127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0846 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_0846  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  100 
 
 		 416 aa  823    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1832  glycoside-Pentoside-hexuronide (GPH):cation symporter family protein  66.06 
 
 		 353 aa  455  1e-127  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0506  putative permease  50.74 
 
 		 210 aa  200  5e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02710  Major Facilitator Superfamily transporter  31.96 
 
 		 428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2979  major facilitator superfamily MFS_1  36.41 
 
 		 421 aa  192  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0876079  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0427  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 		 426 aa  155  1e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1988  major facilitator superfamily MFS_1  27.96 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0034  major facilitator superfamily MFS_1  29.78 
 
 		 435 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03160  Na+/melibiose symporter-like transporter  30.21 
 
 		 419 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0806  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 419 aa  125  1e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3996  major facilitator transporter  31.06 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4281  major facilitator superfamily MFS_1  28.65 
 
 		 423 aa  122  8e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.502977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1330  Na+/sugar symporter  27.78 
 
 		 545 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3554  major facilitator transporter  29.3 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3775  major facilitator superfamily MFS_1  28.68 
 
 		 425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3267  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 415 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0780681  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0255  major facilitator transporter  28.41 
 
 		 440 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2528  major facilitator superfamily MFS_1  26.51 
 
 		 451 aa  103  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1439  major facilitator superfamily MFS_1  26.3 
 
 		 426 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0835777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2534  major facilitator superfamily MFS_1  26.02 
 
 		 446 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4387  major facilitator superfamily MFS_1  28.9 
 
 		 429 aa  98.2  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.591192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6833  transporter, major facilitator superfamily  28.61 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  0.570568 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2779  major facilitator transporter  25.56 
 
 		 443 aa  86.3  0.000000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.617635  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_14174  predicted protein  23.94 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0454  major facilitator superfamily MFS_1  24.32 
 
 		 404 aa  81.6  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  0.684757 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2955  major facilitator superfamily MFS_1  24.4 
 
 		 405 aa  79  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3224  major facilitator superfamily MFS_1  28.99 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2450  major facilitator superfamily MFS_1  25.89 
 
 		 407 aa  76.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.557384  normal  0.479748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1836  major facilitator transporter  25.61 
 
 		 440 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.860837  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.9 
 
 		 403 aa  74.3  0.000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0892  major facilitator transporter  26.78 
 
 		 424 aa  71.2  0.00000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.805867  normal  0.497197 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1610  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0921  major facilitator transporter  24.18 
 
 		 402 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2885  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 432 aa  56.2  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00035649  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2757  major facilitator superfamily MFS_1  29.09 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.444506 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1657  major facilitator transporter  32.46 
 
 		 518 aa  55.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3953  major facilitator superfamily MFS_1  26.5 
 
 		 457 aa  54.7  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.210656 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  24.61 
 
 		 388 aa  54.3  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  26.86 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09090  arabinose efflux permease family protein  22.96 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0241408  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0496  major facilitator transporter  26.82 
 
 		 441 aa  53.9  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1886  major facilitator transporter  24.23 
 
 		 501 aa  53.5  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.156331  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1877  major facilitator transporter  36.36 
 
 		 458 aa  53.1  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3769  major facilitator transporter  25.97 
 
 		 433 aa  52.4  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.308958  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1135  major facilitator transporter  25.36 
 
 		 407 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.579458  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  26.37 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.63 
 
 		 394 aa  52.4  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0599  transporter, putative  25.93 
 
 		 501 aa  52.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2003  major facilitator transporter  28.81 
 
 		 530 aa  51.2  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05075  putative sugar transporter  26.36 
 
 		 507 aa  51.6  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0544446  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1403  major facilitator transporter  27.43 
 
 		 505 aa  51.6  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.206645  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0421  major facilitator superfamily MFS_1  22.89 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000714938  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3149  major facilitator superfamily MFS_1  27.65 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4945  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 414 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.395119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  27.54 
 
 		 503 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1776  major facilitator transporter  30 
 
 		 519 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0516559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66510  putative MFS transporter  28.94 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5767  major facilitator family transporter  28.94 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.554362  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1421  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 		 462 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.756224  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2347  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0729  major facilitator transporter  23.95 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.463384  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2336  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2452  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2011  major facilitator superfamily MFS_1  26.83 
 
 		 551 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000990966  hitchhiker  0.000202625 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5122  major facilitator transporter  26.01 
 
 		 414 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30030  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.42 
 
 		 487 aa  47.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00171806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1870  major facilitator transporter  25.11 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2738  major facilitator transporter  28.71 
 
 		 510 aa  47.4  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.934726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1314  Na+/xyloside symporter related transporter  47.83 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.313105  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1925  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 531 aa  47.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2459  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3027  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.148703  normal  0.0146244 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2558  major facilitator transporter  29.46 
 
 		 393 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2108  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 531 aa  47  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  23.31 
 
 		 429 aa  47  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0195  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 398 aa  47  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000282756  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1931  major facilitator transporter  28.73 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0709998  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1015  major facilitator transporter  26.85 
 
 		 502 aa  47  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.134636 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3349  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  27.34 
 
 		 413 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.37424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05310  arabinose efflux permease family protein  24.85 
 
 		 400 aa  46.6  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1519  major facilitator transporter  23.73 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.120358  normal  0.496216 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2408  major facilitator transporter  28.21 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2187  major facilitator transporter  29.75 
 
 		 502 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2246  Na+/xyloside symporter related transporter  25.61 
 
 		 462 aa  46.2  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0984  major facilitator transporter  23.56 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0523  major facilitator transporter  22.07 
 
 		 416 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01240  sugar transporter  29.2 
 
 		 428 aa  46.6  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.686511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2202  major facilitator transporter  23.74 
 
 		 551 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000401875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2233  major facilitator superfamily MFS_1  31.48 
 
 		 422 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000391707 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0894  putative GPH family sugar transporter  24.84 
 
 		 451 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.351001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4118  major facilitator transporter  26.18 
 
 		 416 aa  45.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0207731  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1535  major facilitator transporter  29.21 
 
 		 449 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2069  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0216  hypothetical protein  24.8 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2382  major facilitator transporter  26.6 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.321963  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1874  major facilitator transporter  26.83 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.322942  normal  0.129685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2408  putative 3-hydroxyphenylpropionic transporter MhpT  26.97 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  27.2 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2315  hypothetical protein  28.57 
 
 		 511 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  0.0219591 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4221  major facilitator transporter  38.24 
 
 		 472 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.218171  normal  0.657626 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>