244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1618 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1618  Phage integrase  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1213  ferredoxin, 4Fe-4S  36.94 
 
 		 288 aa  98.2  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.14 
 
 		 384 aa  68.2  0.00000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  31.85 
 
 		 379 aa  67.4  0.00000000006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  35.11 
 
 		 404 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.57 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  32.31 
 
 		 429 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.37 
 
 		 412 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.48 
 
 		 412 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  29.2 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 393 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 337 aa  55.5  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  29.2 
 
 		 401 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.17 
 
 		 388 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.61 
 
 		 444 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0021  phage integrase family protein  28.77 
 
 		 324 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.135699  hitchhiker  0.00129232 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0036  integrase family protein  29.45 
 
 		 324 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.95657  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.47 
 
 		 400 aa  53.5  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.57 
 
 		 159 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  29.25 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  29.17 
 
 		 307 aa  52.4  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.46 
 
 		 367 aa  52  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4243  phage integrase  29.14 
 
 		 309 aa  52  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000426285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1922  integrase family protein  28.57 
 
 		 401 aa  52  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.612381  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  32.81 
 
 		 411 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  37.84 
 
 		 307 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  25.85 
 
 		 328 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0110  integrase family protein  26.03 
 
 		 324 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.126491  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  28.24 
 
 		 451 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2146  phage integrase family protein  38.98 
 
 		 663 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2840  integrase family protein  29.05 
 
 		 322 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0238888  normal  0.278729 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  29.41 
 
 		 407 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.67 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  27.06 
 
 		 451 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4645  phage integrase family protein  31.21 
 
 		 360 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.87 
 
 		 397 aa  50.1  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 451 aa  50.1  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  31.41 
 
 		 295 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  27.06 
 
 		 456 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  31.88 
 
 		 270 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51650  putative integrase  28.38 
 
 		 426 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000506916  hitchhiker  0.0000630791 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  28.46 
 
 		 342 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  26.71 
 
 		 284 aa  49.3  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0264  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.34 
 
 		 315 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  27.69 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  27.69 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  27.69 
 
 		 292 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  51.22 
 
 		 436 aa  47.8  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  26.52 
 
 		 349 aa  47.8  0.00005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  31.16 
 
 		 356 aa  47.8  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 298 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  33.04 
 
 		 416 aa  47.8  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4434  phage integrase family site specific recombinase  27.7 
 
 		 427 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  31.01 
 
 		 283 aa  47.4  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 372 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2277  phage integrase  28.17 
 
 		 310 aa  47  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.000555272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  48.78 
 
 		 436 aa  47  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  27.74 
 
 		 354 aa  47  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  27.63 
 
 		 282 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  29.5 
 
 		 274 aa  47  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1421  Phage integrase  27.16 
 
 		 468 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.602834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  27.66 
 
 		 310 aa  46.2  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1743  Phage integrase  36.51 
 
 		 270 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28 
 
 		 298 aa  46.6  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  29.69 
 
 		 359 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  22.88 
 
 		 392 aa  46.6  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  37.25 
 
 		 461 aa  47  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  28.39 
 
 		 278 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 310 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  28.46 
 
 		 291 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  24.46 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  27.94 
 
 		 298 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  26.28 
 
 		 306 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  30.15 
 
 		 295 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.27 
 
 		 434 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  27.48 
 
 		 417 aa  46.2  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3108  integrase family protein  27.52 
 
 		 292 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000512092  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  24.46 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  24.46 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.62 
 
 		 397 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  24.46 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 		 411 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  30.34 
 
 		 322 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  27.48 
 
 		 394 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  32.28 
 
 		 253 aa  45.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  31.06 
 
 		 406 aa  45.4  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  30 
 
 		 325 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  29.55 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  29.55 
 
 		 331 aa  45.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2316  phage integrase  33.58 
 
 		 214 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3642  phage integrase family protein  28.67 
 
 		 305 aa  45.4  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000185721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 402 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36590  phage integrase  26.35 
 
 		 415 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.706618  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  27.48 
 
 		 394 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  26.53 
 
 		 419 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2334  integrase family protein  29.91 
 
 		 444 aa  44.7  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.74243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.34 
 
 		 303 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3558  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 311 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>