More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0217 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0217  type II secretion system protein E  100 
 
 		 767 aa  1509    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.254644  normal  0.0201912 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0126  type II secretion system protein E  60.46 
 
 		 737 aa  857    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0721545  normal  0.429419 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  30.5 
 
 		 510 aa  137  5e-31  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  25.36 
 
 		 791 aa  136  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  32.12 
 
 		 556 aa  135  3e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  28.32 
 
 		 547 aa  130  6e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  25.14 
 
 		 609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  25.39 
 
 		 542 aa  122  3e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  25.38 
 
 		 797 aa  122  3e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  27.43 
 
 		 749 aa  121  3.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  30.69 
 
 		 628 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 551 aa  120  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  27.67 
 
 		 583 aa  120  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  24.63 
 
 		 682 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 519 aa  117  6e-25  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 591 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  25.78 
 
 		 640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  28.31 
 
 		 549 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  21.73 
 
 		 545 aa  113  2.0000000000000002e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  28.11 
 
 		 549 aa  112  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  30 
 
 		 489 aa  109  2e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  27.2 
 
 		 558 aa  109  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  30.74 
 
 		 492 aa  106  1e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 508 aa  105  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 489 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 490 aa  105  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  30.42 
 
 		 492 aa  105  5e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  30.15 
 
 		 482 aa  104  6e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  28.14 
 
 		 491 aa  104  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  29.78 
 
 		 482 aa  104  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 557 aa  103  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  28.75 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0236  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 482 aa  103  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.505122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 831 aa  102  2e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  24.94 
 
 		 557 aa  102  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  29.18 
 
 		 488 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  29.78 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  29.89 
 
 		 433 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 847 aa  103  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  25.86 
 
 		 654 aa  103  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  29.54 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 480 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  29.54 
 
 		 467 aa  102  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 482 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 483 aa  102  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4000  type II secretion system protein E  30.26 
 
 		 500 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737782  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 991 aa  100  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4190  type II secretion system protein E  29.04 
 
 		 504 aa  100  8e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4479  type II secretion system protein E  29.54 
 
 		 491 aa  100  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 577 aa  100  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  29.78 
 
 		 594 aa  100  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 484 aa  100  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  31.87 
 
 		 440 aa  99.4  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  29.08 
 
 		 444 aa  99.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  23.94 
 
 		 543 aa  98.6  4e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  27.94 
 
 		 485 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  26.2 
 
 		 547 aa  98.2  5e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  26.38 
 
 		 559 aa  98.2  5e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  24.86 
 
 		 546 aa  97.8  6e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  29.78 
 
 		 472 aa  97.8  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2456  component of type IV pilus  31.99 
 
 		 515 aa  97.4  8e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.080834  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3490  type II secretion system protein E  30 
 
 		 478 aa  97.4  8e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.057514 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  33.96 
 
 		 311 aa  97.4  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 612 aa  97.4  9e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 440 aa  96.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  27.96 
 
 		 451 aa  97.1  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 546 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4191  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 491 aa  97.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  26.05 
 
 		 546 aa  96.7  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1876  type IV pilus assembly protein  31.62 
 
 		 523 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.483104  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2044  component of type IV pilus  31.62 
 
 		 521 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.101478  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 1319 aa  96.3  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1888  type IV pilus assembly protein  31.62 
 
 		 523 aa  95.9  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.414931  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0828  CpaF  31.62 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 608 aa  95.9  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1677  CpaF  31.62 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.521474  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0333  CpaF  31.62 
 
 		 520 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0947071  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2018  type II secretion system protein E  29.63 
 
 		 445 aa  94.7  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06193  flp pilus assembly ATPase CpaF  31.31 
 
 		 423 aa  94.7  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  29.41 
 
 		 476 aa  94.4  7e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  28.83 
 
 		 1335 aa  94.4  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  27.75 
 
 		 557 aa  93.6  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2054  type II secretion system protein E  30.88 
 
 		 474 aa  93.6  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00068555  normal  0.102531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  29.78 
 
 		 460 aa  93.6  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  29.89 
 
 		 477 aa  93.6  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2692  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 462 aa  94  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1640  type II secretion system protein E  28.01 
 
 		 417 aa  92.8  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.75229  normal  0.33759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2160  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 438 aa  93.2  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0397447  normal  0.0352451 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 1255 aa  92.4  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0372  type II/IV secretion system protein, ATP binding domain  30.19 
 
 		 428 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00402347  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 624 aa  92.4  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  28.77 
 
 		 572 aa  92  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  27.53 
 
 		 549 aa  91.7  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  23.44 
 
 		 722 aa  91.7  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  29.47 
 
 		 438 aa  91.7  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  29.91 
 
 		 491 aa  91.7  5e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  33.01 
 
 		 468 aa  91.3  6e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  29.21 
 
 		 473 aa  90.9  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>