More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2631 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4869  TonB-dependent receptor  59.66 
 
 		 784 aa  914    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188313  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2631  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 799 aa  1632    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0452445  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4192  TonB-dependent receptor  59.08 
 
 		 784 aa  920    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0530533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1405  TonB-dependent receptor  61.46 
 
 		 783 aa  961    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.148044  normal  0.749639 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4046  TonB-dependent receptor  60.74 
 
 		 789 aa  889    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.236751 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3257  TonB-dependent receptor, plug  68.96 
 
 		 782 aa  1056    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393029  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2266  putative outer membrane hemin/siderophore receptor protein  60.25 
 
 		 774 aa  928    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5735  TonB-dependent receptor plug  48.17 
 
 		 676 aa  625  1e-177  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1180  TonB-dependent receptor  47.59 
 
 		 705 aa  610  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00173216  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0861  TonB-dependent receptor plug  46.47 
 
 		 714 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113091 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2102  TonB-dependent receptor plug  46 
 
 		 719 aa  586  1e-166  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121164 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4426  TonB-dependent receptor plug  45.92 
 
 		 707 aa  588  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.831114  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2378  TonB-dependent receptor  46.28 
 
 		 719 aa  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2054  TonB-dependent receptor plug  46.14 
 
 		 714 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3051  TonB-dependent receptor  42.97 
 
 		 702 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.385439 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3951  TonB-dependent receptor plug  44.88 
 
 		 731 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.478156  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4319  TonB-dependent receptor plug  44.88 
 
 		 723 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.133256  normal  0.357062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1865  TonB-dependent receptor  38.35 
 
 		 705 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0159  TonB-dependent receptor  30.44 
 
 		 727 aa  269  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.630357  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5866  TonB-dependent receptor  30.47 
 
 		 694 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.754568 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3871  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 693 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.284542 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1524  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 692 aa  251  4e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.41177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4331  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 677 aa  250  7e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.467615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3927  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 742 aa  250  8e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.889304  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0134  TonB-dependent receptor  30.54 
 
 		 694 aa  249  1e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  30.01 
 
 		 719 aa  249  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4439  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4185  TonB-dependent receptor  30.59 
 
 		 724 aa  244  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.423461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4488  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 835 aa  237  5.0000000000000005e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4738  hypothetical protein  28.49 
 
 		 687 aa  227  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.122905  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0527  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 		 725 aa  227  8e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54180  hypothetical protein  28.49 
 
 		 687 aa  226  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4359  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 682 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503749 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2510  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 689 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2505  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1631  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 751 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.374553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0939  TonB-dependent receptor  29.72 
 
 		 751 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1083  TonB-dependent receptor  27.77 
 
 		 681 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.654229  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0251  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 698 aa  221  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.818078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2644  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 698 aa  222  3e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.700465  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0287  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 681 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.566628  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4275  TonB-dependent receptor  28.99 
 
 		 685 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1434  TonB-dependent receptor  29.87 
 
 		 681 aa  221  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1446  TonB-dependent receptor  28.02 
 
 		 680 aa  220  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.757282 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1847  outer membrane hemin receptor  29.24 
 
 		 681 aa  217  5e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.536345  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1010  TonB-dependent receptor  27.13 
 
 		 695 aa  216  9.999999999999999e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2604  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 706 aa  214  5.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000145461  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1776  TonB-dependent receptor  29.1 
 
 		 681 aa  213  7.999999999999999e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.506157  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1683  TonB-dependent receptor  27.02 
 
 		 727 aa  210  7e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04789  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.77 
 
 		 600 aa  209  1e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0342163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1902  TonB-dependent receptor  26.17 
 
 		 751 aa  207  5e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357712  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2932  putative iron complex outermembrane recepter protein  28.89 
 
 		 685 aa  205  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3717  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 702 aa  201  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.429203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0295  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 797 aa  202  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.141972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1489  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 689 aa  200  7e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000345981  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1842  TonB-dependent receptor  28.07 
 
 		 693 aa  200  9e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1978  outer membrane protein  26.78 
 
 		 801 aa  200  9e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.103542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2807  TonB-dependent receptor  27.63 
 
 		 713 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3948  TonB-dependent receptor  27.9 
 
 		 730 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.32851 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1214  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 734 aa  199  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.772889  normal  0.0390037 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2033  TonB-dependent receptor  28 
 
 		 695 aa  197  6e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000947033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0754  TonB-dependent receptor  27.68 
 
 		 709 aa  194  4e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4694  TonB-dependent receptor  28.22 
 
 		 685 aa  194  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1894  TonB-dependent receptor  26.84 
 
 		 709 aa  193  9e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.123894 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03676  TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 821 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00269599  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2321  TonB-dependent receptor, putative  27.7 
 
 		 709 aa  191  5e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493897  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  26.97 
 
 		 758 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  26.97 
 
 		 758 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  26.97 
 
 		 758 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  27.1 
 
 		 758 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13940  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 682 aa  182  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.137662  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0540  TonB-dependent receptor  27.3 
 
 		 699 aa  181  4.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3383  TonB-dependent receptor, plug  26.35 
 
 		 758 aa  178  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3627  TonB-dependent receptor  25.78 
 
 		 744 aa  178  5e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000139063  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3729  TonB-dependent receptor, putative  25.39 
 
 		 778 aa  169  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000373318  normal  0.721597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0708  TonB-dependent receptor, plug  25.41 
 
 		 744 aa  162  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1189  TonB-dependent receptor  27.99 
 
 		 702 aa  159  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000388358  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0594  TonB-dependent receptor  25.82 
 
 		 708 aa  153  1e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.601286  hitchhiker  0.00250598 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0551  TonB-dependent receptor  25.97 
 
 		 733 aa  151  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.629102  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  24.97 
 
 		 763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  23.46 
 
 		 735 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0859  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 249 aa  101  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.152413  normal  0.604475 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2340  TonB-dependent receptor  30.8 
 
 		 836 aa  100  7e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000058543  normal  0.137103 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3709  outer membrane receptor protein  23.37 
 
 		 776 aa  100  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0256653 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0069  iron-regulated outer membrane protein  29.46 
 
 		 868 aa  90.1  1e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024885  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  24.27 
 
 		 824 aa  79  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3288  TonB-dependent receptor  41.38 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0270  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 766 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001257  TonB-dependent heme receptor HutR  24.07 
 
 		 712 aa  71.2  0.00000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.299412  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  32.59 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05789  hypothetical protein  23.54 
 
 		 712 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1480  TonB-dependent receptor  21.71 
 
 		 776 aa  70.9  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.329669  normal  0.154283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  35.65 
 
 		 776 aa  69.7  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  30.95 
 
 		 791 aa  68.2  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  32.31 
 
 		 681 aa  68.2  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0204  TonB-dependent receptor  33.07 
 
 		 678 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  36.97 
 
 		 759 aa  67.4  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0645  TonB-dependent hemoglobin/transferrin/lactoferrin family receptor  24.35 
 
 		 750 aa  66.2  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0446508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1366  tonB-linked outer membrane receptor  33.62 
 
 		 811 aa  64.7  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.351505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2654  TonB-dependent siderophore receptor  29.61 
 
 		 757 aa  64.3  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0434213 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>