More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2372 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  66.11 
 
 
595 aa  832    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  66.61 
 
 
595 aa  834    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  100 
 
 
595 aa  1211    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  68.29 
 
 
596 aa  804    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0536  type II secretion system protein E  54.26 
 
 
605 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.466146  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
611 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
611 aa  570  1e-161  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  49.16 
 
 
611 aa  568  1e-160  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  47.75 
 
 
611 aa  565  1.0000000000000001e-159  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  47.91 
 
 
592 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04840  type II secretion system protein E  48.79 
 
 
594 aa  513  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.348138  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  47.71 
 
 
601 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  47.78 
 
 
594 aa  509  1e-143  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0319  type IV pilus biogenesis protein  47.5 
 
 
594 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0249  type II secretion system protein E  47.5 
 
 
594 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  46.97 
 
 
611 aa  508  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  47.95 
 
 
597 aa  502  1e-141  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5424  type II secretion system protein E  47.29 
 
 
594 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.166442  normal  0.0300946 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4301  type II secretion system protein E  48.43 
 
 
594 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  47.14 
 
 
595 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5955  putative secretion pathway ATPase  47.87 
 
 
594 aa  500  1e-140  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.651507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  45.62 
 
 
594 aa  501  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68820  putative secretion pathway ATPase  48.05 
 
 
594 aa  501  1e-140  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  48.12 
 
 
600 aa  495  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  47.54 
 
 
613 aa  496  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1151  type II secretion system protein E  48.19 
 
 
622 aa  492  9.999999999999999e-139  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  45.66 
 
 
604 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  46.59 
 
 
596 aa  493  9.999999999999999e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  46.69 
 
 
598 aa  491  1e-137  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  46.69 
 
 
598 aa  491  1e-137  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  47.79 
 
 
600 aa  491  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  47.27 
 
 
615 aa  488  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  47.08 
 
 
613 aa  480  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  47.25 
 
 
603 aa  481  1e-134  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  47.15 
 
 
595 aa  478  1e-133  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  43.82 
 
 
599 aa  474  1e-132  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5190  type II secretion system protein E  44.61 
 
 
557 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5250  type II secretion system protein E  44.86 
 
 
557 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  43.08 
 
 
595 aa  455  1e-127  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  42.09 
 
 
595 aa  453  1.0000000000000001e-126  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5097  type II secretion system protein E  44.11 
 
 
557 aa  451  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5015  type II secretion system protein E  44.03 
 
 
561 aa  438  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476685  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  40.42 
 
 
558 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  39.53 
 
 
564 aa  411  1e-113  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.71 
 
 
871 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.31 
 
 
558 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.18 
 
 
553 aa  398  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.3 
 
 
571 aa  393  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.84 
 
 
787 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.89 
 
 
562 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.46 
 
 
570 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.38 
 
 
556 aa  386  1e-106  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.89 
 
 
554 aa  387  1e-106  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
570 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.71 
 
 
565 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.85 
 
 
563 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  37.73 
 
 
553 aa  385  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.65 
 
 
564 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.33 
 
 
603 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.82 
 
 
557 aa  379  1e-104  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  40.88 
 
 
575 aa  380  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.66 
 
 
599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.36 
 
 
568 aa  377  1e-103  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.27 
 
 
561 aa  376  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  36.78 
 
 
557 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.66 
 
 
599 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  39.28 
 
 
560 aa  378  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.49 
 
 
555 aa  379  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.11 
 
 
571 aa  376  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  38.59 
 
 
546 aa  375  1e-102  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.45 
 
 
553 aa  375  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.26 
 
 
568 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  39.03 
 
 
823 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
553 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.28 
 
 
599 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.15 
 
 
568 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  38.94 
 
 
557 aa  374  1e-102  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
573 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
567 aa  375  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
559 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.36 
 
 
563 aa  374  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.52 
 
 
568 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  38.69 
 
 
576 aa  369  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.19 
 
 
566 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.92 
 
 
568 aa  371  1e-101  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  40.46 
 
 
578 aa  372  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.36 
 
 
568 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  39.42 
 
 
569 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 
568 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  38.3 
 
 
561 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  38.9 
 
 
746 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.5 
 
 
520 aa  367  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.78 
 
 
568 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.59 
 
 
568 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  37 
 
 
561 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.33 
 
 
806 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.85 
 
 
568 aa  367  1e-100  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.15 
 
 
570 aa  364  2e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.3 
 
 
577 aa  365  2e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.5 
 
 
568 aa  364  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>