More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0537 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_3002  TonB-dependent siderophore receptor  63.05 
 
 
717 aa  886    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.527618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2412  TonB-dependent siderophore receptor  62.48 
 
 
717 aa  887    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3330  TonB-dependent siderophore receptor  62.2 
 
 
728 aa  884    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.417694  normal  0.580446 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2853  TonB-dependent receptor, putative  61.85 
 
 
784 aa  878    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0123555  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2047  TonB-dependent siderophore receptor  53.88 
 
 
716 aa  730    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.977961 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3318  TonB-dependent siderophore receptor  56.29 
 
 
710 aa  768    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0535  hypothetical protein  58.74 
 
 
730 aa  808    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0537  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
749 aa  1543    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0190971  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05640  hypothetical protein  58.74 
 
 
730 aa  809    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3657  TonB-dependent receptor  45.61 
 
 
735 aa  588  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.558128  normal  0.251953 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4740  TonB-dependent siderophore receptor  46.04 
 
 
726 aa  583  1.0000000000000001e-165  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.58513  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1526  TonB-dependent siderophore receptor  44.1 
 
 
724 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.970314  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2952  TonB-dependent receptor  56.72 
 
 
399 aa  422  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0594  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 
708 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 
704 aa  345  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 
689 aa  343  5.999999999999999e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3275  TonB-dependent siderophore receptor  34.67 
 
 
742 aa  336  9e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 
707 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2060  TonB-dependent siderophore receptor  34.52 
 
 
708 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.267326  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1931  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 
723 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0298623 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2054  TonB-dependent siderophore receptor  32.78 
 
 
703 aa  333  5e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.314681  normal  0.98162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  32.68 
 
 
707 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 
738 aa  332  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0411  TonB-dependent siderophore receptor  33.72 
 
 
758 aa  329  9e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4489  TonB-dependent siderophore receptor  33.52 
 
 
696 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.515859  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  32.81 
 
 
705 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0109  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
703 aa  325  1e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2631  TonB-dependent siderophore receptor  34.5 
 
 
770 aa  325  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2420  TonB-dependent siderophore receptor  33.78 
 
 
728 aa  324  4e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.36 
 
 
755 aa  324  4e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058066  normal  0.995779 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2855  TonB-dependent siderophore receptor  34.89 
 
 
747 aa  324  4e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4567  TonB-dependent siderophore receptor  34.86 
 
 
746 aa  324  4e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.436524  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0700  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 
776 aa  323  7e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0376627  normal  0.580851 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4232  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
747 aa  319  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1407  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 
705 aa  318  2e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2754  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
747 aa  318  2e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1329  TonB-dependent siderophore receptor  32.95 
 
 
701 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.267924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26420  putative TonB-dependent receptor  32.33 
 
 
718 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0316508  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5560  TonB-dependent receptor  32.4 
 
 
739 aa  312  2e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0831  TonB-dependent receptor plug  32.62 
 
 
721 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.519524  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2243  putative TonB-dependent receptor  32.6 
 
 
720 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0866  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.86038  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1347  TonB-dependent siderophore receptor  31.84 
 
 
696 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.122487  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0859  TonB-dependent siderophore receptor  33.66 
 
 
727 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00225734 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2711  TonB-dependent siderophore receptor  32.11 
 
 
756 aa  301  3e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.192964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2036  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.96 
 
 
756 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1899  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
756 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.49 
 
 
822 aa  300  8e-80  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0877  TonB-dependent siderophore receptor  31.96 
 
 
756 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0596191  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4827  TonB-dependent siderophore receptor  32.96 
 
 
690 aa  297  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.497518 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3193  Outer membrane receptor protein, mostly Fe transport  31.66 
 
 
756 aa  296  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3209  TonB-dependent siderophore receptor family protein  31.66 
 
 
820 aa  296  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 
712 aa  295  2e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3154  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 
756 aa  294  5e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2318  TonB-dependent siderophore receptor  29.09 
 
 
779 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.375964  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3793  TonB-dependent siderophore receptor  30.21 
 
 
720 aa  250  8e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.16695  normal  0.789951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1297  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 
721 aa  243  7e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3326  TonB-dependent receptor, plug  28.9 
 
 
737 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.686308  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3462  hypothetical protein  28.49 
 
 
797 aa  224  7e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.385249 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3362  tonB-dependent receptor family protein  27.25 
 
 
813 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0573796  normal  0.429192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 
719 aa  177  4e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00020  TonB-dependent outer membrane Receptor  33.97 
 
 
601 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000882452  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1987  TonB-dependent siderophore receptor  25.55 
 
 
769 aa  165  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 
707 aa  162  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  26.53 
 
 
527 aa  159  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 
757 aa  159  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  24.67 
 
 
709 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4659  TonB-dependent siderophore receptor  26.07 
 
 
747 aa  151  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  25.84 
 
 
709 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 
792 aa  149  2.0000000000000003e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0904  TonB-dependent siderophore receptor  26.08 
 
 
768 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0551593 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4317  TonB-dependent siderophore receptor  25.7 
 
 
760 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00531839 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  26.96 
 
 
735 aa  147  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  27.13 
 
 
717 aa  146  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0798  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 
773 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.302135 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  23.29 
 
 
770 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2303  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 
710 aa  144  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470584  normal  0.447365 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5128  TonB-dependent receptor  23.96 
 
 
766 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.497755  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3109  TonB-dependent siderophore receptor  23.63 
 
 
710 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 
740 aa  141  4.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0861  TonB-dependent siderophore receptor  25.59 
 
 
780 aa  141  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  24.42 
 
 
703 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0891  TonB-dependent siderophore receptor  25.68 
 
 
763 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.31218 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  25.85 
 
 
694 aa  138  4e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  24.32 
 
 
729 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.81 
 
 
711 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2662  TonB system receptor  24.26 
 
 
680 aa  137  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0618091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 
689 aa  137  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2551  TonB-dependent siderophore receptor  24.12 
 
 
738 aa  137  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000835907  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  25.11 
 
 
708 aa  137  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  26.13 
 
 
715 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1523  TonB-dependent siderophore receptor  25.11 
 
 
727 aa  136  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.249023  normal  0.758259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  25.38 
 
 
703 aa  135  3e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  25.37 
 
 
703 aa  134  6e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58570  putative outer membrane ferric siderophore receptor  23.26 
 
 
753 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.21459  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1826  TonB-dependent siderophore receptor  25.13 
 
 
784 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 
689 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 
706 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  24.29 
 
 
706 aa  130  8.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  24.96 
 
 
700 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.810589 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>