206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0054 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_0054  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 520 aa  1024    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.906913  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  49.87 
 
 		 425 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  50.64 
 
 		 425 aa  381  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.83 
 
 		 445 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  27.46 
 
 		 471 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.54 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.54 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.77 
 
 		 471 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  24.75 
 
 		 436 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.87 
 
 		 475 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2905  type I secretion outer membrane protein TolC family  26.02 
 
 		 469 aa  100  7e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.488456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  24.2 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.49 
 
 		 450 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2906  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.41 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.140715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2887  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.16 
 
 		 469 aa  99.8  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.415153  normal  0.13847 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  25.33 
 
 		 451 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.3 
 
 		 442 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.17 
 
 		 471 aa  97.8  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.62 
 
 		 636 aa  97.1  7e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3018  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.16 
 
 		 469 aa  97.1  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.384034 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.12 
 
 		 470 aa  96.7  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  25.89 
 
 		 445 aa  95.9  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.36 
 
 		 450 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  26.59 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  24.04 
 
 		 425 aa  94.7  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  25.58 
 
 		 469 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.18 
 
 		 470 aa  95.1  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.08 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.08 
 
 		 497 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5239  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.89 
 
 		 488 aa  94.7  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.35 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.47 
 
 		 472 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.35 
 
 		 473 aa  92.8  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.24 
 
 		 472 aa  92  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3120  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.68 
 
 		 467 aa  91.3  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.893346  normal  0.154573 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  23.38 
 
 		 423 aa  90.1  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  25.64 
 
 		 430 aa  89  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  21.93 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.05 
 
 		 456 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.83 
 
 		 472 aa  87.8  4e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.73 
 
 		 450 aa  87.8  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.3 
 
 		 457 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.69 
 
 		 633 aa  87.4  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 		 440 aa  87.4  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.52 
 
 		 468 aa  86.7  9e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  21.79 
 
 		 566 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  24.7 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  24.7 
 
 		 574 aa  85.1  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  22.3 
 
 		 559 aa  85.1  0.000000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.5 
 
 		 463 aa  81.3  0.00000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4602  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.68 
 
 		 444 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.72 
 
 		 440 aa  79.7  0.0000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.53 
 
 		 658 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.23 
 
 		 466 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.53 
 
 		 607 aa  77  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.11 
 
 		 491 aa  76.3  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.37 
 
 		 451 aa  76.3  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.19 
 
 		 451 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.75 
 
 		 518 aa  73.6  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.97 
 
 		 609 aa  73.2  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0375  Outer membrane protein-like  23.31 
 
 		 667 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.66 
 
 		 472 aa  72.4  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.32 
 
 		 471 aa  72.4  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.34 
 
 		 472 aa  71.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.47 
 
 		 463 aa  71.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5432  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.92 
 
 		 553 aa  71.2  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.199925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0844  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.62 
 
 		 478 aa  70.1  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.4 
 
 		 484 aa  70.5  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0829  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.62 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.461433 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  23.26 
 
 		 452 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.1 
 
 		 501 aa  69.7  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.76 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0805  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.62 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 		 478 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1453  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.17 
 
 		 480 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  30.26 
 
 		 492 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.88 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.64 
 
 		 452 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.53 
 
 		 524 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.39 
 
 		 494 aa  66.6  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.22 
 
 		 484 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0278  outer membrane efflux protein  23.48 
 
 		 421 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.73949  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.41 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4381  TolC family type I secretion outer membrane protein  25.71 
 
 		 477 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108825  normal  0.496475 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.45 
 
 		 489 aa  64.7  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.95 
 
 		 431 aa  64.7  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.8 
 
 		 444 aa  64.3  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2616  Type I secretion outer membrane protein, TolC  27.3 
 
 		 450 aa  63.5  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.930678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03674  putative outer membrane CHANEL lipoprotein  25.53 
 
 		 488 aa  62  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.119855 
 
 
-
 
NC_003296  RS05071  putative outer membrane efflux transmembrane protein  22.62 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.485043  normal  0.627641 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.47 
 
 		 467 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  20.73 
 
 		 522 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3318  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.68 
 
 		 470 aa  60.5  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.11 
 
 		 441 aa  60.5  0.00000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.37 
 
 		 450 aa  59.7  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.82 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1569  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.7 
 
 		 461 aa  58.9  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.151598  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3147  outer membrane efflux protein  23.76 
 
 		 495 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1798  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.77 
 
 		 538 aa  56.6  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.99988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>