284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4375 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_4364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  97.76 
 
 
539 aa  1018    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 
540 aa  1105    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.352902 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.94 
 
 
810 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.71 
 
 
927 aa  81.3  0.00000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  21.63 
 
 
878 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.97 
 
 
784 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  21.85 
 
 
1694 aa  72.4  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  20.68 
 
 
1056 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
3172 aa  69.7  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.59 
 
 
3301 aa  68.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  20.35 
 
 
1276 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 
4079 aa  67  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
689 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  21.35 
 
 
543 aa  63.5  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.34 
 
 
623 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 
1085 aa  62.8  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0564  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
505 aa  62.4  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.18 
 
 
632 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  25.42 
 
 
622 aa  62  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  21.22 
 
 
397 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2034  TPR repeat-containing protein  25.75 
 
 
416 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 
467 aa  60.8  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  20.34 
 
 
808 aa  60.5  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
767 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  22.88 
 
 
2262 aa  60.1  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5131  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
361 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000131061 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  20.5 
 
 
589 aa  60.1  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  21.6 
 
 
486 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.49 
 
 
818 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  20.43 
 
 
562 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0691  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  23.49 
 
 
883 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.953113 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3410  TPR repeat-containing protein  25 
 
 
781 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.86 
 
 
1022 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
297 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.27 
 
 
1056 aa  58.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0329  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.08 
 
 
297 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  26.03 
 
 
267 aa  57.8  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28481  hypothetical protein  20.65 
 
 
462 aa  57.8  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  20.45 
 
 
1421 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.2 
 
 
626 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.2 
 
 
614 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  22.03 
 
 
614 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  22.86 
 
 
676 aa  57.4  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0813  TPR repeat-containing protein  25.93 
 
 
286 aa  57  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.038465  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 
681 aa  57  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  19.62 
 
 
1056 aa  56.6  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4492  TPR repeat-containing protein  21.86 
 
 
605 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  21.67 
 
 
340 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  22.94 
 
 
363 aa  56.6  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 
626 aa  57  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.68 
 
 
2240 aa  56.2  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  22.67 
 
 
725 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.04 
 
 
406 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
636 aa  56.2  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  21.29 
 
 
366 aa  57  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 
715 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  20.27 
 
 
706 aa  55.5  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.19 
 
 
565 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1520  Tetratricopeptide repeat protein  28.28 
 
 
230 aa  55.8  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 
626 aa  55.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 
364 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  19.39 
 
 
564 aa  55.1  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4774  TPR repeat-containing protein  23.84 
 
 
371 aa  54.7  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  28.57 
 
 
398 aa  54.7  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 
614 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  22.65 
 
 
614 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  23.46 
 
 
639 aa  54.7  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  22.65 
 
 
614 aa  54.7  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1639  tetratricopeptide TPR_2  25.73 
 
 
773 aa  54.7  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.858734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  19.7 
 
 
988 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  25.09 
 
 
465 aa  54.3  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2526  tetratricopeptide TPR_2  28 
 
 
784 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.82201 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.54 
 
 
1406 aa  54.3  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4781  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.69 
 
 
738 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.409511  normal  0.0812036 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  22.15 
 
 
632 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  19.46 
 
 
1213 aa  53.9  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  21.48 
 
 
279 aa  53.5  0.000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  19.27 
 
 
909 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  20.75 
 
 
706 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  23.42 
 
 
764 aa  53.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3942  sulfotransferase  24.83 
 
 
673 aa  53.5  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.749375 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
635 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  24.58 
 
 
635 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  20.63 
 
 
1138 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.46 
 
 
1979 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 
602 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  22.41 
 
 
615 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0495  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
592 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31548  hitchhiker  0.000811281 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  27.34 
 
 
576 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2994  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
317 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.24 
 
 
370 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  18.23 
 
 
594 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.55 
 
 
887 aa  52.4  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  27.27 
 
 
795 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  20.57 
 
 
292 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2981  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.49 
 
 
383 aa  52  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000586322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  20 
 
 
634 aa  52  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  25.15 
 
 
448 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
1069 aa  51.6  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>