More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01848 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  36.74 
 
 		 1167 aa  689    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  36.74 
 
 		 1167 aa  689    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  39.92 
 
 		 1168 aa  753    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1165  chromosome segregation protein SMC  41.85 
 
 		 1163 aa  812    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.126703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1695  chromosome segregation protein SMC  39.94 
 
 		 1170 aa  739    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.573512  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  37.71 
 
 		 1167 aa  682    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0653  chromosome segregation protein SMC  37.45 
 
 		 1169 aa  717    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1524  chromosome partition protein smc  37.66 
 
 		 1169 aa  717    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0697  chromosome segregation protein SMC  39.61 
 
 		 1164 aa  761    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01848  Chromosome segregation ATPase, sms  100 
 
 		 1195 aa  2440    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1774  chromosome segregation protein SMC  49.43 
 
 		 1164 aa  1030    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.21183  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  36.91 
 
 		 1167 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1810  putative chromosome partition protein  36.41 
 
 		 1175 aa  634  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1674  chromosome segregation protein SMC  36.22 
 
 		 1198 aa  629  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0693113  normal  0.0408996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1270  chromosome segregation protein SMC  35 
 
 		 1171 aa  618  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.845906  normal  0.0711674 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2514  chromosome segregation protein SMC  34.68 
 
 		 1170 aa  612  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0530303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1228  condensin subunit Smc  35.54 
 
 		 1165 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  35.91 
 
 		 1198 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4465  chromosome segregation protein SMC  35.49 
 
 		 1175 aa  607  9.999999999999999e-173  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2086  chromosome segregation protein SMC  35.17 
 
 		 1174 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.87089 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  34.73 
 
 		 1109 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1457  chromosome segregation protein SMC  34.14 
 
 		 1173 aa  572  1e-161  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.65 
 
 		 1187 aa  435  1e-120  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44680  putative chromosome segregation protein  46.15 
 
 		 1162 aa  424  1e-117  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0150952 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30320  chromosome segregation protein SMC  45.3 
 
 		 1162 aa  426  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3658  chromosome segregation SMC protein, putative  46.93 
 
 		 1162 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1879  condensin subunit Smc  42.23 
 
 		 1168 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00135504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3806  chromosome segregation protein SMC  45.79 
 
 		 1162 aa  419  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  30.46 
 
 		 1187 aa  417  9.999999999999999e-116  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3602  chromosome segregation protein SMC  45.22 
 
 		 1162 aa  416  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.111779  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28.37 
 
 		 1189 aa  416  1e-114  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1817  SMC protein, N-terminal:structural maintenance of chromosome protein SMC, C-terminal:SMCs flexible hinge  45.64 
 
 		 1162 aa  412  1e-113  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.445184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2748  condensin subunit Smc  44.3 
 
 		 1162 aa  413  1e-113  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.928329  normal  0.900394 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4276  chromosome segregation protein SMC  45.77 
 
 		 1162 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3840  chromosome segregation protein SMC  45.59 
 
 		 1162 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509302 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1514  SMC family protein  44.15 
 
 		 1139 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.192441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1687  chromosome segregation protein SMC  45.83 
 
 		 1140 aa  406  1e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0207263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1592  chromosome segregation protein SMC  45.59 
 
 		 1162 aa  406  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.843365  normal  0.195769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1799  condensin subunit Smc  58.26 
 
 		 1162 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0884011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1703  chromosome segregation protein SMC  58.72 
 
 		 1138 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00557127  hitchhiker  0.00000000707845 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2656  chromosome segregation protein SMC  58.72 
 
 		 1138 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000574242  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2760  chromosome segregation protein SMC  58.72 
 
 		 1138 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.494661  unclonable  0.00000956134 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2849  chromosome segregation protein SMC  48.51 
 
 		 1133 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000354618  unclonable  0.0000000590997 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2463  chromosome segregation protein SMC  61.84 
 
 		 1144 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000141924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.77 
 
 		 1189 aa  397  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2516  chromosome segregation protein SMC  53.99 
 
 		 1138 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0576231  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  30.04 
 
 		 1186 aa  399  1e-109  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2681  chromosome segregation protein SMC  58.59 
 
 		 1138 aa  397  1e-109  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000886702  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2366  chromosome segregation protein SMC  55.21 
 
 		 1145 aa  399  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00122996  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2898  SMC family protein  58.08 
 
 		 1145 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1573  chromosome segregation protein SMC  55.52 
 
