246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2101 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2101  UspA domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5171  UspA domain-containing protein  54.09 
 
 
283 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1166  UspA domain protein  53.02 
 
 
283 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957514 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2763  hypothetical protein  52.86 
 
 
285 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.723641  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1227  UspA domain-containing protein  47 
 
 
284 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1994  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
284 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0187  UspA domain-containing protein  46.81 
 
 
284 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07090  universal stress protein, UspA  49.65 
 
 
284 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.540561  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0791  UspA domain-containing protein  46.62 
 
 
285 aa  262  6.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0182  universal stress protein  44.84 
 
 
281 aa  254  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1050  UspA domain protein  49.82 
 
 
284 aa  254  2.0000000000000002e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.192596  hitchhiker  0.000149596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1852  UspA domain-containing protein  43.93 
 
 
283 aa  240  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.323758  hitchhiker  0.00188787 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0944  UspA-related nucleotide-binding protein  50.36 
 
 
283 aa  235  6e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0763002  normal  0.265915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2720  UspA domain-containing protein  43.77 
 
 
284 aa  231  8.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.532159 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1910  UspA domain-containing protein  40.21 
 
 
283 aa  226  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0850  UspA domain-containing protein  39.79 
 
 
284 aa  221  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.519772 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2562  universal stress protein  44.29 
 
 
281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.643339  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4471  universal stress protein UspA  38.73 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000777431  hitchhiker  0.00999732 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4601  universal stress protein UspA  38.73 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321646  normal  0.0139056 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1574  UspA domain protein  38.73 
 
 
287 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1816  UspA domain-containing protein  40.78 
 
 
288 aa  201  9e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00317647  normal  0.851658 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1912  UspA domain protein  40.43 
 
 
288 aa  200  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1226  hypothetical protein  36.88 
 
 
287 aa  197  2.0000000000000003e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.594173  normal  0.462548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5068  Universal stress protein  36.75 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3461  hypothetical protein  37.01 
 
 
281 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.148579 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4142  UspA domain-containing protein  35.94 
 
 
281 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0781  hypothetical protein  33.81 
 
 
283 aa  182  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_4258  universal stress protein  35.94 
 
 
281 aa  178  1e-43  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0395352  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1137  UspA domain-containing protein  36.21 
 
 
307 aa  176  4e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1154  hypothetical protein  34.6 
 
 
286 aa  176  6e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2785  hypothetical protein  35.11 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.364827 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0260  UspA-related nucleotide-binding protein  28.11 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2345  hypothetical protein  26.99 
 
 
284 aa  122  8e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.450021 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0174  UspA domain-containing protein  28.62 
 
 
286 aa  120  3e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0137308  normal  0.254776 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2042  hypothetical protein  26.64 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.845392  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0342  putative universal stress protein  27.49 
 
 
286 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1359  UspA domain protein  23 
 
 
281 aa  84.3  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1630  universal stress protein  19.79 
 
 
278 aa  84.7  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  25.61 
 
 
273 aa  82.8  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2241  hypothetical protein  46.81 
 
 
126 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.499289 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2107  UspA domain-containing protein  26.33 
 
 
291 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4433  UspA domain protein  26.7 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4566  UspA domain protein  26.7 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.564371  normal  0.196949 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  24.21 
 
 
288 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4050  hypothetical protein  26.96 
 
 
277 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.946948  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2231  hypothetical protein  28.83 
 
 
278 aa  60.8  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1142  hypothetical protein  28.87 
 
 
279 aa  59.3  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1849  UspA domain-containing protein  30.99 
 
 
277 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0032  UspA domain protein  23.67 
 
 
279 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6103  UspA domain-containing protein  31.58 
 
 
271 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0269268 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4744  hypothetical protein  30.05 
 
 
276 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  28.21 
 
 
300 aa  57.4  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4709  hypothetical protein  27.84 
 
 
278 aa  57  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2727  universal stress protein  30.28 
 
 
140 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.671125  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0348  hypothetical protein  30.67 
 
 
274 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1948  hypothetical protein  34.67 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2238  hypothetical protein  28.85 
 
 
280 aa  55.8  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.289135  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2788  UspA domain protein  29.56 
 
 
271 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1345  hypothetical protein  25.84 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2248  hypothetical protein  25.73 
 
 
277 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3571  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
279 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.620295  normal  0.215578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0578  UspA domain-containing protein  30.92 
 
 
279 aa  55.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.1138  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0381  UspA domain protein  31.54 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0466978  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7779  putative UspA  27.55 
 
 
242 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0208146  normal  0.10666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3885  UspA domain protein  27.8 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0886728  normal  0.0599221 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0056  universal stress protein  33.33 
 
 
157 aa  54.3  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1605  UspA domain-containing protein  30.34 
 
 
280 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.591971  normal  0.475521 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  29.26 
 
 
283 aa  53.1  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0194  UspA domain-containing protein  31.01 
 
 
270 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6131  UspA domain-containing protein  28.35 
 
 
271 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3508  UspA domain-containing protein  30.2 
 
 
286 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364633  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0446  hypothetical protein  29.33 
 
 
274 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.179985  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3817  UspA domain-containing protein  28.87 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.16777  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3815  UspA domain protein  30.2 
 
 
286 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.763121  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4724  UspA domain protein  25.36 
 
 
277 aa  52.8  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5229  UspA domain protein  31.9 
 
 
271 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000806741  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2612  hypothetical protein  29.07 
 
 
291 aa  52.8  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12045  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1366  hypothetical protein  25.96 
 
 
277 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8718  UspA domain protein  31.76 
 
 
280 aa  52  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1300  UspA domain protein  26.27 
 
 
278 aa  52  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.085168  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3893  UspA domain protein  31.33 
 
 
311 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531117  normal  0.217481 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4285  UspA domain-containing protein  27.84 
 
 
279 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.870275  normal  0.299211 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  22.96 
 
 
293 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1854  hypothetical protein  27.44 
 
 
278 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.796292  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2220  UspA domain-containing protein  25.9 
 
 
277 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5897  UspA domain-containing protein  28.8 
 
 
279 aa  51.6  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.793802  normal  0.290079 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4520  Universal stress protein UspA family UspA14  28.93 
 
 
274 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0108751  decreased coverage  0.00456228 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2353  UspA domain-containing protein  26.15 
 
 
276 aa  51.6  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366598  normal  0.604347 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6175  UspA domain protein  28.19 
 
 
280 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1133  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 
279 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2897  UspA domain-containing protein  30.37 
 
 
270 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.185015  decreased coverage  0.00487068 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1983  UspA domain protein  29.61 
 
 
273 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0316321  normal  0.0164528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3567  hypothetical protein  27.56 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6312  UspA domain protein  28.24 
 
 
281 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0400  hypothetical protein  26.17 
 
 
281 aa  50.4  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1702  UspA domain protein  22.49 
 
 
278 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1926  hypothetical protein  23.91 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2619  UspA domain-containing protein  30.46 
 
 
286 aa  50.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.794322  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  26.84 
 
 
305 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0533  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 
282 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.298494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>