More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3562 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_07010  translation initiation factor 2  68.95 
 
 		 930 aa  843    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12854  translation initiation factor IF-2  70.45 
 
 		 900 aa  890    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000971271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1211  translation initiation factor IF-2  69.03 
 
 		 951 aa  867    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.186812  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1327  translation initiation factor IF-2  71.45 
 
 		 995 aa  887    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0335521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5834  translation initiation factor IF-2  69.91 
 
 		 1034 aa  867    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23450  translation initiation factor 2  69.95 
 
 		 939 aa  874    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0250989  normal  0.0490514 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0778  translation initiation factor IF-2  70.19 
 
 		 955 aa  901    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.425771  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10320  translation initiation factor 2  56.88 
 
 		 957 aa  855    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0686977  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1715  translation initiation factor IF-2  69.98 
 
 		 934 aa  891    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2152  translation initiation factor IF-2  70.05 
 
 		 938 aa  887    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0901193  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3966  translation initiation factor IF-2  74.14 
 
 		 998 aa  938    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.602986  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1421  translation initiation factor IF-2  69.07 
 
 		 980 aa  843    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1061  translation initiation factor IF-2  73.54 
 
 		 961 aa  905    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.271136  normal  0.0744531 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3562  translation initiation factor IF-2  100 
 
 		 1062 aa  2023    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.558222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14570  translation initiation factor 2  70.96 
 
 		 938 aa  904    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00182457  normal  0.54145 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1370  translation initiation factor IF-2  71.09 
 
 		 999 aa  882    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.515442  normal  0.133918 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1443  translation initiation factor IF-2  70.48 
 
 		 1044 aa  895    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.366242 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3592  translation initiation factor IF-2  69.72 
 
 		 1012 aa  898    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17436  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1426  translation initiation factor IF-2  67.7 
 
 		 954 aa  859    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000203462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2116  translation initiation factor IF-2  71.77 
 
 		 1051 aa  906    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1743  translation initiation factor IF-2  61.14 
 
 		 975 aa  786    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.695409  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0285  translation initiation factor IF-2  60.66 
 
 		 954 aa  792    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2082  translation initiation factor IF-2  71.54 
 
 		 920 aa  887    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2489  translation initiation factor IF-2  67.23 
 
 		 956 aa  830    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.872607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7742  translation initiation factor IF-2  72.41 
 
 		 1051 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1019  translation initiation factor IF-2  55.71 
 
 		 1004 aa  970    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1510  translation initiation factor IF-2  69.95 
 
 		 957 aa  880    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4039  translation initiation factor IF-2  72.63 
 
 		 930 aa  919    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.162941  normal  0.681084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1416  translation initiation factor IF-2  68.93 
 
 		 968 aa  878    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.919668  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2207  translation initiation factor IF-2  68.57 
 
 		 612 aa  843    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000537417  decreased coverage  0.000616715 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1515  translation initiation factor IF-2  70.31 
 
 		 879 aa  973    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.610025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2065  translation initiation factor IF-2  71.54 
 
 		 920 aa  887    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.636635  normal  0.928572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3190  translation initiation factor IF-2  70.54 
 
 		 938 aa  886    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3331  translation initiation factor IF-2  70.46 
 
 		 992 aa  884    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.285011  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2128  translation initiation factor IF-2  71.54 
 
 		 920 aa  887    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524074  normal  0.0207369 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11480  translation initiation factor 2  56.54 
 
 		 969 aa  853    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.21089  normal  0.867698 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1810  translation initiation factor IF-2  54.67 
 
 		 920 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0893364  normal  0.24179 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3188  translation initiation factor IF-2  39.29 
 
 		 1029 aa  624  1e-177  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000140569  normal  0.29235 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2433  translation initiation factor IF-2  40.54 
 
 		 1079 aa  622  1e-176  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.189984  normal  0.802602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  41.95 
 
 		 971 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1586  translation initiation factor IF-2  50.4 
 
 		 884 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000230757  normal  0.126599 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1957  translation initiation factor IF-2  39.39 
 
 		 985 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0900  translation initiation factor IF-2  43.46 
 
 		 882 aa  608  9.999999999999999e-173  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.437883  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1302  translation initiation factor IF-2  48.44 
 
 		 986 aa  604  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.454709  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2981  translation initiation factor IF-2  48.88 
 
 		 980 aa  605  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  2.22631e-28 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1588  translation initiation factor IF-2  51.99 
 
