267 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0857 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0857  general secretion pathway protein H  100 
 
 
152 aa  309  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1378  putative type IV pilus assembly protein FimT  34.78 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.142156  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0829  methylation site containing protein  39.74 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0864  methylation site containing protein  39.74 
 
 
145 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60280  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  29.41 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000431898 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0233  type IV pilin protein  32.45 
 
 
152 aa  68.9  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0215  hypothetical protein  46.58 
 
 
174 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0562308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0852  methylation site containing protein  39.47 
 
 
145 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.992733 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3229  Tfp pilus assembly protein  35.37 
 
 
147 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0021  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  42.86 
 
 
194 aa  67  0.00000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0019  pre-pilin like leader sequence  42.25 
 
 
191 aa  65.5  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.808404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2915  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  33.11 
 
 
157 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3230  fimbrial pilin related signal peptide protein  32.76 
 
 
171 aa  63.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.591415  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0015  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  51.72 
 
 
192 aa  63.2  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3313  methylation site containing protein  29.46 
 
 
144 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.936741  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2909  pilus assembly protein  39.06 
 
 
188 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256003  normal  0.0433853 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0709  methylation site containing protein  29.73 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0962  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  31.69 
 
 
162 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582094  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2522  methylation  31.5 
 
 
179 aa  60.5  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05337  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  31.97 
 
 
181 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.693608 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5190  type 4 fimbrial biogenesis protein FimU  26.58 
 
 
168 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.875037  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0007  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  29.93 
 
 
173 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.24859  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2270  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  40.58 
 
 
187 aa  58.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3425  methylation site containing protein  28.04 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0670  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  25.32 
 
 
214 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.648692  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0262  putative pilin protein FimT  28 
 
 
155 aa  57.4  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.691948 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0713  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  23.93 
 
 
214 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.687986 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5685  Type IV pilus transmembrane protein, FimT  33.56 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.695953  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0866  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  39.13 
 
 
194 aa  56.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197322  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0853  pilin, putative  30.14 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0669  hypothetical protein  29.41 
 
 
192 aa  55.5  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0214  pre-pilin like leader sequence  40.68 
 
 
172 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0250023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2827  Tfp pilus assembly protein  40.68 
 
 
192 aa  56.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2881  methylation site containing protein  42.62 
 
 
170 aa  55.8  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0023  pre-pilin like leader sequence  40.32 
 
 
167 aa  55.1  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2159  Tfp pilus assembly protein FimT  37.68 
 
 
206 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0500  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  34.78 
 
 
218 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2877  methylation  39.66 
 
 
192 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.169243  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0685  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  29.37 
 
 
186 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08256  pili retraction protein PilT  29.92 
 
 
192 aa  53.9  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0686  hypothetical protein  28.57 
 
 
192 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3181  N-terminal methylation site  33.58 
 
 
175 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3829  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  37.31 
 
 
222 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.198337 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1094  type IV pilus biogenesis protein, putative  36.73 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3040  general secretion pathway protein H  30.49 
 
 
177 aa  52.4  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.504644  normal  0.141498 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1108  methylation site containing protein  26.06 
 
 
163 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.105316  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0485  methylation  35.56 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1093  type IV pilus biogenesis protein, putative  41.54 
 
 
178 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3182  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  38.98 
 
 
194 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0783  general secretion pathway protein H  39.13 
 
 
182 aa  52.4  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3549  Tfp pilus assembly protein FimT  33.68 
 
 
201 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.631889  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0091  hypothetical protein  34.15 
 
 
182 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.152728  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2679  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  30.34 
 
 
157 aa  51.6  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.171677 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5193  N-terminal methylation site-containing protein  34.29 
 
 
188 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.17462  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0702  Tfp pilus assembly protein FimT-like protein  28.46 
 
 
186 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.686484  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2552  hypothetical protein  32.58 
 
 
185 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0253  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  44.64 
 
 
168 aa  50.4  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0873  Tfp pilus assembly protein FimT  33.71 
 
 
190 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160532  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003563  type II secretory pathway pseudopilin PulG  31.03 
 
 
163 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2479  pilin-like protein  29.86 
 
 
188 aa  50.1  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.209449  hitchhiker  0.0000256314 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5187  putative type-4 fimbrial pilin related signal peptide protein  41.38 
 
 
187 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0810  type IV pilus biogenesis protein  31.18 
 
 
166 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1864  pilus assembly protein  26.83 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11820  type IV pilus biogenesis protein, FimT  32.65 
 
 
171 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1064  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0722  putative type 4 fimbrial pilin related transmembrane protein  31.94 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.905296 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3225  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1131  type IV pilus biogenesis protein, putative  30 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1143  fimbrillin  48.89 
 
 
180 aa  47.8  0.00005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0896  fimbrillin  48.89 
 
 
180 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3912  hypothetical protein  38.33 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.580591  normal  0.0873326 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0767  hypothetical protein  35.8 
 
 
186 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.130879 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0219  putative type IV pilin  32.18 
 
 
182 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.130638 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0638  fimbrillin  45.65 
 
 
177 aa  47.8  0.00006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.37134  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4116  PHA accumulation regulator DNA-binding-like  24 
 
 
203 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0233722  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3029  methylation site containing protein  26.9 
 
 
155 aa  47.4  0.00008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.305905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3464  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3175  Fimbrial protein pilin  44.64 
 
 
134 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0549  general secretion pathway protein H  32.26 
 
 
164 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0596059 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0872  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0385  putative type IV pilin  35.38 
 
 
184 aa  46.2  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2876  methylation  36.49 
 
 
200 aa  47  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.323846  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  47.62 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18670  prepilin-type N-terminal cleavage/methylation domain protein  27.93 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0898  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1109  type IV pilus biogenesis protein, putative  34.41 
 
 
170 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.014946  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1069  methylation site containing protein  34.85 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0907  hypothetical protein  31.52 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0934  type IV pilus biogenesis protein, putative  32.26 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.153774  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2180  general secretion pathway protein H  40.98 
 
 
146 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.992671  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  46.34 
 
 
167 aa  45.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1440  type II secretion system transmembrane protein  47.46 
 
 
158 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00799419  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1865  pilus assembly protein  56.25 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004287  type 4 fimbrial biogenesis protein FimT  33.33 
 
 
168 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2929  general secretion pathway protein H  36.9 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01320  pre-pilin like leader sequence  31.82 
 
 
157 aa  46.2  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.401301  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1301  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.03 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.397112 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0811  pillin, putative  27.27 
 
 
157 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2713  type IV pilus biogenesis protein, putative  33.33 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000625919  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2914  type IV pilin PilE  42.22 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0462503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>