96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2697 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 173 aa  355  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1521  hypothetical protein  76.72 
 
 		 120 aa  189  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.689528  normal  0.747581 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2572  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  55.74 
 
 		 161 aa  134  5e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3786  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.81 
 
 		 181 aa  130  9e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.849163  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0612  tetratricopeptide TPR_2  43.12 
 
 		 171 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4391  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.74 
 
 		 172 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5130  TPR repeat-containing protein  40.26 
 
 		 175 aa  101  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.22563 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9475  predicted protein  34.38 
 
 		 336 aa  57.8  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.46 
 
 		 1038 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  31.78 
 
 		 820 aa  54.3  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1501  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 629 aa  53.5  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.961258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.46 
 
 		 214 aa  50.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.69 
 
 		 553 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  30.69 
 
 		 603 aa  49.3  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  30.21 
 
 		 366 aa  48.9  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30 
 
 		 632 aa  48.5  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 649 aa  48.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 393 aa  47.8  0.00007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 175 aa  47.8  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 520 aa  47.8  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 1252 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  28.28 
 
 		 1252 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2351  hypothetical protein  28.43 
 
 		 395 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.212242  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3216  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 643 aa  47  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000674385  hitchhiker  0.00000466075 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0439  Tetratricopeptide domain protein  26.26 
 
 		 272 aa  46.6  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1699  TPR repeat-containing protein  28.97 
 
 		 409 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.52405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3611  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  25.6 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.253083 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1157  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 522 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0420  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1291  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1184  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  27.83 
 
 		 249 aa  45.8  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 4079 aa  45.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.44 
 
 		 397 aa  45.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  29.59 
 
 		 423 aa  45.4  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30 
 
 		 576 aa  45.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 522 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.1 
 
 		 1101 aa  45.1  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 522 aa  45.1  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 927 aa  45.1  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  24.27 
 
 		 643 aa  45.1  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1288  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  23.61 
 
 		 262 aa  44.7  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 465 aa  44.7  0.0007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 518 aa  44.7  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  28.04 
 
 		 815 aa  44.3  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1256  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  24.53 
 
 		 261 aa  44.3  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 632 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3070  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.52 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  28.44 
 
 		 174 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 612 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 3145 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  29.8 
 
 		 636 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2899  TPR repeat-containing protein  26.26 
 
 		 269 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0678  extracellular ligand-binding receptor  31.58 
 
 		 1073 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.56 
 
 		 878 aa  43.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0616  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.21 
 
 		 647 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  6.1691e-34 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0337  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.78 
 
 		 265 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.72 
 
 		 1022 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0213  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 409 aa  43.1  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 635 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 635 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  30.33 
 
 		 611 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  27.94 
 
 		 582 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  27.38 
 
 		 395 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2980  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0990  tetratricopeptide TPR_2  38.46 
 
 		 281 aa  43.1  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1655  tetratricopeptide TPR_4  30.59 
 
 		 407 aa  42.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.970184 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 718 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 591 aa  42.7  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1957  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.42 
 
 		 375 aa  42.7  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6369  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 607 aa  42.4  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  27.55 
 
 		 217 aa  42  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 1049 aa  42  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.74 
 
 		 645 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  28.1 
 
 		 277 aa  42  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 776 aa  42  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0195  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 247 aa  42  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  27.68 
 
 		 1276 aa  41.6  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.45 
 
 		 565 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2412  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 529 aa  42  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2948  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 249 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3148  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.52 
 
 		 249 aa  42  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000145051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3178  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 211 aa  42  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0335083  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 250 aa  42  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 836 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2203  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 331 aa  41.2  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.12 
 
 		 810 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5004  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 699 aa  41.2  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4022  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 628 aa  41.2  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.04 
 
 		 758 aa  41.2  0.008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1816  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.51 
 
 		 174 aa  40.8  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.706847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 172 aa  40.8  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0727  putative type 4 fimbrial biogenesis protein PilF  26.43 
 
 		 253 aa  40.8  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2957  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.338311  normal  0.060469 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0547  tetratricopeptide repeat domain protein  25.89 
 
 		 214 aa  40.8  0.01  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0590314  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3161  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 297 aa  40.8  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.58 
 
 		 639 aa  40.8  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>