More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1837 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1837  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
417 aa  822    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2491  major facilitator family transporter  69.66 
 
 
420 aa  559  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2536  major facilitator transporter  67.72 
 
 
414 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3501  major facilitator transporter  38.08 
 
 
429 aa  265  1e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0690392 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1564  major facilitator transporter  38.04 
 
 
400 aa  232  1e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1368  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 
415 aa  206  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.16217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2676  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 
432 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.164208  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2246  major facilitator superfamily MFS_1  27.17 
 
 
427 aa  178  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0450  major facilitator transporter  28.02 
 
 
410 aa  142  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0280887  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0803  major facilitator superfamily MFS_1  31.45 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4993  major facilitator transporter  31.01 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.691753  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4177  major facilitator transporter  28.74 
 
 
405 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3349  major facilitator transporter  30.92 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.242052 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5027  major facilitator superfamily MFS_1  30.97 
 
 
414 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.177434  normal  0.163656 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3245  major facilitator transporter  29.16 
 
 
411 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178164  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3980  major facilitator transporter  29.2 
 
 
411 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.302905  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3142  hypothetical protein  30.77 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.856051  normal  0.126426 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2043  major facilitator transporter  33.6 
 
 
405 aa  102  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4836  major facilitator superfamily MFS_1  28.1 
 
 
423 aa  94  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0503623 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1135  major facilitator transporter  27.04 
 
 
388 aa  90.5  4e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.551185  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0618  major facilitator superfamily MFS_1  29.21 
 
 
391 aa  88.6  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  25.13 
 
 
428 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2330  major facilitator transporter  25.27 
 
 
386 aa  82.8  0.00000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.077775  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5067  MFS superfamily transporter  28.18 
 
 
395 aa  82  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.875929 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3400  hypothetical protein  27.03 
 
 
393 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0535164 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10910  major facilitator transporter  27.7 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0129173  normal  0.971248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3989  major facilitator superfamily transporter  26.33 
 
 
426 aa  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4101  major facilitator superfamily MFS_1  26.27 
 
 
426 aa  77  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5052  major facilitator transporter  25.7 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.344485  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5808  major facilitator transporter  25.7 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499125  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1751  major facilitator superfamily MFS_1  27.35 
 
 
401 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.210188 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4131  major facilitator superfamily MFS_1  26.06 
 
 
426 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6958  major facilitator superfamily MFS_1  25.82 
 
 
427 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.300756  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2772  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4585  major facilitator transporter  25 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282305  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4428  major facilitator transporter  27.39 
 
 
428 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00672186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1883  major facilitator superfamily MFS_1  26.79 
 
 
421 aa  73.9  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3425  major facilitator transporter  23.33 
 
 
429 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0911  major facilitator superfamily permease  25 
 
 
388 aa  73.2  0.000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1673  major facilitator superfamily MFS_1  33.03 
 
 
391 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4199  major facilitator transporter  24.11 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.153637  normal  0.361901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0865  major facilitator transporter  26.13 
 
 
430 aa  70.5  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1328  major facilitator superfamily MFS_1  24.23 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7578  major facilitator transporter  26.71 
 
 
415 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4569  major facilitator superfamily MFS_1  24.11 
 
 
433 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.732281  normal  0.0800324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0227  major facilitator transporter  31.2 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358089  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2156  major facilitator transporter  26.65 
 
 
391 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000582511 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2172  major facilitator transporter  31.06 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.072779 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5075  major facilitator transporter  24.31 
 
 
430 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4716  major facilitator superfamily MFS_1  23.41 
 
 
433 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719513 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1504  major facilitator transporter  25.65 
 
 
428 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0043837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3053  major facilitator transporter  23.86 
 
 
425 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6043  major facilitator transporter  27.04 
 
 
415 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.100748 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5368  major facilitator transporter  26.34 
 
 
432 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.823594 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3052  major facilitator family transporter  26.05 
 
 
413 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0742962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2915  major facilitator transporter  24.18 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0480984  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3013  major facilitator transporter  27.63 
 
 
408 aa  67  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0393248 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0641  major facilitator transporter  26.93 
 
 
408 aa  66.6  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4384  major facilitator superfamily MFS_1  25.38 
 
 
460 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.897653 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4945  major facilitator transporter  30.94 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3215  major facilitator transporter  30.94 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.846569 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1367  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
446 aa  65.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7178  major facilitator transporter  25.88 
 
 
441 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.888458 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2210  major facilitator transporter  23.85 
 
 
455 aa  65.1  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1588  major facilitator transporter  26.58 
 
 
442 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2542  major facilitator superfamily MFS_1  26.97 
 
 
400 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1735  major facilitator transporter  28.15 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1607  major facilitator transporter  27.04 
 
 
442 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.164124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1773  major facilitator superfamily MFS_1  23.15 
 
 
441 aa  64.7  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0282  major facilitator transporter  26.4 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00202623 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3675  major facilitator superfamily MFS_1  28.03 
 
 
410 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0256962  hitchhiker  0.000000000790745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5683  major facilitator transporter  26.87 
 
 
415 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.660955  normal  0.0309673 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3215  major facilitator transporter  23.56 
 
 
430 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.274791  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0394  major facilitator transporter  26.59 
 
 
414 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1479  major facilitator transporter  23.83 
 
 
405 aa  63.2  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.675029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4707  MFS family transporter  30.91 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.759386  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6417  major facilitator transporter  24.24 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.386481 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3023  major facilitator transporter  23.33 
 
 
424 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.367372 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4099  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  25.39 
 
 
433 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1044  major facilitator transporter  27.07 
 
 
396 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.122672 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5906  major facilitator transporter  26.59 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.544672  hitchhiker  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53780  MFS family transporter  30.91 
 
 
415 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.033353  normal  0.109422 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4843  major facilitator transporter  27.04 
 
 
442 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000178164  normal  0.0122394 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4501  phthalate permease family protein  22.97 
 
 
427 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.131797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64750  putative MFS transporter  25.2 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1011  major facilitator transporter  24.32 
 
 
434 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1771  major facilitator transporter  25.97 
 
 
412 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.156898  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5623  MFS family transporter  25.5 
 
 
446 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0703  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  24.87 
 
 
460 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119379  normal  0.0930092 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2363  major facilitator transporter  27.84 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0416  general substrate transporter  24.23 
 
 
424 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  27.01 
 
 
412 aa  60.8  0.00000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6220  major facilitator superfamily MFS_1  23.48 
 
 
437 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000198759  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3632  major facilitator superfamily transporter  25.48 
 
 
391 aa  60.1  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07167  conserved hypothetical protein  30.86 
 
 
521 aa  59.7  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5112  major facilitator superfamily protein  23.76 
 
 
418 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6214  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
433 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2729  drug resistance transporter, putative  29.22 
 
 
469 aa  59.7  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.781327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1482  major facilitator superfamily MFS_1  23.33 
 
 
451 aa  59.7  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000115751  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5072  major facilitator family transporter  25 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.348741  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>