70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2830 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2830  conjugal transfer protein TrbL  100 
 
 		 454 aa  867    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.216703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3857  conjugal transfer protein TrbL  62.08 
 
 		 450 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0260483  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3833  conjugal transfer protein TrbL  65.49 
 
 		 454 aa  483  1e-135  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00915506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3218  conjugal transfer protein TrbL  62.93 
 
 		 452 aa  462  1e-129  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.191716  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7747  conjugal transfer protein TrbL  64.75 
 
 		 449 aa  459  9.999999999999999e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0292615  normal  0.0769303 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2318  conjugal transfer protein TrbL  61.45 
 
 		 448 aa  461  9.999999999999999e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.774569  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0743  conjugal transfer protein TrbL  64.84 
 
 		 450 aa  455  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.96246 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0693  conjugal transfer protein TrbL  63.64 
 
 		 451 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2884  conjugal transfer protein TrbL  64.1 
 
 		 450 aa  449  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.923893  normal  0.0750106 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3092  conjugal transfer protein TrbL  59.43 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2998  conjugal transfer protein TrbL  62.33 
 
 		 451 aa  435  1e-121  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0961  conjugal transfer protein TrbL  58.42 
 
 		 468 aa  432  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2094  conjugal transfer protein TrbL  63.68 
 
 		 414 aa  432  1e-120  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.106471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1188  conjugal transfer protein TrbL  63.86 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3547  conjugal transfer protein TrbL  63.86 
 
 		 453 aa  429  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0503  conjugal transfer protein TrbL  62.33 
 
 		 449 aa  427  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.19353  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1478  conjugal transfer protein TrbL  60.31 
 
 		 450 aa  425  1e-118  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3994  conjugal transfer protein TrbL  82.31 
 
 		 429 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.199092  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0601  conjugal transfer protein TrbL  83.03 
 
 		 407 aa  422  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.609195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3200  conjugal transfer protein TrbL  58.37 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.460801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0312  conjugal transfer protein TrbL  53.08 
 
 		 436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0150  conjugal transfer protein TrbL  57.21 
 
 		 439 aa  403  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1505  conjugal transfer protein TrbL  64.53 
 
 		 401 aa  395  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.721101  normal  0.789043 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3535  conjugal transfer protein TrbL  54.63 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1007  conjugal transfer protein TrbL  52.22 
 
 		 419 aa  382  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7446  conjugal transfer protein TrbL  66.55 
 
 		 420 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3370  conjugal transfer protein TrbL  52.11 
 
 		 407 aa  378  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.503626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3697  conjugal transfer protein TrbL  54.9 
 
 		 461 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3895  conjugal transfer protein TrbL  68.95 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.261118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4200  conjugal transfer protein TrbL  65.37 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2273  conjugal transfer protein TrbL  65.32 
 
 		 418 aa  363  2e-99  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3500  conjugal transfer protein TrbL  51.26 
 
 		 450 aa  360  2e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2905  conjugal transfer protein TrbL  63.74 
 
 		 444 aa  360  3e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2693  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 450 aa  355  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.300912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30880  conjugal transfer protein TrbL  63 
 
 		 456 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000015108  unclonable  5.46381e-22 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2608  conjugal transfer protein TrbL  66.16 
 
 		 457 aa  350  2e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1347  conjugal transfer protein TrbL  61.9 
 
 		 459 aa  350  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.133102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1145  P-type conjugative transfer protein TrbL  57.1 
 
 		 387 aa  348  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2650  conjugal transfer protein TrbL  62.27 
 
 		 450 aa  348  9e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  0.77675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0167  conjugal transfer protein TrbL  62.72 
 
 		 438 aa  348  1e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.281494 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1901  conjugal transfer protein TrbL  63 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1322  conjugal transfer protein TrbL  62.64 
 
 		 459 aa  347  2e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1556  conjugal transfer protein TrbL  62.27 
 
 		 461 aa  347  2e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000247967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0432  conjugal transfer protein TrbL  61.54 
 
 		 457 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.8375  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3700  conjugal transfer protein TrbL  62.27 
 
 		 461 aa  345  7e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.182482  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2480  conjugal transfer protein TrbL  65.4 
 
 		 426 aa  345  1e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.206127 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0732  conjugal transfer protein TrbL  60.81 
 
 		 463 aa  343  4e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2578  conjugal transfer protein TrbL  63 
 
 		 457 aa  336  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1288  conjugal transfer protein TrbL  62.27 
 
 		 460 aa  333  3e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2032  conjugal transfer protein TrbL  49.89 
 
 		 449 aa  333  4e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.176924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35660  conjugal transfer protein TrbL  63 
 
 		 457 aa  331  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2356  conjugal transfer protein TrbL  61.54 
 
 		 460 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.144363  normal  0.293284 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2010  conjugal transfer protein TrbL  61.9 
 
 		 464 aa  329  6e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.411126  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1840  conjugal transfer protein TrbL  60.22 
 
 		 387 aa  323  4e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.50791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5370  P-type conjugative transfer protein TrbL  38.24 
 
 		 437 aa  171  2e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.228409  normal  0.443323 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5217  P-type conjugative transfer protein TrbL  36.49 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2346  P-type conjugative transfer protein TrbL  32.91 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007515  Gmet_A3573  Type IV secretory pathway TrbL components-like  32.72 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0464734  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2352  P-type conjugative transfer protein TrbL  33.33 
 
 		 396 aa  127  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.366259  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1714  P-type conjugative transfer protein TrbL  31.72 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00575847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0395  TrbL/VirB6 plasmid conjugal transfer protein  24.58 
 
 		 647 aa  58.2  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2646  P-type conjugative transfer protein TrbL  22.94 
 
 		 463 aa  56.6  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.740918  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0366  trbL protein  28.64 
 
 		 547 aa  55.1  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1488  conjugal transfer protein; TrbL  57.14 
 
 		 70 aa  55.5  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4563  conjugal transfer protein TrbL  26.01 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.87565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2505  Type IV secretory pathway TrbL components-like protein  25.2 
 
 		 541 aa  53.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004334  conjugative transfer protein TrbL  24.29 
 
 		 534 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5382  conjugal transfer protein TrbL  24.52 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0685398 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9261  conjugal transfer protein TrbL  29.58 
 
 		 398 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.24282  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1614  P-type conjugative transfer protein TrbL  25.1 
 
 		 493 aa  45.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>