 		 1142 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00374514  hitchhiker  0.000804403 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1567  chromosome segregation protein SMC  54.67 
 
 		 1142 aa  394  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0218486  hitchhiker  0.0000000844837 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2379  chromosome segregation protein SMC  48.12 
 
 		 1141 aa  394  1e-108  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.882333  unclonable  0.00000367062 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1506  chromosome segregation protein SMC  55.37 
 
 		 1142 aa  392  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00012681  hitchhiker  0.00000000387349 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1577  chromosome segregation protein SMC  53.31 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0714092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1735  chromosome segregation protein SMC  65.2 
 
 		 299 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.189301  hitchhiker  0.00000000153461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1736  chromosome segregation protein SMC  42.56 
 
 		 814 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00195971  unclonable  0.00000000014199 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  47.99 
 
 		 1164 aa  375  1e-102  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1164 aa  373  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0679  chromosome segregation protein SMC  39.63 
 
 		 1168 aa  365  3e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1928  chromosome segregation protein SMC  52.41 
 
 		 1170 aa  355  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.5125  normal  0.122807 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2026  chromosome segregation protein SMC  52.41 
 
 		 1170 aa  354  5.9999999999999994e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.676203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5336  chromosome segregation protein SMC  52.41 
 
 		 1170 aa  354  7e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.119827 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2046  chromosome segregation protein SMC  52.11 
 
 		 1170 aa  353  1e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.884019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6051  chromosome segregation protein SMC  52.71 
 
 		 1170 aa  353  1e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1334  chromosome segregation protein SMC  50.76 
 
 		 1171 aa  352  2e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0218063  normal  0.637516 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  47.04 
 
 		 1171 aa  350  8e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2446  chromosome segregation protein SMC  55.05 
 
 		 1170 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.889983  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2502  chromosome segregation protein SMC  55.05 
 
 		 1170 aa  349  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.240456  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3246  chromosome segregation protein SMC  55.05 
 
 		 1170 aa  350  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.318712  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1563  chromosome segregation protein SMC  55.05 
 
 		 1170 aa  349  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.438222  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2019  chromosome segregation protein SMC  52.11 
 
 		 1170 aa  349  2e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1880  chromosome segregation protein SMC  43.22 
 
 		 1165 aa  349  2e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2592  chromosome segregation protein SMC  50.14 
 
 		 1268 aa  348  4e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0653514  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  51.51 
 
 		 1206 aa  348  5e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1337  chromosome segregation protein SMC  54.72 
 
 		 1202 aa  347  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2065  chromosome segregation protein SMC  54.72 
 
 		 1200 aa  347  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  50.87 
 
 		 1172 aa  346  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  41.8 
 
 		 1171 aa  346  2e-93  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  29.62 
 
 		 1308 aa  346  2e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2192  chromosome segregation protein SMC  51.06 
 
 		 1234 aa  340  9e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1732  chromosome segregation protein SMC  36.52 
 
 		 1167 aa  340  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1669  chromosome segregation protein SMC  46.37 
 
 		 1174 aa  332  2e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2594  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1182 aa  331  5.0000000000000004e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2952  chromosome segregation protein SMC  50 
 
 		 1171 aa  328  4.0000000000000003e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0128917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  45.43 
 
 		 1181 aa  327  8.000000000000001e-88  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  50.61 
 
 		 1171 aa  327  1e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2843  chromosome segregation protein SMC  49.55 
 
 		 1175 aa  325  4e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3590  chromosome segregation protein SMC  45.41 
 
 		 1204 aa  319  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0968509  normal  0.0336538 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1401  condensin subunit Smc  54.78 
 
 		 1168 aa  317  6e-85  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.934786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0645  chromosome segregation protein SMC  50.46 
 
 		 1190 aa  313  1e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  51.32 
 
 		 1142 aa  311  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0318  condensin subunit Smc  41.43 
 
 		 1307 aa  303  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0349  SMC protein-like  43.5 
 
 		 1318 aa  299  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0467  SMC domain-containing protein  57.2 
 
 		 1280 aa  293  1e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0501  chromosome segregation protein SMC  33.6 
 
 		 1152 aa  292  2e-77  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0161  chromosome segregation protein SMC  59.29 
 
 		 1167 aa  277  7e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  37.13 
 
 		 1176 aa  262  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  44.48 
 
 		 1199 aa  260  9e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  44.48 
 
 		 1199 aa  259  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>