More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3253 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  56.13 
 
 
937 aa  893    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  54.37 
 
 
937 aa  888    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  43.83 
 
 
1107 aa  643    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  100 
 
 
867 aa  1748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  42.09 
 
 
863 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  38.72 
 
 
1041 aa  462  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  40.62 
 
 
892 aa  456  1e-127  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  40.93 
 
 
886 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  34.87 
 
 
1015 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_013733  Slin_6989  small GTP-binding protein  33.11 
 
 
925 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0461  small GTP-binding protein  32.54 
 
 
761 aa  334  4e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.981237  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1428  Miro-like  33.41 
 
 
748 aa  225  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0508  Rab family protein  29.59 
 
 
811 aa  224  4.9999999999999996e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.356844  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  27.06 
 
 
1085 aa  208  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  45.54 
 
 
482 aa  207  8e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  42.41 
 
 
508 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  40.4 
 
 
1263 aa  186  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  42.86 
 
 
416 aa  184  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  36.93 
 
 
354 aa  160  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  44.33 
 
 
448 aa  144  5e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  36.01 
 
 
1024 aa  144  9e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  31.98 
 
 
713 aa  142  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  31.05 
 
 
1749 aa  140  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  36.6 
 
 
757 aa  135  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  36.25 
 
 
2491 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  36.51 
 
 
307 aa  118  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  38.18 
 
 
242 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  27.95 
 
 
1344 aa  114  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1833  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  31.78 
 
 
476 aa  114  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.113448  normal  0.602761 
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  29.94 
 
 
1266 aa  114  1.0000000000000001e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5076  leucine-rich repeat-containing protein typical subtype  29.96 
 
 
472 aa  108  4e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.597323 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0507  hypothetical protein  24.69 
 
 
614 aa  107  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.37047  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  30.67 
 
 
2132 aa  103  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  36.41 
 
 
296 aa  101  7e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  41.5 
 
 
291 aa  98.6  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  31.06 
 
 
559 aa  97.4  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05354  leucine-rich-repeat protein  33.08 
 
 
648 aa  95.9  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153202  normal  0.61314 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1245  hypothetical protein  31.46 
 
 
467 aa  94.7  6e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_16261  predicted protein  33.98 
 
 
249 aa  94  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3676  Serine/threonine protein kinase  35.2 
 
 
437 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  36.61 
 
 
447 aa  92.8  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12927  predicted protein  31.76 
 
 
526 aa  92  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_1531  predicted protein  30.88 
 
 
447 aa  90.9  9e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.486556  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11793  predicted protein  31.15 
 
 
263 aa  90.1  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.601681  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  34.83 
 
 
447 aa  89.7  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3583  serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
453 aa  89  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  28.92 
 
 
528 aa  88.6  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  30.68 
 
 
204 aa  88.2  6e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  35.63 
 
 
447 aa  87.8  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  33.33 
 
 
802 aa  87.8  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1257  leucine-rich repeat protein  36.88 
 
 
776 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  29.77 
 
 
716 aa  87  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  33.47 
 
 
247 aa  87.4  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0251  hypothetical protein  34.27 
 
 
396 aa  86.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00111835  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_2739  predicted protein  33.48 
 
 
230 aa  86.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0886  leucine-rich repeat protein  41.48 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.290736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  33.79 
 
 
436 aa  85.1  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3397  serine/threonine protein kinase  33.53 
 
 
444 aa  84.7  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0650479  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3027  leucine-rich repeat-containing protein kinase  31.58 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.176048 
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  30.91 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0149  leucine-rich repeat-containing protein  31.9 
 
 
436 aa  84  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1854  serine/threonine protein kinase  32.46 
 
 
440 aa  84  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13717 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1973  serine/threonine protein kinase  33.18 
 
 
421 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3161  protein kinase, putative  32.09 
 
 
446 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0155369  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3080  serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
473 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.102721  normal 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  29.58 
 
 
304 aa  83.2  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1476  Miro domain protein  30.64 
 
 
998 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.184541  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1369  protein kinase  33.67 
 
 
413 aa  81.6  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00197629 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32486  predicted protein  31.82 
 
 
293 aa  81.3  0.00000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.647095  hitchhiker  0.00961002 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  32.17 
 
 
565 aa  81.3  0.00000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1882  hypothetical protein  32.37 
 
 
1744 aa  81.3  0.00000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.44453  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  27.91 
 
 
760 aa  80.5  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  37.81 
 
 
283 aa  79.3  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3274  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.470678  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03420  HpaF leucine rich hrp associated protein  34.07 
 
 
478 aa  79.7  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4670  serine/threonine protein kinase  32.29 
 
 
439 aa  79.3  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2351  serine/threonine protein kinase  31.61 
 
 
414 aa  79.3  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102293 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  30.94 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2471  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
450 aa  79  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00766304  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1439  serine/threonine protein kinase  37.01 
 
 
475 aa  79  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  30.26 
 
 
1017 aa  78.2  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  30.3 
 
 
304 aa  78.2  0.0000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2142  serine/threonine protein kinase  32.02 
 
 
439 aa  78.2  0.0000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.733899  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  32.26 
 
 
412 aa  78.2  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  31.39 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  30.28 
 
 
972 aa  77  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  24.59 
 
 
2324 aa  77.4  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  30.49 
 
 
451 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  31.41 
 
 
445 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2737  leucine-rich repeat-containing protein kinase  30.2 
 
 
440 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  31.36 
 
 
601 aa  76.6  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5260  leucine-rich repeat-containing protein  27.15 
 
 
558 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  31.87 
 
 
414 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07602  hypothetical protein similar to small GTP-binding protein (Eurofung)  28.9 
 
 
184 aa  76.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.236475  normal  0.0559081 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2938  serine/threonine protein kinase  33.97 
 
 
459 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3638  serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  28.78 
 
 
899 aa  75.5  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  33.12 
 
 
490 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4929  serine/threonine protein kinase  30.64 
 
 
471 aa  75.5  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  41.74 
 
 
675 aa  75.1  0.000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>