185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_02706 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  100 
 
 		 667 aa  1352    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  45.92 
 
 		 647 aa  533  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  34.88 
 
 		 644 aa  378  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  36.94 
 
 		 690 aa  371  1e-101  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  37.13 
 
 		 657 aa  363  4e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  34.15 
 
 		 650 aa  349  1e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  32.45 
 
 		 701 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 664 aa  331  2e-89  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  33.14 
 
 		 658 aa  325  1e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.32 
 
 		 663 aa  324  3e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  33.24 
 
 		 701 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  31.24 
 
 		 679 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  34.35 
 
 		 693 aa  317  4e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  33.47 
 
 		 690 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 		 693 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.6 
 
 		 692 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 691 aa  300  6e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.13 
 
 		 692 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.77 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 653 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  35.87 
 
 		 690 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  35.49 
 
 		 687 aa  279  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 612 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  33.88 
 
 		 601 aa  263  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  33.06 
 
 		 599 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.92 
 
 		 579 aa  254  3e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  34.31 
 
 		 619 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 522 aa  237  6e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.08 
 
 		 646 aa  234  3e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  27.06 
 
 		 572 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  30.34 
 
 		 530 aa  219  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  29.24 
 
 		 612 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.13 
 
 		 572 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  31.91 
 
 		 586 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  29.12 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  26.56 
 
 		 572 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.98 
 
 		 572 aa  214  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.13 
 
 		 544 aa  212  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  30.24 
 
 		 531 aa  213  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27.05 
 
 		 571 aa  213  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.54 
 
 		 517 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  28.11 
 
 		 585 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.18 
 
 		 578 aa  209  1e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 587 aa  199  1.0000000000000001e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 572 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 680 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  28.12 
 
 		 533 aa  187  6e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  29.22 
 
 		 577 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.85 
 
 		 576 aa  179  1e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.78 
 
 		 573 aa  169  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 		 573 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 		 573 aa  159  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  35.35 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  34.85 
 
 		 310 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  25.05 
 
 		 503 aa  137  6.0000000000000005e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.16 
 
 		 595 aa  120  9.999999999999999e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.15 
 
 		 611 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.33 
 
 		 471 aa  102  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  35.15 
 
 		 304 aa  100  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  23.01 
 
 		 564 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 		 320 aa  92.8  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 345 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  30.43 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  40.18 
 
 		 293 aa  79  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  29.87 
 
 		 339 aa  78.2  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  39.29 
 
 		 278 aa  77.4  0.0000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  28.18 
 
 		 344 aa  77  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 220 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  28.93 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 589 aa  73.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.47 
 
 		 339 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.55 
 
 		 651 aa  72  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  27.87 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  23.94 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.06 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.77 
 
 		 346 aa  68.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  28.37 
 
 		 347 aa  68.9  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.29 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  26.38 
 
 		 301 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.24 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  36.71 
 
 		 339 aa  63.9  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 334 aa  62.8  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40.26 
 
 		 273 aa  62.4  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 		 337 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  29.41 
 
 		 299 aa  62.8  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 306 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  28.43 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  22.84 
 
 		 338 aa  60.8  0.00000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 754 aa  60.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.23 
 
 		 344 aa  59.3  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22360  hypothetical protein  32.06 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0925694  normal  0.626592 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  31.78 
 
 		 343 aa  58.2  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  38.54 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  25.22 
 
 		 337 aa  57.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  24.7 
 
 		 327 aa  56.6  0.000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  25.81 
 
 		 363 aa  56.2  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  42.39 
 
 		 335 aa  56.6  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  27.31 
 
 		 340 aa  56.2  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>