More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5697 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4728  SSS sodium solute transporter superfamily  62.5 
 
 		 549 aa  686    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192891  hitchhiker  0.00040203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3116  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  62.76 
 
 		 522 aa  676    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3072  SSS sodium solute transporter superfamily  60.7 
 
 		 539 aa  635    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00704051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1152  SSS sodium solute transporter superfamily  59.39 
 
 		 562 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0742973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5697  SSS sodium solute transporter superfamily  100 
 
 		 536 aa  1075    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.479819 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5244  SSS sodium solute transporter superfamily  62.8 
 
 		 545 aa  694    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1927  SSS sodium solute transporter superfamily  59.29 
 
 		 568 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0029053  normal  0.303256 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  55.14 
 
 		 561 aa  585  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3635  SSS sodium solute transporter superfamily  54.08 
 
 		 565 aa  564  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.85975  normal  0.450055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  50.8 
 
 		 561 aa  504  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2732  SSS sodium solute transporter superfamily  50.62 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00679  sodium/glucose cotransport protein  49.81 
 
 		 592 aa  494  9.999999999999999e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0305497  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3840  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.4 
 
 		 523 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.455986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00234  putative sodium/hexose cotransport protein  47.57 
 
 		 520 aa  478  1e-133  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.398389  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1090  sodium/glucose cotransport protein  46.07 
 
 		 520 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.133382 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.94 
 
 		 522 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.135189  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2086  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.63 
 
 		 520 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.275016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1285  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.41 
 
 		 522 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0126503 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2286  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  45.69 
 
 		 519 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1074  SSS sodium solute transporter superfamily  47.57 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.729495  normal  0.0148232 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3335  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.38 
 
 		 520 aa  451  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.736166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0835  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  46.18 
 
 		 522 aa  442  1e-123  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.172463  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2731  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.04 
 
 		 548 aa  438  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.8061 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0491  SSS sodium solute transporter superfamily  43.04 
 
 		 509 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0375697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  37.6 
 
 		 523 aa  276  6e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1387  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  33.19 
 
 		 565 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.108494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0436  SSS sodium solute transporter superfamily  31.49 
 
 		 598 aa  216  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.153082 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  34.23 
 
 		 551 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3906  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.72 
 
 		 533 aa  213  7e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2604  SSS sodium solute transporter superfamily  32.4 
 
 		 557 aa  212  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.916004  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0087  putative symporter YidK  34.92 
 
 		 529 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0471  SSS sodium solute transporter superfamily  32.18 
 
 		 557 aa  206  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3904  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  31.49 
 
 		 526 aa  194  2e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.757586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0970  SSS sodium solute transporter superfamily  34.86 
 
 		 765 aa  192  2e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.000363528  normal  0.258421 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1859  SSS sodium solute transporter superfamily  28.43 
 
 		 551 aa  191  2e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03563  predicted transporter  29.84 
 
 		 571 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.704345  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0024  SSS sodium solute transporter superfamily  29.84 
 
 		 571 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03506  hypothetical protein  29.84 
 
 		 571 aa  183  9.000000000000001e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4044  putative symporter YidK  30.07 
 
 		 571 aa  182  9.000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.978949 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4187  putative symporter YidK  31.75 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5111  putative symporter YidK  30.02 
 
 		 571 aa  182  1e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.393136 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0610  putative symporter YidK  30.65 
 
 		 551 aa  179  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.266517  normal  0.0320256 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0338  putative symporter YidK  30.95 
 
 		 562 aa  177  4e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000369581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3621  SSS sodium solute transporter superfamily  30.09 
 
 		 596 aa  175  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.434287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1283  putative symporter YidK  28.55 
 
 		 531 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4112  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.82 
 
 		 526 aa  169  8e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0592432  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2201  putative symporter YidK  26.63 
 
 		 530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1671  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.39 
 
 		 593 aa  161  3e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0302135 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0578  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.63 
 
 		 473 aa  160  4e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.493945  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3270  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  29.65 
 
 		 474 aa  159  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.291687  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5643  putative symporter YidK  28.49 
 
 		 532 aa  157  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0528726  normal  0.86029 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2774  SSS sodium solute transporter superfamily  27.9 
 
 		 529 aa  158  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00224729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4019  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.38 
 
 		 474 aa  156  8e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000206243 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4407  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.1 
 
 		 613 aa  156  8e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0343463  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  26.5 
 
 		 537 aa  153  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6118  SSS sodium solute transporter superfamily  28.57 
 
 		 562 aa  146  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3709  SSS sodium solute transporter superfamily  27.42 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.174317  normal  0.0274266 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04060  SSS sodium solute transporter  26.74 
 
 		 565 aa  143  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.26 
 
 		 567 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0993  SSS sodium solute transporter superfamily  24.9 
 
 		 569 aa  138  2e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0554078  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14290  SSS sodium solute transporter  26.81 
 
 		 566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2048  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.34 
 
 		 550 aa  117  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3683  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.2 
 
 		 486 aa  117  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0990  SSS sodium solute transporter superfamily  26.11 
 
 		 560 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.394544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0171  SSS sodium solute transporter superfamily  27.59 
 
 		 520 aa  115  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0745729 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4170  Na+/solute symporter  24.29 
 
 		 526 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0688566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.91 
 
 		 542 aa  109  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0176  sodium:solute transporter  24.57 
 
 		 505 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0525  SSS sodium solute transporter superfamily  24.15 
 
 		 522 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.692758  unclonable  0.0000000000137784 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0179  sodium/solute symporter family protein  25 
 
 		 505 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2815  SSS sodium solute transporter superfamily  25.47 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4098  Na+/solute symporter  26.45 
 
 		 486 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0584341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  24.73 
 
 		 483 aa  99.4  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3985  SSS sodium solute transporter superfamily  25.36 
 
 		 527 aa  96.7  9e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000567258  normal  0.756619 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1640  SSS sodium solute transporter superfamily  27.61 
 
 		 566 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2384  SSS sodium solute transporter superfamily  25.72 
 
 		 530 aa  95.9  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04816  alkaline phosphatase synthesis sensor protein phoR  23.43 
 
 		 513 aa  93.6  7e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0609  sodium/solute symporter  24.39 
 
 		 513 aa  93.6  9e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.952879  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13128  sodium/glucose cotransporter  23.08 
 
 		 575 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.194229  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12043  sodium iodide symporter  25.68 
 
 		 547 aa  92  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.48339  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02564  hypothetical protein  23.11 
 
 		 581 aa  91.3  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6588  SSS sodium solute transporter superfamily  24.31 
 
 		 529 aa  90.1  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2962  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.84 
 
 		 574 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.324391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3541  Na+/solute symporter  26.83 
 
 		 597 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.165749  normal  0.131888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.02 
 
 		 472 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3355  Na+/solute symporter  25.83 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.947348 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  24.13 
 
 		 492 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  23.95 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.16 
 
 		 492 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1650  SSS sodium solute transporter superfamily  25.42 
 
 		 483 aa  84.3  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.888495  normal  0.420592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2466  SSS sodium solute transporter superfamily  22.97 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.4963400000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1825  SSS sodium solute transporter superfamily  24.75 
 
 		 533 aa  83.6  0.000000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.915648  normal  0.529366 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24 
 
 		 492 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2608  SSS sodium solute transporter superfamily  27.67 
 
 		 570 aa  82.8  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24 
 
 		 493 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2609  Na+/solute symporter  25.53 
 
 		 566 aa  82.8  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3022  SSS sodium solute transporter superfamily  25.69 
 
 		 883 aa  83.2  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.61129  normal  0.844759 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  23.24 
 
 		 492 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>