264 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_1303 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_1303  CRP/FNR family transcriptional regulator  100 
 
 
229 aa  462  1e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1644  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.51 
 
 
200 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1578  CRP/FNR family transcriptional regulator  35.26 
 
 
201 aa  122  6e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1162  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
220 aa  119  3e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0756  CRP/FNR family transcriptional regulator  32.42 
 
 
220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1053  transcriptional regulator, putative  26.34 
 
 
228 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0216294 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2845  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.48 
 
 
226 aa  102  6e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2531  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  26.03 
 
 
226 aa  99  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3951  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.1 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1171  cyclic nucleotide-binding protein  25.45 
 
 
226 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00521884  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0857  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
229 aa  78.2  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0981  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.86 
 
 
246 aa  77.8  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0154476 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2574  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2593  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.03 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.431237  normal  0.296758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2034  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.72 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.663242  normal  0.0439569 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.44 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1360  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.27 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3187  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
231 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0154809 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.24 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1827  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.61 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0993  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.85 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.98476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1491  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.17 
 
 
224 aa  67  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000413534  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0700  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.25 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.259996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2132  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.12 
 
 
293 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263338  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3468  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.79 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3406  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.15 
 
 
227 aa  65.9  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.757412  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6129  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.42 
 
 
267 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255629  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2644  Crp/FNR family transcriptional regulator  23.5 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.446339  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2941  Crp/FNR family transcriptional regulator  24.84 
 
 
235 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3421  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.82 
 
 
241 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2803  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.44 
 
 
229 aa  63.2  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2472  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.28 
 
 
238 aa  62.4  0.000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.3707  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.28 
 
 
232 aa  61.6  0.000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03090  cAMP-binding protein  25.78 
 
 
227 aa  61.6  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0333204  hitchhiker  1.31136e-22 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2706  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.26 
 
 
228 aa  61.2  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154877  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1070  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.4 
 
 
235 aa  61.6  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.105875  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1286  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.38 
 
 
227 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2778  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.75 
 
 
238 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0529131  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1422  cyclic nucleotide-binding protein  22.4 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.309633  normal  0.119588 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0851  CRP/FNR family transcriptional regulator  23.11 
 
 
229 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0183246  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3198  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.88 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2595  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.396823  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.22 
 
 
222 aa  59.7  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1356  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1658  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  23.18 
 
 
222 aa  59.7  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.365354  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2076  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.61 
 
 
234 aa  59.3  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.398696  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1279  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.78 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0123359  normal  0.583782 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0092  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.44 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000552774  hitchhiker  0.0000198015 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1522  cyclic nucleotide-binding  20.72 
 
 
241 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.500349  normal  0.967279 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2118  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.91 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.545546  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1465  Crp/FNR family transcriptional regulator  21.3 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.342125  normal  0.439299 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1643  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.82 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0906  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.74 
 
 
238 aa  56.6  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2437  cyclic nucleotide-binding protein  22.45 
 
 
230 aa  56.2  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.391924 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4621  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.41 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46100  cAMP-regulatory protein  19.59 
 
 
215 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08370  cAMP-regulatory protein  19.07 
 
 
214 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000340418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4140  cyclic nucleotide-binding protein  18.6 
 
 
243 aa  55.1  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0528  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.2 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3444  cyclic nucleotide-binding  19.34 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2600  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.47 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0103419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1669  Crp/FNR family transcriptional regulator  20 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0787  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.58 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0702  cyclic nucleotide-binding protein  21.43 
 
 
233 aa  53.9  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1995  transcriptional regulator  20.7 
 
 
224 aa  53.5  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1779  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.18 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.72161  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1943  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.72 
 
 
239 aa  53.9  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0478  cyclic nucleotide binding domain-containing protein  25 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2376  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.74 
 
 
226 aa  53.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.253524 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0628  transcriptional regulator Dnr  21.36 
 
 
227 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1691  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.89 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00272653  normal  0.637065 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4520  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  18.14 
 
 
236 aa  53.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20120  cAMP-binding protein  20.64 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00290987  normal  0.0142715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0098  CRP/FNR family transcriptional regulator  20.98 
 
 
234 aa  53.1  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.2435  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06870  transcriptional regulator Dnr  21.36 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5062  cyclic nucleotide-binding  18.92 
 
 
254 aa  52.4  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.319018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.34 
 
 
230 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3945  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.32 
 
 
240 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.0000374248  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3943  cAMP-regulatory protein  19.07 
 
 
214 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0705  cyclic nucleotide-binding protein  20.48 
 
 
227 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2611  cyclic nucleotide-binding protein  22.02 
 
 
223 aa  52.8  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000894277  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1012  Crp/FNR family transcriptional regulator  20.27 
 
 
241 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.88102  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0291  Crp/FNR family transcriptional regulator  22.35 
 
 
227 aa  52  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277011  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  21.95 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0079  Crp/FNR family transcriptional regulator  21 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.849443  normal  0.162256 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0740  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  21.17 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1444  Crp/Fnr family transcriptional regulator  20.59 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.920255  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  17.04 
 
 
243 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2630  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  19.27 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00642792  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4121  cyclic nucleotide-binding domain protein  19.4 
 
 
263 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3075  Crp/FNR family transcriptional regulator  19.72 
 
 
239 aa  51.2  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.193734 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1984  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.78 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.513682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1555  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  20.56 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  22.83 
 
 
239 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2417  cyclic nucleotide-binding protein  19.81 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.034588  normal  0.0382931 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2132  Crp/FNR family transcriptional regulator  18.78 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3191  transcriptional regulator Dnr  22.65 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0548  cAMP-regulatory protein  18.85 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.549862  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0698  CRP/FNR family transcriptional regulator  19.46 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A06  Crp-like transcriptional regulator  23.3 
 
 
230 aa  50.8  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>