More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2524 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2524  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 281 aa  579  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0713961  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0143  polysaccharide deacetylase  64.1 
 
 		 310 aa  368  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.839924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2403  polysaccharide deacetylase  63.44 
 
 		 279 aa  364  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0287  polysaccharide deacetylase  63.5 
 
 		 277 aa  364  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1981  polysaccharide deacetylase  61.29 
 
 		 283 aa  365  1e-100  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2510  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  63.18 
 
 		 302 aa  363  2e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.710977 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0664  polysaccharide deacetylase  63.41 
 
 		 291 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0290858  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3276  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  60.51 
 
 		 279 aa  351  7e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.231611  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1517  polysaccharide deacetylase  58.3 
 
 		 301 aa  337  9.999999999999999e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0751328  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0588  polysaccharide deacetylase  56.88 
 
 		 282 aa  332  5e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.620562 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3114  polysaccharide deacetylase  55.31 
 
 		 305 aa  317  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4036  PEP-CTERM locus, polysaccharide deactylase  53.07 
 
 		 292 aa  311  1e-83  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.216969  normal  0.884964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2331  polysaccharide deacetylase  54.78 
 
 		 293 aa  295  4e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.103516  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1923  polysaccharide deacetylase  49.82 
 
 		 286 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.311845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1172  polysaccharide deacetylase  48.89 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1774  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.64 
 
 		 279 aa  283  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2473  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  49.27 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0139  FkbH  46.04 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1656  polysaccharide deacetylase  49.46 
 
 		 299 aa  278  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.515692  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2470  polysaccharide deacetylase  50 
 
 		 301 aa  277  1e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1980  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  50.9 
 
 		 293 aa  276  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2388  polysaccharide deacetylase  50.55 
 
 		 304 aa  276  3e-73  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2968  polysaccharide deacetylase  52.55 
 
 		 284 aa  273  3e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02597  Polysaccharide deacetylase  50.38 
 
 		 270 aa  269  2.9999999999999997e-71  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.14174  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2217  polysaccharide deactylase family protein, PEP- CTERM locus subfamily  47.69 
 
 		 298 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.691781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2360  polysaccharide deacetylase  46.84 
 
 		 293 aa  258  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2005  polysaccharide deacetylase  47.41 
 
 		 280 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0684  polysaccharide deactylase family protein, PEP-CTERM locus subfamily  46.24 
 
 		 283 aa  250  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.934486 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3066  polysaccharide deacetylase  46.24 
 
 		 283 aa  246  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00688884  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0835  polysaccharide deacetylase family protein  45.78 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2617  polysaccharide deacetylase  33.96 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2587  polysaccharide deacetylase  34.47 
 
 		 284 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.784325  normal  0.845625 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3617  polysaccharide deacetylase  35.51 
 
 		 281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000367499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0246  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  35.64 
 
 		 276 aa  152  8e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1685  polysaccharide deacetylase  34.31 
 
 		 273 aa  146  3e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000637976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2210  polysaccharide deacetylase  35.83 
 
 		 283 aa  142  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1104  polysaccharide deacetylase  29.33 
 
 		 298 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0831  polysaccharide deacetylase  28.67 
 
 		 307 aa  96.3  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00177779  normal  0.177326 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1730  polysaccharide deacetylase  28.14 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.842929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2238  polysaccharide deacetylase  30.04 
 
 		 289 aa  83.2  0.000000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0796  polysaccharide deacetylase  35.46 
 
 		 264 aa  76.3  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5661  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5371  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5282  polysaccharide deacetylase  34.04 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  40.18 
 
 		 299 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0047  polysaccharide deacetylase  34.51 
 
 		 288 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.322661 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4846  polysaccharide deacetylase  36.84 
 
 		 271 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2304  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.938894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2257  polysaccharide deacetylase  31.69 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.842059  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0799  polysaccharide deacetylase  35.66 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3696  polysaccharide deacetylase  38.18 
 
 		 321 aa  72  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0234  polysaccharide deacetylase  29.69 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2296  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.480764  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0567  polysaccharide deacetylase  31.9 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0123603  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4982  polysaccharide deacetylase  39.17 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0560219  normal  0.0180335 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1847  polysaccharide deacetylase  30.99 
 
 		 286 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  31.11 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1579  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 251 aa  69.7  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.3591  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  34.03 
 
 		 315 aa  68.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5051  polysaccharide deacetylase  32.14 
 
 		 273 aa  68.9  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  36.59 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3514  polysaccharide deacetylase  33.13 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.345216  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1057  polysaccharide deacetylase  33.94 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00359721  hitchhiker  0.000209945 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1987  polysaccharide deacetylase  34.78 
 
 		 256 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3361  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 275 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.342746  hitchhiker  0.00000000000000743733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  43.21 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1932  polysaccharide deacetylase  38.96 
 
 		 522 aa  66.2  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.461546  normal  0.430114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0557  polysaccharide deacetylase  35.29 
 
 		 256 aa  66.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1031  polysaccharide deacetylase  39.02 
 
 		 430 aa  66.2  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.90284  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2068  putative polysaccharide deacetylase  34.38 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000383766  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  38.14 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  34.55 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2705  polysaccharide deacetylase  33.05 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117989  normal  0.421806 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1449  polysaccharide deacetylase family sporulation protein PdaB  32.35 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1399  polysaccharide deacetylase  33.01 
 
 		 251 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3901  polysaccharide deacetylase  34.82 
 
 		 287 aa  64.7  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.198047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  33.64 
 
 		 290 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.27 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3335  polysaccharide deacetylase  30.91 
 
 		 298 aa  63.5  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1829  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00572259  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  32 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1966  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.060186  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0123  polysaccharide deacetylase  37.18 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0145  sporulation polysaccharide deacetylase PdaB  36.27 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268152  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1550  polysaccharide deacetylase  41.25 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0260353  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0304  polysaccharide deacetylase  29.77 
 
 		 287 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1795  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 275 aa  62.8  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.532229  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2787  polysaccharide deacetylase  40.24 
 
 		 404 aa  62.8  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1821  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1778  polysaccharide deacetylase  35.62 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1961  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0210689  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1257  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3411  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2047  polysaccharide deacetylase, putative  33.33 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0303096  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0328  polysaccharide deacetylase  27.93 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.955729  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0150  polysaccharide deacetylase, putative  34.31 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.647216  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2404  polysaccharide deacetylase  29.55 
 
 		 221 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.256857  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3051  polysaccharide deacetylase  32.04 
 
 		 264 aa  61.6  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1456  polysaccharide deacetylase family protein  31.25 
 
 		 238 aa  62  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0998463  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1800  polysaccharide deacetylase  29.13 
 
 		 372 aa  62  0.00000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.358756  normal  0.150786 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>