More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_2182 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  46.33 
 
 		 898 aa  778    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  41.94 
 
 		 1111 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  100 
 
 		 911 aa  1871    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  42.16 
 
 		 1111 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  45.08 
 
 		 847 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  42.38 
 
 		 1111 aa  651    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  41.88 
 
 		 1114 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  42.6 
 
 		 1111 aa  653    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  41.52 
 
 		 895 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04253  Rhs element Vgr protein  46.41 
 
 		 612 aa  504  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02036  Rhs element Vgr protein  44.48 
 
 		 587 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.372394  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  35.31 
 
 		 918 aa  445  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02038  Rhs element Vgr protein  50 
 
 		 477 aa  433  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.307189  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.26 
 
 		 875 aa  414  1e-114  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  34.19 
 
 		 933 aa  410  1e-113  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  33.15 
 
 		 871 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  32.91 
 
 		 869 aa  406  1e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  31.81 
 
 		 1074 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  30.58 
 
 		 958 aa  385  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  31.1 
 
 		 1057 aa  382  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  32.03 
 
 		 851 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  31.32 
 
 		 1057 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2686  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 891 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.308688  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  30.76 
 
 		 853 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 		 1063 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  30.95 
 
 		 1063 aa  375  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  30.8 
 
 		 1063 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2559  type VI secretion system Vgr family protein  30.7 
 
 		 895 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0352  type VI secretion system Vgr family protein  30.48 
 
 		 1059 aa  372  1e-101  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2668  type VI secretion system Vgr family protein  30.13 
 
 		 895 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2639  Rhs element Vgr protein  29.7 
 
 		 895 aa  369  1e-100  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2028  Rhs element Vgr protein  29.59 
 
 		 895 aa  366  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14177  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  29.98 
 
 		 1094 aa  364  4e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  31.79 
 
 		 920 aa  362  2e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  31.58 
 
 		 920 aa  360  9.999999999999999e-98  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4023  Rhs element Vgr protein  30.12 
 
 		 923 aa  347  6e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.78403 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  31 
 
 		 979 aa  345  2.9999999999999997e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  29.87 
 
 		 850 aa  344  4e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3567  Rhs element Vgr protein  30.6 
 
 		 892 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  30.27 
 
 		 852 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  29.64 
 
 		 868 aa  333  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2922  type VI secretion system Vgr family protein  29.94 
 
 		 853 aa  332  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.228171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0475  Rhs element Vgr protein  29.32 
 
 		 853 aa  330  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.494661  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0410  type VI secretion system Vgr family protein  29.63 
 
 		 853 aa  328  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  29.74 
 
 		 850 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  31.53 
 
 		 928 aa  325  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 		 850 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  29.74 
 
 		 850 aa  325  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  29.94 
 
 		 906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02054  Rhs element Vgr protein  31.5 
 
 		 849 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  30.15 
 
 		 906 aa  322  1.9999999999999998e-86  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01940  putative VGR-related protein  29.95 
 
 		 1006 aa  310  5.9999999999999995e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  30.55 
 
 		 927 aa  299  1e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  30.92 
 
 		 730 aa  298  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2999  Rhs element Vgr protein  28.39 
 
 		 910 aa  296  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_003296  RS04687  putative VGR-related protein  30.41 
 
 		 962 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  29.07 
 
 		 947 aa  292  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_003296  RS03738  putative VGR-related protein  27.91 
 
 		 957 aa  290  9e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0894  type VI secretion system Vgr family protein  28.87 
 
 		 886 aa  286  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  28.11 
 
 		 984 aa  280  8e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5512  Rhs element Vgr protein  26.73 
 
 		 902 aa  280  1e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 946 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  28.63 
 
 		 946 aa  273  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6440  type VI secretion system Vgr family protein  28.19 
 
 		 843 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.720009  normal  0.358804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  33.9 
 
 		 616 aa  272  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  28.53 
 
 		 946 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  28.2 
 
 		 935 aa  270  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 935 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 935 aa  269  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 935 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  28.31 
 
 		 935 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4099  Rhs element Vgr protein  28.26 
 
 		 890 aa  269  2e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  28.49 
 
 		 935 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  27.61 
 
 		 942 aa  267  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2630  Rhs element Vgr protein  30.79 
 
 		 847 aa  266  1e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.690564  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  27.87 
 
 		 935 aa  263  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  27.56 
 
 		 981 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  28.82 
 
 		 932 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3859  type VI secretion system Vgr family protein  28.28 
 
 		 901 aa  263  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  26.64 
 
 		 968 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5680  type VI secretion system Vgr family protein  27.94 
 
 		 975 aa  259  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.555449  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0207  Rhs element Vgr protein  27.22 
 
 		 855 aa  257  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.118716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44900  hypothetical protein  27.05 
 
 		 842 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0151345  normal  0.422437 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03220  hypothetical protein  27.18 
 
 		 1019 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000195826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2840  Rhs element Vgr protein  27.35 
 
 		 838 aa  256  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.363054  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  33.15 
 
 		 618 aa  253  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5731  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 		 834 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2618  Rhs element Vgr protein  32.65 
 
 		 618 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.576781 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1248  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1019 aa  253  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.60494  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  32.89 
 
 		 614 aa  252  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4492  type VI secretion system Vgr family protein  28.01 
 
 		 834 aa  252  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5128  Rhs element Vgr protein  28.01 
 
 		 834 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 661 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 661 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 661 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 661 aa  250  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  32.7 
 
 		 661 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  32.5 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  33.08 
 
 		 661 aa  248  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>