More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0788 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0546  diguanylate cyclase  54.28 
 
 		 792 aa  847    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.482559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0788  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 866 aa  1769    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940486  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2851  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  56.79 
 
 		 807 aa  917    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3412  diguanylate cyclase with TPR repeats  38 
 
 		 816 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690369  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2188  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.17 
 
 		 801 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.73077 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1730  diguanylate cyclase and serine/threonine protein kinase with TPR repeats  46.68 
 
 		 974 aa  300  5e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000283057  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  29.33 
 
 		 878 aa  89.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.76 
 
 		 810 aa  87.8  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  29.07 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.03 
 
 		 632 aa  76.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  27.16 
 
 		 280 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  25.34 
 
 		 576 aa  73.2  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  23.87 
 
 		 3145 aa  72.4  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 1276 aa  71.2  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.85 
 
 		 927 aa  70.1  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.39 
 
 		 1022 aa  70.1  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1483  TPR repeat-containing protein  28.67 
 
 		 221 aa  69.7  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  27.91 
 
 		 732 aa  68.2  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3194  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  29.63 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.756541  hitchhiker  0.0088423 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.11 
 
 		 1056 aa  67.8  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 523 aa  67.8  0.0000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1211  TPR domain/sulfotransferase domain protein  28.23 
 
 		 695 aa  67.8  0.0000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 827 aa  67.8  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  29.52 
 
 		 762 aa  67.4  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1308  Flp pilus assembly protein TadD  29.18 
 
 		 272 aa  66.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.59735e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  27.43 
 
 		 988 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 750 aa  65.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4159  TPR repeat-containing protein  23.3 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00004642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.91 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  29.25 
 
 		 626 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  26.97 
 
 		 833 aa  64.7  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0362  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 804 aa  64.7  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.587657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  28.3 
 
 		 626 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 543 aa  64.7  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 614 aa  64.7  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  28.78 
 
 		 1038 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24071  hypothetical protein  27.44 
 
 		 622 aa  63.9  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0486  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 965 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3469  TPR repeat-containing protein  31.71 
 
 		 1161 aa  63.9  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 565 aa  63.5  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  25.11 
 
 		 649 aa  63.5  0.00000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 356 aa  64.3  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4054  sporulation domain-containing protein  27.43 
 
 		 538 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  26.7 
 
 		 545 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.88 
 
 		 587 aa  63.2  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0484  TPR repeat-containing protein  25.94 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 589 aa  62.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  28.66 
 
 		 681 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.39 
 
 		 2401 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  26.13 
 
 		 808 aa  62.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 626 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 636 aa  62.4  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1096  sulfotransferase  28.19 
 
 		 1764 aa  62  0.00000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  27.83 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 614 aa  62  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  22.13 
 
 		 730 aa  62.4  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  21.89 
 
 		 352 aa  62  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  23.21 
 
 		 1486 aa  61.6  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 637 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 562 aa  61.6  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  27.78 
 
 		 764 aa  61.6  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 		 1069 aa  61.2  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  27.11 
 
 		 613 aa  61.6  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  24.44 
 
 		 863 aa  61.2  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  25.12 
 
 		 635 aa  61.2  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  25.23 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 718 aa  61.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1406 aa  60.8  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2328  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 363 aa  60.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.759887 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.03 
 
 		 1127 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 614 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 		 265 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2065  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.145613  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  29.5 
 
 		 612 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 332 aa  59.7  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  24.83 
 
 		 707 aa  60.1  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  28.25 
 
 		 340 aa  59.7  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2870  type IV pilus biogenesis/stability protein PilW  29.38 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0276  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.54 
 
 		 624 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2755  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 234 aa  59.7  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 3172 aa  59.7  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5149  TPR repeat-containing protein  27.44 
 
 		 1105 aa  59.3  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000182587  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  26.58 
 
 		 706 aa  59.3  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3197  O-GlcNAc transferase, p110 subunit  30.36 
 
 		 395 aa  59.7  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.187148  normal  0.017581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 4079 aa  58.9  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0765  tetratricopeptide TPR_2  25.84 
 
 		 1180 aa  59.3  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.82828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  27.23 
 
 		 465 aa  58.9  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2198  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 209 aa  58.9  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  30.72 
 
 		 374 aa  58.9  0.0000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 792 aa  58.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3746  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 		 602 aa  58.5  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.824926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.31 
 
 		 1056 aa  58.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 505 aa  58.5  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2243  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.6122  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.26 
 
 		 404 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1955  TPR repeat-containing protein  26.24 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0490064  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>