344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  40 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3860  Histone deacetylase  34.96 
 
 		 372 aa  196  5.000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.175047  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1308  histone deacetylase superfamily  41.55 
 
 		 347 aa  194  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  41.41 
 
 		 309 aa  194  3e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  41.67 
 
 		 365 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  40.65 
 
 		 309 aa  193  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0635  histone deacetylase superfamily protein  38.94 
 
 		 309 aa  192  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.745651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  38.33 
 
 		 311 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1860  Histone deacetylase  41.96 
 
 		 341 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0555119  normal  0.0138498 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  38.91 
 
 		 337 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  35.11 
 
 		 316 aa  189  5e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0541  histone deacetylase superfamily protein  41.1 
 
 		 316 aa  189  5.999999999999999e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3297  histone deacetylase family protein  41.61 
 
 		 313 aa  189  7e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  35.37 
 
 		 344 aa  189  8e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  35.25 
 
 		 352 aa  189  9e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  41.11 
 
 		 307 aa  188  1e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  39.78 
 
 		 308 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0778  histone deacetylase superfamily protein  41.97 
 
 		 309 aa  188  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.132224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  39.57 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  38.41 
 
 		 345 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0946  histone deacetylase superfamily protein  38.28 
 
 		 348 aa  187  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0437  histone deacetylase family protein  41.1 
 
 		 316 aa  187  3e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  39.32 
 
 		 309 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  33.88 
 
 		 335 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  40.89 
 
 		 324 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  37.82 
 
 		 336 aa  186  8e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  39.57 
 
 		 309 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  39.71 
 
 		 309 aa  185  9e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  35.61 
 
 		 364 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  39.64 
 
 		 309 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0844  histone deacetylase superfamily  39.85 
 
 		 309 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.548936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  45.32 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  39.72 
 
 		 307 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 345 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2516  histone deacetylase superfamily protein  36.45 
 
 		 321 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0900829  normal  0.296848 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2923  histone deacetylase superfamily protein  39.45 
 
 		 308 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.498273 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0640  histone deacetylase superfamily protein  37.91 
 
 		 307 aa  183  5.0000000000000004e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0425739 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1220  histone deacetylase superfamily protein  36.34 
 
 		 317 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.354736  normal  0.0941624 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  39.66 
 
 		 309 aa  182  1e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  31.93 
 
 		 379 aa  182  1e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1155  histone deacetylase superfamily protein  35.9 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.60064  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0310  histone deacetylase superfamily protein  37.82 
 
 		 341 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0417  Histone deacetylase  32.73 
 
 		 340 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  37.46 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_272  acetoin utilization protein/histone deacetylase  37.45 
 
 		 341 aa  179  5.999999999999999e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.616312  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0397  histone deacetylase superfamily protein  41.11 
 
 		 319 aa  179  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3064  histone deacetylase superfamily  41.28 
 
 		 308 aa  179  8e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 328 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1345  histone deacetylase superfamily  35.81 
 
 		 312 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  39.57 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0085  Histone deacetylase  35.88 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.127732  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0330  histone deacetylase family protein  36 
 
 		 341 aa  177  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1375  Histone deacetylase  35.81 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.190886  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2486  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  42.91 
 
 		 310 aa  176  5e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  39.21 
 
 		 309 aa  176  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1905  histone deacetylase superfamily protein  36.01 
 
 		 312 aa  176  5e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  36.69 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  38.13 
 
 		 325 aa  176  6e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0952  histone deacetylase superfamily protein  39.4 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0823921  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3008  Histone deacetylase  37.29 
 
 		 308 aa  176  8e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0354167  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0860  histone deacetylase superfamily  38.99 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.684405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0335  histone deacetylase superfamily protein  38.44 
 
 		 307 aa  175  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>