More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5192 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4805  type II secretion system protein E  97.42 
 
 
388 aa  699    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390977  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5192  type II secretion system protein E  100 
 
 
388 aa  738    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0123395  hitchhiker  0.0000832543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4891  type II secretion system protein E  97.42 
 
 
388 aa  699    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.665011  normal  0.0830382 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1384  type II secretion system protein E  77.98 
 
 
389 aa  548  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192887  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13689  hypothetical protein  80 
 
 
352 aa  509  1e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  4.89789e-18  normal  0.0993973 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5421  type II secretion system protein E  81.08 
 
 
398 aa  496  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.4117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0518  type II secretion system protein E  64.49 
 
 
389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3908  type II secretion system protein E  65.9 
 
 
393 aa  434  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35920  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  65.3 
 
 
395 aa  431  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0276  type II secretion system protein E  65.5 
 
 
372 aa  426  1e-118  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0729  type II secretion system protein E  61.37 
 
 
390 aa  363  4e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0364  type II secretion system protein E  59.12 
 
 
387 aa  359  4e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000591318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0480  type II secretion system protein E  59.24 
 
 
437 aa  344  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0592  type II secretion system protein E  59.33 
 
 
379 aa  336  2.9999999999999997e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5328  type II secretion system protein E  56.91 
 
 
383 aa  334  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.194957  normal  0.192507 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5870  type II secretion system protein E  51.79 
 
 
387 aa  332  5e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000410078  normal  0.124998 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0214  type II secretion system protein E  57.26 
 
 
415 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0128  pilus assembly protein CpaF  57.34 
 
 
398 aa  317  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4421  type II secretion system protein E  56.25 
 
 
401 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0190954 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4039  type II secretion system protein E  56.05 
 
 
401 aa  311  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4838  type II secretion system protein E  59.44 
 
 
400 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4297  type II secretion system protein E  56.01 
 
 
422 aa  289  7e-77  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0512015  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3161  type II secretion system protein E  48.37 
 
 
432 aa  288  8e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.062169 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0318  type II secretion system protein E  57.79 
 
 
514 aa  282  8.000000000000001e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0476276  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0052  type II secretion system protein E  51.63 
 
 
492 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.309192  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0477  type II secretion system protein E  57.93 
 
 
396 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0012388  normal  0.0255206 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1982  type II secretion system protein E  51.65 
 
 
393 aa  276  4e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25820  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  51.18 
 
 
419 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25300  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.86 
 
 
378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3372  type II secretion system protein E  48.58 
 
 
433 aa  265  1e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18190  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  52.87 
 
 
441 aa  252  6e-66  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.654314  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2777  type II secretion system protein E  52.16 
 
 
405 aa  249  7e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0724904  hitchhiker  0.0000140927 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33360  Flp pilus assembly protein, ATPase CpaF  47.88 
 
 
396 aa  249  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.111015  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  43.93 
 
 
476 aa  248  1e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3355  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
488 aa  248  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
467 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3424  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.546087  normal  0.677685 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  44.22 
 
 
474 aa  246  6e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  43.19 
 
 
433 aa  246  6.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
484 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
485 aa  245  8e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
482 aa  245  8e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3931  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
472 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0856952  normal  0.304546 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  44.33 
 
 
515 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  40.88 
 
 
490 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  43.93 
 
 
477 aa  245  9.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  44.33 
 
 
521 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  40.06 
 
 
467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  41.97 
 
 
508 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  42.9 
 
 
488 aa  243  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  44.33 
 
 
520 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  44.33 
 
 
523 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  44.33 
 
 
520 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  44.33 
 
 
520 aa  244  3e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  44.33 
 
 
523 aa  244  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0726  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
492 aa  242  7.999999999999999e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.50497  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0309  type II secretion system protein E  42.95 
 
 
455 aa  241  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
485 aa  241  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  43.19 
 
 
482 aa  241  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  41.83 
 
 
500 aa  241  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  40.45 
 
 
472 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  42.86 
 
 
483 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  43 
 
 
489 aa  241  2e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2224  type II secretion system protein E  44.41 
 
 
386 aa  241  2e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  43.28 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  42.52 
 
 
482 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3966  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
449 aa  240  4e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.406102 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
480 aa  240  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  41.35 
 
 
624 aa  239  5e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  42.52 
 
 
482 aa  239  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  40.86 
 
 
445 aa  239  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1659  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
408 aa  238  9e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  44.08 
 
 
440 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
491 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  41.18 
 
 
491 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  44.44 
 
 
450 aa  238  1e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  40.98 
 
 
468 aa  238  1e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1515  secretory protein kinase, cpaF  42 
 
 
432 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0638595  normal  0.0739759 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  40.52 
 
 
463 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
440 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4360  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
451 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  40 
 
 
441 aa  237  3e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4250  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
451 aa  237  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.558641  normal  0.482793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  43.14 
 
 
417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  44.12 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
482 aa  236  5.0000000000000005e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  41.59 
 
 
447 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  43.09 
 
 
438 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  41.59 
 
 
447 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  41.59 
 
 
447 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1085  secretion ATPase protein  41.27 
 
 
450 aa  236  7e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  40.4 
 
 
472 aa  235  8e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  37.9 
 
 
449 aa  235  8e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  41.59 
 
 
447 aa  235  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000224608 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
438 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
455 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  38.97 
 
 
469 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
457 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  39.34 
 
 
474 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  41.21 
 
 
478 aa  233  4.0000000000000004e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.057514 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>