More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1307 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1307  type I secretion outer membrane protein, TolC family  100 
 
 		 484 aa  986    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0310  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.37 
 
 		 607 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.89 
 
 		 658 aa  395  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3762  Type I secretion outer membrane protein, TolC  45.92 
 
 		 609 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.789361  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0784  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.03 
 
 		 491 aa  357  1.9999999999999998e-97  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.649029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1664  type I secretion outer membrane protein, TolC family  40.6 
 
 		 466 aa  353  4e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.623373  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2097  TolC family type I secretion outer membrane protein  45.27 
 
 		 633 aa  352  8e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  41.59 
 
 		 472 aa  350  4e-95  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1845  TolC family type I secretion outer membrane protein  42.08 
 
 		 471 aa  348  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000390204  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0706  Type I secretion outer membrane protein, TolC  44.11 
 
 		 636 aa  346  6e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0676668 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1880  outer membrane protein  43.58 
 
 		 492 aa  344  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0375089 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0633  type I secretion outer membrane protein, TolC family  38.48 
 
 		 484 aa  323  4e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00458641  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2659  TolC family type I secretion outer membrane protein  37.31 
 
 		 451 aa  300  3e-80  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3594  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.85 
 
 		 471 aa  244  3e-63  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4320  agglutination protein  33.48 
 
 		 471 aa  242  9e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1462  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.8 
 
 		 452 aa  239  9e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4101  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.47 
 
 		 472 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4007  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.47 
 
 		 472 aa  239  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3809  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.95 
 
 		 457 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0041623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4519  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.19 
 
 		 452 aa  236  7e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3985  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.01 
 
 		 473 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0381  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.44 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3645  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.44 
 
 		 471 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3908  type I secretion outer membrane protein, TolC family  34.01 
 
 		 473 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0379  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.58 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1392  TolC family type I secretion outer membrane protein  35.19 
 
 		 452 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0310  TolC family type I secretion outer membrane protein  32.44 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.952787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3261  type I secretion outer membrane protein, TolC  32.38 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.537181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0433  type I secretion outer membrane protein, TolC family protein  32.01 
 
 		 469 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462048  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4142  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.7 
 
 		 472 aa  229  1e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00647616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4025  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.86 
 
 		 452 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350176 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5061  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.39 
 
 		 445 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.447957 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0474  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.53 
 
 		 470 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0171025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1804  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.4 
 
 		 451 aa  224  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.894432  normal  0.601876 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0365  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.02 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0381  Type I secretion outer membrane protein, TolC  31.72 
 
 		 468 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.034849  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02379  hypothetical protein  31.97 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6073  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.02 
 
 		 457 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.523429 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6370  TolC family type I secretion outer membrane protein  34.02 
 
 		 456 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.668018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003403  agglutination protein  30.89 
 
 		 436 aa  217  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000998881  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0204  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.35 
 
 		 441 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5970  Type I secretion outer membrane protein, TolC  34.2 
 
 		 442 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001579  agglutination protein  30.71 
 
 		 437 aa  213  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.582339  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1214  type I secretion outer membrane protein, TolC family  31.46 
 
 		 450 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.227292  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1228  agglutination protein  30.75 
 
 		 445 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000902456  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02372  hypothetical protein  30.86 
 
 		 425 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0134  Type I secretion outer membrane protein, TolC  32.52 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.675891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003406  agglutination protein  30.48 
 
 		 423 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3061  type I secretion outer membrane protein, TolC family  30.52 
 
 		 450 aa  204  4e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0019  outer membrane efflux protein  29.21 
 
 		 440 aa  196  8.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4322  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.19 
 
 		 501 aa  196  9e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.811491  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0858  hypothetical protein  28.57 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4205  TolC family type I secretion outer membrane protein  30.37 
 
 		 431 aa  187  5e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.668787  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0889  hypothetical protein  27.97 
 
 		 574 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1293  Poly(R)-hydroxyalkanoic acid synthase, class I  31.42 
 
 		 430 aa  181  2e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.987047 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0562  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.97 
 
 		 450 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0010  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.44 
 
 		 443 aa  169  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.444301  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0790  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.09 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.000000109355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1415  Type I secretion outer membrane protein, TolC  28.95 
 
 		 472 aa  158  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000596226  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1878  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.5 
 
 		 475 aa  157  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.660542  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1494  type I secretion outer membrane protein, TolC family  27.66 
 
 		 450 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1633  Type I secretion outer membrane protein, TolC  29.2 
 
 		 519 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.181955  normal  0.716054 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1875  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.3 
 
 		 476 aa  154  5e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1978  TolC family type I secretion outer membrane protein  28.6 
 
 		 456 aa  153  7e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.143142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0888  ComEC/Rec2 family protein  24.1 
 
 		 559 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00289662  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0634  type I secretion outer membrane protein, TolC family  28.8 
 
 		 467 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000541353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0546  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.59 
 
 		 444 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0160  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  22.94 
 
 		 566 aa  142  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.213741  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  29.33 
 
 		 464 aa  140  7e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2241  Type I secretion outer membrane protein, TolC  25.76 
 
 		 524 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.417493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2577  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.29 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00589159 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1826  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26 
 
 		 487 aa  128  3e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2568  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.98 
 
 		 464 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3945  putative outer membrane protein tolC precursor  25.18 
 
 		 461 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.8738  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1434  type I secretion outer membrane protein, TolC  24.71 
 
 		 490 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.44207  normal  0.675589 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2894  Type I secretion outer membrane protein, TolC  24.65 
 
 		 460 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2851  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.38 
 
 		 463 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2686  Outer membrane secretion protein  26.2 
 
 		 472 aa  115  2.0000000000000002e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.553025  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1149  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.34 
 
 		 456 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.435165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  25.94 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5878  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.63 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.539647  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  25.94 
 
 		 456 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2013  type I secretion outer membrane protein, TolC family  26.34 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226354  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4235  TolC family type I secretion outer membrane protein  26.27 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.902691  normal  0.529157 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  25.43 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2243  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.45 
 
 		 455 aa  99  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3453  putative tolC outer membrane protein  25.37 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.341393 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1907  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.67 
 
 		 472 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3231  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.35 
 
 		 483 aa  97.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0823  Outer membrane efflux protein  22.79 
 
 		 432 aa  96.7  8e-19  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0383439  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3558  Type I secretion outer membrane protein, TolC  26.28 
 
 		 472 aa  95.9  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.445028  normal  0.560368 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3411  hypothetical protein  26.74 
 
 		 425 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.527264  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0580  putative outer membrane transport protein  24.59 
 
 		 451 aa  94  5e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1096  TolC family type I secretion outer membrane protein  27.21 
 
 		 494 aa  94  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.739146 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0652  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.86 
 
 		 428 aa  93.6  7e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000458305  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1725  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.66 
 
 		 489 aa  93.6  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.736299  normal  0.0102072 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40250  putative outer membrane protein precursor  25.96 
 
 		 425 aa  93.6  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.311034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5161  type I secretion outer membrane protein, TolC family  24.03 
 
 		 488 aa  92.8  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.451764  normal  0.264948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4696  TolC family type I secretion outer membrane protein  24.03 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1690  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.7 
 
 		 478 aa  91.3  3e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.522729 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>