138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5531 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  100 
 
 		 461 aa  961    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  41.16 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  29.96 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  29.23 
 
 		 411 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  24.77 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  26.91 
 
 		 441 aa  90.5  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  24.11 
 
 		 411 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  23.7 
 
 		 405 aa  82.8  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  22.67 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  23.92 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  23.45 
 
 		 411 aa  62.8  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 293 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  27.72 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  25.37 
 
 		 450 aa  60.1  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  25.2 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  23.94 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  23.98 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  24.03 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  24.55 
 
 		 406 aa  57  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  23.75 
 
 		 407 aa  55.5  0.000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4760  integrase family protein  23.4 
 
 		 354 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  29.88 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  29.88 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  27.95 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  27.95 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  22.59 
 
 		 354 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 444 aa  52.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1574  integrase family protein  25.1 
 
 		 385 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00294023  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 324 aa  53.1  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_004310  BR1916  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.55 
 
 		 315 aa  52  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.391518  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1844  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.55 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.104424  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.13 
 
 		 324 aa  50.1  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  25.54 
 
 		 302 aa  49.7  0.0001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  27.11 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0891  integrase family protein  38.6 
 
 		 306 aa  49.7  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.87 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  35 
 
 		 296 aa  49.3  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  23.35 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  24.53 
 
 		 436 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  33.33 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  22.44 
 
 		 278 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.23 
 
 		 298 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.27 
 
 		 302 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 302 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.65 
 
 		 311 aa  48.5  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  38.96 
 
 		 298 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  26.25 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  22.22 
 
 		 302 aa  47.4  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.28 
 
 		 284 aa  47.4  0.0006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  28.19 
 
 		 270 aa  47.4  0.0006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 311 aa  47.4  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.27 
 
 		 307 aa  47  0.0007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  41.54 
 
 		 298 aa  47  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 310 aa  47  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1618  Phage integrase  37.25 
 
 		 150 aa  47  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2381  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.83 
 
 		 311 aa  47  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  24.09 
 
 		 419 aa  47  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5165  integrase family protein  22.65 
 
 		 291 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  25.45 
 
 		 313 aa  46.6  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  36.14 
 
 		 313 aa  46.6  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.17 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2933  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.26 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  24.34 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.38 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  24.53 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  25.98 
 
 		 301 aa  45.8  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.91 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 298 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.59 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  30 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  24.05 
 
 		 430 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15290  tyrosine recombinase XerD subunit  33.33 
 
 		 332 aa  45.1  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.203953  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1615  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 368 aa  45.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0481425  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  27.59 
 
 		 342 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  29.76 
 
 		 283 aa  45.1  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.96 
 
 		 404 aa  45.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  31.25 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  29.85 
 
 		 307 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  30 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  38.03 
 
 		 324 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.37 
 
 		 303 aa  44.7  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 		 298 aa  44.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  29.85 
 
 		 307 aa  44.3  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  25 
 
 		 298 aa  44.3  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  35.62 
 
 		 343 aa  44.3  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  44.44 
 
 		 309 aa  43.9  0.006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  29.85 
 
 		 307 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.04 
 
 		 305 aa  43.9  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  32.69 
 
 		 294 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 296 aa  43.5  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 277 aa  43.5  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>