More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2499 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_2499  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
407 aa  828    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5642  extracellular ligand-binding receptor  27.01 
 
 
411 aa  106  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.324496  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3645  extracellular ligand-binding receptor  24.24 
 
 
401 aa  99.8  7e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.218866  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1193  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.15 
 
 
406 aa  96.7  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.31768  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0141  extracellular ligand-binding receptor  24.87 
 
 
406 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.202322  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1095  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  22.91 
 
 
406 aa  95.9  1e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0906  extracellular ligand-binding receptor  26.34 
 
 
439 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1524  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
459 aa  92  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0533175  normal  0.466259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2268  extracellular ligand-binding receptor  22.87 
 
 
413 aa  90.9  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0458822  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1455  extracellular ligand-binding receptor  24.04 
 
 
402 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179211  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1534  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
383 aa  90.9  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.688038  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1972  extracellular ligand-binding receptor  25.38 
 
 
403 aa  90.9  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1439  Extracellular ligand-binding receptor  23.95 
 
 
383 aa  89.7  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0549  extracellular ligand-binding receptor  24.01 
 
 
453 aa  89  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.183642  hitchhiker  0.0000167924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2005  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.37 
 
 
385 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.635473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2303  extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.620777 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0117  extracellular ligand-binding receptor  28.41 
 
 
414 aa  87  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2424  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  23.68 
 
 
383 aa  86.3  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.806831  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1544  extracellular ligand-binding receptor  24.54 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0446  extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
392 aa  85.9  0.000000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2140  extracellular ligand-binding receptor  24.02 
 
 
407 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  28.57 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  25.42 
 
 
409 aa  84  0.000000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0848  extracellular ligand-binding receptor  23.48 
 
 
470 aa  84  0.000000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.762199 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1927  extracellular ligand-binding receptor  26.88 
 
 
406 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195593  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  26.7 
 
 
379 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1823  extracellular ligand-binding receptor  25.91 
 
 
380 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  25.74 
 
 
435 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1734  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  25.56 
 
 
380 aa  79.7  0.00000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.534498  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1671  extracellular ligand-binding receptor  26.35 
 
 
379 aa  79.7  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2189  Extracellular ligand-binding receptor  26.71 
 
 
379 aa  77  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  26.41 
 
 
388 aa  74.7  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  27.36 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1561  extracellular ligand-binding receptor  24.39 
 
 
402 aa  74.3  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0893  extracellular ligand-binding receptor  26.73 
 
 
396 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0861  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.74 
 
 
401 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00284433  normal  0.49325 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0400  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  24.7 
 
 
387 aa  72.8  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0680  extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 
399 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4331  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
373 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2130  extracellular ligand-binding receptor  24.28 
 
 
380 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.482674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  25.61 
 
 
379 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1520  extracellular ligand-binding receptor  27.27 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.657552  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  25.06 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2038  Extracellular ligand-binding receptor  27.08 
 
 
379 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000518039 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  23.35 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3105  Extracellular ligand-binding receptor  24.06 
 
 
389 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0331  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
377 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.179963  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0363  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2271  extracellular ligand-binding receptor  22.58 
 
 
378 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.731283  normal  0.0249434 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  22.82 
 
 
416 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5995  putative leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.24 
 
 
407 aa  68.6  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.524183  normal  0.0200525 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4713  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  28.52 
 
 
414 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.656767  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  27.41 
 
 
410 aa  68.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4443  extracellular ligand-binding receptor  23.82 
 
 
413 aa  67.8  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3253  extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.363046 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2606  Extracellular ligand-binding receptor  25.21 
 
 
373 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0170435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  26.69 
 
 
387 aa  65.9  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1562  extracellular ligand-binding receptor  23.57 
 
 
406 aa  65.1  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775767  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1860  Extracellular ligand-binding receptor  26.18 
 
 
382 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.153544  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  25.67 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  25.2 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1815  extracellular ligand-binding receptor  24.8 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00146471 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  26.79 
 
 
389 aa  64.3  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  27.38 
 
 
400 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4013  extracellular ligand-binding receptor  26.96 
 
 
391 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00118971  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4759  extracellular ligand-binding receptor  23.31 
 
 
421 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2037  Extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
379 aa  63.5  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000596452 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3845  extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
374 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.390057  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
409 aa  63.5  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.89 
 
 
419 aa  63.5  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1785  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.73 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1720  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  23.73 
 
 
371 aa  63.2  0.000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1842  hypothetical protein  26.1 
 
 
405 aa  63.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.839069  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0853  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.08 
 
 
381 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.18061  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5603  Extracellular ligand-binding receptor  22.99 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.442467  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
402 aa  62.8  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4762  extracellular ligand-binding receptor  23.01 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.78314 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2190  Extracellular ligand-binding receptor  25.15 
 
 
379 aa  62.4  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2138  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  25.4 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.469771  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0862  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.4 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.22915  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  26.32 
 
 
371 aa  62  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0772  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic branched-chain amino acid-binding protein  25.4 
 
 
371 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0895  extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  21.76 
 
 
383 aa  61.2  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  25.48 
 
 
410 aa  61.2  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.08 
 
 
425 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4108  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  24.79 
 
 
374 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0910585  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2126  extracellular ligand-binding receptor  22.19 
 
 
416 aa  60.5  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.105916  normal  0.201717 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0326  extracellular ligand-binding receptor  22.81 
 
 
441 aa  60.5  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.933316  normal  0.182521 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0995  Extracellular ligand-binding receptor  26.56 
 
 
379 aa  60.1  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.725983  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0064  Extracellular ligand-binding receptor  22.28 
 
 
421 aa  60.1  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0643  Extracellular ligand-binding receptor  25.07 
 
 
395 aa  59.7  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  24.66 
 
 
384 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1839  leucine-, isoleucine-, valine-, threonine-, and alanine-binding protein precursor  24.52 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201932  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  24.64 
 
 
371 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4935  Extracellular ligand-binding receptor  25.48 
 
 
389 aa  59.3  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.682713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  24.56 
 
 
411 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  25.11 
 
 
404 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>