 		 883 aa  600  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0169841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1555  translation initiation factor IF-2  46.68 
 
 		 947 aa  601  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000482401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1901  translation initiation factor IF-2  45.11 
 
 		 882 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.650972  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0963  translation initiation factor IF-2  49.69 
 
 		 921 aa  595  1e-168  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1050  translation initiation factor 2  51.5 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000107022  unclonable  0.0000000303018 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0830  translation initiation factor IF-2  53.61 
 
 		 879 aa  591  1e-167  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.122611  unclonable  0.0000000598475 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0638  translation initiation factor IF-2  54.5 
 
 		 885 aa  588  1e-166  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268252  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0457  translation initiation factor IF-2  49.92 
 
 		 1161 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0926  translation initiation factor IF-2  46.39 
 
 		 888 aa  583  1.0000000000000001e-165  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0148793  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0367  translation initiation factor IF-2  50.42 
 
 		 936 aa  580  1e-164  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000368497  normal  0.59996 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0067  translation initiation factor 2  47.75 
 
 		 907 aa  581  1e-164  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00109363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0402  translation initiation factor IF-2  50.93 
 
 		 911 aa  579  1e-164  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000176778  normal  0.341297 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0174  translation initiation factor IF-2  51.19 
 
 		 898 aa  579  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00015566  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1645  translation initiation factor IF-2  50.59 
 
 		 692 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0509218  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0697  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 922 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.248102  normal  0.307496 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0059  translation initiation factor IF-2  51.77 
 
 		 997 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1309  translation initiation factor IF-2  53.73 
 
 		 924 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0121044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3162  translation initiation factor IF-2  47.87 
 
 		 984 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3781  translation initiation factor IF-2  50.68 
 
 		 873 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.322768  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1662  translation initiation factor IF-2  51.42 
 
 		 822 aa  572  1e-161  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.775404  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03396  translation initiation factor IF-2  50.77 
 
 		 894 aa  572  1e-161  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1779  translation initiation factor IF-2  47.34 
 
 		 915 aa  569  1e-161  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0123912  normal  0.0703365 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1669  translation initiation factor IF-2  50.5 
 
 		 949 aa  570  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1228  translation initiation factor IF-2  53.32 
 
 		 962 aa  572  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00145036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3727  translation initiation factor 2  50.67 
 
 		 949 aa  570  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3389  translation initiation factor IF-2  49.58 
 
 		 896 aa  567  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.479948  hitchhiker  0.00172114 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2047  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 739 aa  567  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3074  translation initiation factor 2  49.83 
 
 		 843 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3422  translation initiation factor IF-2  43.28 
 
 		 1008 aa  567  1e-160  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002609  translation initiation factor 2  49.14 
 
 		 902 aa  568  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1435  translation initiation factor IF-2  46.84 
 
 		 860 aa  567  1e-160  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0755934  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0369  translation initiation factor IF-2  46.89 
 
 		 991 aa  567  1e-160  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0109319  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0175  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0986137  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1155  translation initiation factor IF-2  50.76 
 
 		 732 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000874472  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1762  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.599583  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3060  translation initiation factor IF-2  49.49 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.382802  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1061  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0461842  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1915  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.697386  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1740  translation initiation factor IF-2  47.61 
 
 		 975 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.12282  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1476  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1007  translation initiation factor IF-2  48.24 
 
 		 884 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.605303  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0991  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0637827  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1507  translation initiation factor IF-2  47.76 
 
 		 975 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1020  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1500  translation initiation factor IF-2  47.13 
 
 		 971 aa  565  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0214708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0300  translation initiation factor IF-2  48.56 
 
 		 952 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0137727  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3561  translation initiation factor IF-2  49.07 
 
 		 894 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000180014 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2827  translation initiation factor IF-2  47.09 
 
 		 885 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00613346 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1106  translation initiation factor IF-2  50.25 
 
 		 896 aa  559  1e-158  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4641  translation initiation factor IF-2  47.32 
 
 		 972 aa  559  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.269772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2564  translation initiation factor IF-2  47.31 
 
 		 976 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0419633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0495  translation initiation factor IF-2  49.16 
 
 		 892 aa  560  1e-158  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.221081  normal  0.759489 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0990  translation initiation factor IF-2  47.9 
 
 		 881 aa  561  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.106597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3853  translation initiation factor IF-2  48.36 
 
 		 1058 aa  560  1e-158  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.329833 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2414  translation initiation factor IF-2  51.33 
 
 		 940 aa  561  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>