More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3260 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3260  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 309 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235559  hitchhiker  0.000147183 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  40.12 
 
 		 220 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 195 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 193 aa  105  9e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2475  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 363 aa  98.2  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.161368 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  36.93 
 
 		 400 aa  97.8  2e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 197 aa  97.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3131  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 403 aa  94.7  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  57.14 
 
 		 171 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 424 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  51.14 
 
 		 89 aa  89  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 193 aa  86.7  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 206 aa  85.9  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 194 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3985  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 425 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  38.92 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 207 aa  82.8  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 222 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 470 aa  80.5  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0949  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 190 aa  80.5  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0189696  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6414  putative transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275703  normal  0.0113093 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  48.05 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0140  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  31.22 
 
 		 390 aa  75.9  0.0000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1402  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000946721 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 238 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  32.63 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 408 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  35.21 
 
 		 215 aa  71.6  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 216 aa  72  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 388 aa  72  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  49.37 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19040  hypothetical protein  43.27 
 
 		 148 aa  70.1  0.00000000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1417  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.785272  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 228 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  41.25 
 
 		 186 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 410 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1845  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.964527  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1640  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.949601  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1770  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1822  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1620  hypothetical protein  35.11 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3702  ArsR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1507  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 412 aa  66.2  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3558  hypothetical protein  37.23 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.384967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1898  hypothetical protein  37.23 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00577202  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1507  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.759911  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1530  TetR family transcriptional regulator  49.25 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.554786  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1590  hypothetical protein  37.23 
 
 		 254 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.866908  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1786  hypothetical protein  37.23 
 
 		 254 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1640  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.234723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2463  hypothetical protein  33.33 
 
 		 251 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00862525  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3531  regulatory protein, ArsR  41.03 
 
 		 339 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 207 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4179  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1640  transcriptional regulator  37.23 
 
 		 254 aa  63.9  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1509  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.27867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11992  MarR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 406 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  36.79 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1538  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112139  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1561  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.447454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 236 aa  62.8  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2803  ArsR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 212 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 226 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0452  hypothetical protein  41.77 
 
 		 155 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.683451  normal  0.0128011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0296  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 188 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  28.96 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  32.26 
 
 		 215 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4052  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 160 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.587614  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0549  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.166167  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3322  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0559  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 451 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0571  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 428 aa  59.7  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.108649  hitchhiker  0.00715519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>